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如何在具有不同長度串列列的熊貓資料幀上使用numpy的廣播功能

2022-11-15 04:03:21 作業系統

我正在嘗試在我的大資料上使用 numpy 的廣播功能。我的串列列可以在許多行中包含數百個元素。我需要根據串列列中列值的存在來過濾行。如果 number incol_a存在于 中col_b,我需要對該行進行過濾。

樣本資料:

import pandas as pd
import numpy as np
dt = pd.DataFrame({'id' : ['a', 'a', 'a', 'b', 'b'],
                   'col_a': [[1],[2],[5],[1],[2]],
                   'col_b': [[2],[2,4],[2,5,7],[4],[3,2]],
                   })
dt

    id  col_a   col_b
0   a   [1]     [2]
1   a   [2]     [2, 4]
2   a   [5]     [2, 5, 7]
3   b   [1]     [4]
4   b   [2]     [3, 2]

我嘗試了下面的代碼來添加維度col_b并檢查該值是否存在于col_a

(dt['col_a'] == dt['col_b'][:,None]).any(axis = 1)

但我得到以下錯誤:

ValueError: ('Shapes must match', (5,), (5, 1))

有人可以讓我知道什么是正確的方法。

uj5u.com熱心網友回復:

import pandas as pd
import numpy as np
from itertools import product

根據逗號決議列:

dt2 = pd.DataFrame([j for i in dt.values for j in product(*i)], columns=dt.columns)

過濾到 col_a 等于 col_b 的地方:

dt2 = dt2[dt2['col_a'] == dt2['col_b']]

結果是:

如何在具有不同長度串列列的熊貓資料幀上使用 numpy 的廣播功能

uj5u.com熱心網友回復:

我想您已經被告知numpy“矢量化”是加速代碼的關鍵,但您并沒有很好地理解它是什么。您可以將其應用于任何pandas任務并不是什么神奇的事情。它只是充分利用numpy陣列方法的“速記”,也就是說,實際學習numpy.

但是,讓我們探討一下您的任務:

    In [205]: dt = pd.DataFrame({'id' : ['a', 'a', 'a', 'b', 'b'],
         ...:                    'col_a': [[1],[2],[5],[1],[2]],
         ...:                    'col_b': [[2],[2,4],[2,5,7],[4],[3,2]],
         ...:                    })
    In [206]: dt
    Out[206]: 
      id col_a      col_b
    0  a   [1]        [2]
    1  a   [2]     [2, 4]
    2  a   [5]  [2, 5, 7]
    3  b   [1]        [4]
    4  b   [2]     [3, 2]
    
    In [207]: dt.dtypes
    Out[207]: 
    id       object
    col_a    object
    col_b    object
    dtype: object
    

因為列包含串列,所以它們dtype是物件;他們有對串列的參考。

在列上做事==,pandasSeries與用它們的值陣列做事是不一樣的。

但要關注 numpy 方面,讓我們獲取 numpy 陣列:

    In [208]: a = dt['col_a'].to_numpy()    
    In [209]: b = dt['col_b'].to_numpy()    
    In [210]: a
    Out[210]: 
    array([list([1]), list([2]), list([5]), list([1]), list([2])],
          dtype=object)    
    In [211]: b
    Out[211]: 
    array([list([2]), list([2, 4]), list([2, 5, 7]), list([4]), list([3, 2])],
          dtype=object)

快速numpy操作使用編譯代碼,并且在大多數情況下,僅適用于數字資料型別。像這樣的陣列,包含對串列的參考,基本上與串列相同。數學和其他運算(如相等)以串列理解速度運行。這可能比 pandas 速度更快,但與高度吹噓的“矢量化”numpy 速度不同。

因此,讓我們對這些串列的元素進行串列理解。這很像 pandas apply,盡管我認為它更快(眾所周知,pandas apply 很慢)。

    In [212]: [i in j for i,j in zip(a,b)]
    Out[212]: [False, False, False, False, False]
    

糟糕,不匹配 - 一定是因為ifroma是一個串列。讓我們提取該數字:

    In [213]: [i[0] in j for i,j in zip(a,b)]
    Out[213]: [False, True, True, False, True]

讓 col_a 包含串列而不是數字對你沒有幫助。

由于ab是陣列,我們可以使用==, 但本質上與 [212] 相同的操作(timeit 稍微好一點):

    In [214]: a==b
    Out[214]: array([False, False, False, False, False])
    

我們可以組成b一個 (5,1) 陣列,但為什么呢?

    In [215]: b[:,None]
    Out[215]: 
    array([[list([2])],
           [list([2, 4])],
           [list([2, 5, 7])],
           [list([4])],
           [list([3, 2])]], dtype=object)

我認為您試圖模仿這樣的陣列比較,針對 (3,1) 廣播 (5,) 以生成 (3,5) 真值表:

    In [216]: x = np.arange(5); y = np.array([3,5,1])    
    In [217]: x==y[:,None]
    Out[217]: 
    array([[False, False, False,  True, False],
           [False, False, False, False, False],
           [False,  True, False, False, False]])
    
    In [218]: (x==y[:,None]).any(axis=1)
    Out[218]: array([ True, False,  True])
    

isin可以做同樣的比較:

    In [219]: np.isin(x,y)
    Out[219]: array([False,  True, False,  True, False])    
    In [220]: np.isin(y,x)
    Out[220]: array([ True, False,  True])

雖然這適用于數字,但不適用于串列陣列,尤其是您想要a針對b. 您沒有a針對所有b.

由于中的串列a大小相同,我們可以將它們連接成一個數字陣列:

    In [225]: np.hstack(a)
    Out[225]: array([1, 2, 5, 1, 2])

我們不能這樣做,b因為串列非常大。作為一般規則,當您有大小不同的串列(或陣列)時,您無法進行快速數字numpy數學和比較。

我們可以a針對 (5,1)測驗 (5,) b,生成 (5,5) 真值表:

In [227]: a==b[:,None]
Out[227]: 
array([[False,  True, False, False,  True],
       [False, False, False, False, False],
       [False, False, False, False, False],
       [False, False, False, False, False],
       [False, False, False, False, False]])

但那是True針對第一行的幾個單元格;這就是list([2])fromba.

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/caozuo/533462.html

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