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考慮每個可能的對,洗掉NaN條目并獲得線性回歸

2022-01-01 05:00:10 作業系統

我是第一次使用 Python,所以我幾乎沒有困難。

我有一個包含 6 列和 20 行的 csv 資料檔案,一些條目是“NaN”。我想要做的是一種互動,將考慮第一列與其他列(A 與 B、C、D、E 和 F),然后是第二列與所有其他列(B 與 C、D、E 和F) 等(即比較 6 列中的每一對可能的對),對于每對洗掉 NaN 條目(因此每對最終對的行數將不同)并計算線性回歸。

我可以通過“手動”考慮每一對來獲得我正在尋找的結果,但是由于我有很多 DataFrame 必須執行此程序,因此需要花費很多時間,所以我我希望有人能用更快的方法幫助我。

我的部分資料:

| A      | B      | C       | D    | E             | F            |

| 70.385 | 1316.0 | NaN     | 1.84 | 1.021059e 37  | 1.284026e 41 |

| 13.183 | 800.0  | 11549.0 | 1.66 | 4.710032e 35  | Nan          |

| 9.750  | NaN    | NaN     | 1.55 |  1.437108e 36 | 5.070657e 40 |

| 12.302 | NaN    | 547.7   | 1.56 | 2.149507e 36  | 2.294859e 40 |

| NaN    | 2784.2 | 29984.4 | 1.87 | NaN           | 2.294859e 40 |

我能做的是:

import pandas as pd
from scipy.stats import linregress

df=data1.dropna(subset=['A','B']) 
lr_AB=linregress(df['A'],df['B'])

我試圖獲得的是:每對的 LinregressResult(slope= ,intercept=, rvalue=, pvalue=, stderr=) 。那么,如何為每對可能的列迭代這兩個命令?

我的嘗試是這樣的,但沒有太多結果:

for i in range(len(data1.columns)-1):
    if data1.iloc[:, :] is 'NaN':
        df= data1.dropna()
        print(df)
        lr= linregress(df.iloc[:, i], df.iloc[:, i 1])
    else:
        print('no nan') 
        lr1= linregress(data1.iloc[:, i], data1.iloc[:, i 1])

太感謝了。

uj5u.com熱心網友回復:

假設您想使用scipy.stats's linregress,這里有一種方法可以做到這一點。并不比您的代碼效率高多少,因為它還會遍歷列的組合:

from scipy.stats import linregress
from itertools import combinations

for a, b in combinations(df, 2):
    ab = df[[a, b]].dropna()
    lr[(a, b)] = dict(zip(
        'slope intercept r_value p_value std_err'.split(),
        linregress(ab[a], ab[b])
    ))
    lr[(a, b)]['n_points'] = ab.shape[0]

result = pd.DataFrame(lr).T

在您的示例資料上運行示例 -

>>> result
            slope     intercept   r_value   p_value       std_err  n_points
A B  9.020664e 00  6.810806e 02  1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
  C  1.248729e 04 -1.530709e 05  1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
  D  4.316155e-03  1.538532e 00  0.942012  0.057988  1.087230e-03       4.0
  E  1.503028e 35 -4.016931e 35  0.984424  0.015576  1.898085e 34       4.0
B C  9.291100e 00  4.116120e 03  1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
  D  8.706011e-05  1.647796e 00  0.789115  0.421079  6.776741e-05       3.0
  E  1.887517e 34 -1.462913e 37  1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
C D  1.061987e-05  1.547701e 00  0.998360  0.036468  6.090086e-07       3.0
  E -1.525732e 32  2.233071e 36 -1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
D E  2.896150e 37 -4.429182e 37  0.869114  0.130886  1.165450e 37       4.0
A F  1.525539e 39  2.034718e 40  0.957112  0.187122  4.617784e 38       3.0
B F -7.182537e 37  2.229248e 41 -1.000000  0.000000  0.000000e 00       2.0
C F  0.000000e 00  2.294859e 40  0.000000  1.000000  0.000000e 00       2.0
D F  1.097658e 41 -1.308991e 41  0.382452  0.617548  1.875151e 41       4.0
E F  1.061306e 04  1.854240e 40  0.946081  0.210009  3.633822e 03       3.0

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