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如何創建空Pandas系列并將其與其他系列合并

2022-02-20 09:54:03 作業系統

嘗試將 pandas 系列合并在一起時遇到一個小問題,感謝您的幫助。

我有一個包含 30M 行的大檔案。我無法將所有資料都保存在記憶體中,因此我在 pandas.read_csv 方法中使用了選項 chunksize。

這是我必須決議的檔案的示例。它代表用戶對應用程式內某些模塊的訪問。我用 x 替換了時間,因為在這種情況下它并不重要。我們有關于每個用戶 (user_id)、他們訪問的時間和模塊 (module_id) 的資料。

user_id;time;module_id
1;x;101
1;x;101
1;x;102
1;x;102
2;x;102
2;x;102
2;x;103

我的任務是瀏覽整個檔案并找出每個用戶訪問每個模塊的次數。我還有另一個資料框(df),其中包含有關每個用戶的資訊。df 的索引是 user_id。

這是我到目前為止的代碼

logs = pd.read_csv(... , chunksize=50000, index_col=user_id)
module_accesses = pd.Series(index = df.index, dtype='object', name=module_id)

for log in logs:
     module_accesses = process(log, module_accesses)

def process(log, module_accesses):
     # Edit: the line below was added
     log[module_id] = log[description].apply(getModuleIdFromDescription)    
     groups = log.groupby([user_id, module_id]).size()
     new_groups = module_accesses   groups 
     return new_groups 

當我初始化module_accesses時,它看起來像這樣:

user_id
440250    NaN
428394    NaN
         ... 
746792    NaN
746794    NaN

變數groups看起來像這樣

user_id     module_id
592844      272         2
            1711        2
            6707        1
594073      326         1
            3094        1
                       ..
649479      288         9
            2302        9
            2312        1
651921      251         2
            948         1

但是,當我這樣做時new_groups = module_accesses groups,變數new_groups具有此值。

592844      272         NaN
            1711        NaN
            6707        NaN
594073      326         NaN
            3094        NaN
                       ... 
649479      288         NaN
            2302        NaN
            2312        NaN
651921      251         NaN
            948         NaN

我希望能夠遍歷每個塊并更新 Serie module_accesses每個人的訪問次數user_id / module_id應該增加,最后我應該有每個用戶和每個模塊的訪問總數。預期的結果將類似于變數groups,但適用于整個檔案。我們有很多用戶(350k)和模塊(100k)。此外,大多數用戶只能訪問 10-20 個模塊。預期結果示例:

user_id     module_id
592844      272         27389
            1711        103827
            6707        194625
594073      326         2846
            3094        103826
                       ..
649479      288         1023
            2302        2038
            2312        12344
651921      251         829
            948         302

uj5u.com熱心網友回復:

我認為您需要module_accesses成為pd.DataFramme,因為您需要跟蹤“每個用戶對模塊的訪問次數”:

module_accesses = pd.DataFrame([], columns=["user_id", "module_id", "n"])

也就是說,我將迭代地合并module_accesses(當前已知訪問)和groups(要注冊的新訪問),然后將訪問次數加入列:

# Slight modification to name the size column "n"
groups = log.groupby(["user_id", "module_id"]).size().to_frame("n")

# Merge known and new accesses
new_groups = pd.merge(module_accesses, groups, how="outer", on=["user_id", "module_id"])
# Combine both counts into a single count
new_groups["n"] = new_groups.pop("n_x").fillna(0)   new_groups.pop("n_y").fillna(0)

的結果定義process

def process(log, module_accesses):
    groups = log.groupby(["user_id", "module_id"]).size().to_frame("n")
    new_groups = pd.merge(module_accesses, groups, how="outer", on=["user_id", "module_id"])
    new_groups["n"] = new_groups.pop("n_x").fillna(0)   new_groups.pop("n_y").fillna(0)
    return new_groups 

另一個想法:

  1. 使用程序回傳groups(不計算new_groups
  2. 在資料幀串列中累積輸出
  3. 用于pd.concat創建單個大資料框
  4. 用于groupby將大資料框縮減為您預期的格式

uj5u.com熱心網友回復:

問題:

  1. 兩個的求和操作pd.Series是逐個索引進行的,顯然你module_accessesgroups不共享同一組索引,因此它不會像你預期的那樣求和。

  2. 即使您確保它們具有相同的索引集,將一個數字與 np.nan 相加也會給您一個 np.nan。因此,您可能希望將 module_accesses 初始化為零而不是 NaN。

但是,您可以從另一種方式解決這個問題,因為您有資料集的每個塊的計數,您可以將它們簡單地存盤到一個串列中,并將它們全部連接成一個更大的計數系列,然后您可以groupby再次和簡單地將計數相加。

pd.concat([
    log.assign(module_id=log['description'].apply(getModuleIdFromDescription))\
        .groupby(['user_id', 'module_id'])\
        .size().rename('count')
    for log in logs
]).reset_index().groupby(['user_id', 'module_id'])['count'].sum()

請注意,通過這種方式,您將不會看到在任何模塊中都沒有任何計數的 user_id。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/caozuo/428705.html

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