在ubuntu18.04上安裝NAMD_2.13。
按著官網的提示，下載了NAMD_2.13_Source.tar.gz。解壓之后開始安裝，都很順利，直到最后編譯的時候出現了問題。
因為要使用cuda加速，所以在編譯Charm ++的時候就選擇了 單節點多核版：執行代碼如下：
cd charm-6.8.2
./build charm++ multicore-linux-x86_64 --with-production
cd multicore-linux-x86_64/tests/charm++/megatest
make pgm
./pgm +p4 (multicore does not support multiple nodes)
然后編譯NAMD的時候，也是選擇的單節點多核，執行如下：
先是執行
./config Linux-x86_64-g ++ --charm-arch multicore-linux-x86_64 --with-cuda --cuda-prefix/usr/local/cuda
但是失敗 ，去掉 --cuda-prefix/usr/local/cuda 后成功
即執行：./config Linux-x86_64-g ++ --charm-arch multicore-linux-x86_64 --with-cuda
成功
最后一次執行
cd Linux-x86_64-g ++
make
編譯到一半失敗，提示如下圖：cuda的環境變數都已經設定，不知道這個是什么意思，它顯示的位置在第二張圖片。我之前成功安裝過gromacs 也加入了cuda選項之后編譯成功，所以感覺我的cuda10-2應該沒有問題。求教大家是什么原因。麻煩大家了謝謝啦。
uj5u.com熱心網友回復：
請問樓主解決了嗎？我也是編譯遇到了類似的問題轉載請註明出處，本文鏈接：https://www.uj5u.com/caozuo/268255.html
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