如何從目錄中讀取.tif樣式的影像

我正在嘗試運行以下代碼來分析多個不同目錄中的多個 .tif 影像。運行代碼時，給出的數字是空白的，然后是第 49 行的錯誤“必須為壓縮腐蝕提供 M”。我首先意識到我在代碼中將 .tif 拼寫為 .tiff，然后我對其進行了更改。然后我決定通過創建一個 Tiff 物件并將影像路徑包裝在 tiff 物件中來讀取一個 .tif 影像。控制臺報錯，說檔案無法打開。

代碼

%% Import Spheroid Directory
Path = 'C:\Users\18606\OneDrive\Documents\Spheroids For Brandon\Spheroids For Brandon\1-8WT';
if ~isfolder(Path)
    errorMsg = sprintf('Error: The following folder does not exist:\n%s',Path);
    uiwait(warndlg(errorMsg));
    return;
end
%% Iterate over each subfolder with .tiff images
Content = fullfile(Path, '*.tif'); % Read Experiment directory with .tiff images
subFold = dir(Content);
imageFiles = [];                    % Create empty list array 
for k = 1:length(subFold)
    F = fullfile(Path, subFold(k).name); % For k subfolders, output the full file name and open each subfolder
    fileID = fopen(F);
    imageFiles{end 1} = fopen(fileID,'%s\n'); % Append fileID to imageFiles list
    fclose(fileID);
end
disp(imageFiles(k))                           % Display the image files for analysis

%% Image preprocessing

%Divide image "obj" into its respective RGB intensities
red = imageFiles(:,:,1);
green = imageFiles(:,:,1);
blue = imageFiles(:,:,1);
figure(1)
subplot(2,2,1); imshow(imageFiles); title('Original Image')
subplot(2,2,2); imshow(imageFiles); title('Red Plane')
subplot(2,2,3); imshow(imageFiles); title('Green Plane');
subplot(2,2,4); imshow(imageFiles); title('Blue Plane');

%Threshold the blue plane
figure(2)
level = 0.37;
bw2 = imbinarize(blue, level);
subplot(2,2,1); imshow(bw2); title('Blue plane threshold');

%% Image preprocessing continued

fill = imfill(bw2,'holes');
subplot(2,2,2); imshow(fill); title('Holes filled')

%Remove any blobs on border of image
clear = imclearborder(fill);
subplot(2,2,3); imshow(clear); title('Blobs removed');

%Remove blobs smaller than 7 pixels across
se = strel('disk',7);
open = imopen(fill, se);
subplot(2,2,4); imshow(open); title('Removed small blobs');

%% Measure the number of pixels in Image
%numberOfPixels = numel(inputFile);
%[pixelCounts, grayLevels] = imhist(inputFile);
%numberofPixels = sum(pixelCounts);

%% Measure the distance of migration in micromolars

diameter = regionprops(open, 'MajorAxisLength');

%Show result
figure(3)
imshow(imageFiles)
d = imdistline; %Includes a line to physically measure the object

錯誤資訊

>> RawData
Error using images.internal.morphop>ParseInputs
M must be provided for packed erosion.

Error in images.internal.morphop (line 23)
 unpacked_M,mex_method] = ParseInputs(varargin{:});

Error in imerode (line 87)
    B = images.internal.morphop(A,se,'erode',mfilename,varargin{:});

Error in imopen (line 73)
    outputImage = imdilate(imerode(inputImage,se,'ispacked',M),se,'ispacked',M);

Error in RawData (line 49)
open = imopen(fill, se);
 

我有一種預感，檔案路徑被錯誤地讀取，但程式正在讀取一些東西，否則它會拋出代碼中指定的錯誤。我很感激我能在這件事上得到任何幫助。

uj5u.com熱心網友回復：

您的代碼中有很多沒有意義的東西。

    fileID = fopen(F);
    imageFiles{end 1} = fopen(fileID,'%s\n'); % Append fileID to imageFiles list

這將打開檔案，然后將其檔案名放入imageFiles{end 1}. 這和剛才做的一樣imageFiles{end 1} = F，但是更混亂。

稍后，您可以像使用imageFiles影像一樣使用它：

red = imageFiles(:,:,1);

但它不是影像，它是具有一組檔案的名稱（帶路徑）的元胞陣列！

imshow(imageFiles)將加載該陣列中的影像，并將它們顯示給您。但除此之外，您永遠不會加載影像，因此您所做的所有計算都是在檔案名稱而不是像素資料上進行的。

你想用來imread加載像素資料。不要fopen檔案，只有imread它們。

標籤：matlab 图像处理

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