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資料的存盤結構淺析LSM-Tree和B-tree

2020-10-14 10:17:26 後端開發

目錄
  • 順序存盤與哈希索引
  • SSTable和LSM tree
  • B-Tree
  • 存盤結構的比對
  • 小結

本篇主要討論的是不同存盤結構(主要是LSM-tree和B-tree),它們應對的不同場景,所采用的底層存盤結構,以及對應用以提升效率的索引,

所謂資料庫,最基礎的功能,就是保存資料,并且在需要的時候可以方便地檢索到需要的資料,在這個基礎上,演化出了不同的資料庫系統,以及多種索引機制幫助檢索資料,這篇我們就來討論幾種常見的資料存盤和索引機制,主要是B-tree,LSM-Tree,以及它們對應的優缺點,

順序存盤與哈希索引

試想一下,如果按照保存資料,并且在需要的時候可以方便地檢索到需要的資料這一標準,設計一個簡單的資料庫,那么最簡單的做法應該怎么做呢?

最簡單的做法,就是通過順序保存資料到一個日志檔案中,然后通過索引,這里以哈希索引為例(比如java的hashMap),記錄每條資料的key以及對應的位移,將其保存到記憶體中,避免隨機檢索巨大的開銷,值得注意的是,引入索引,雖然會顯著提高查詢效率,但會略微降低寫入速度,因為每次寫入的時候都需要額外寫入到哈希索引中,這一點對大部分索引都是適用的,

哈希索引

上圖為哈希索引示例,下面是順序存盤在磁盤上是日志資料,上面的記憶體中的哈希索引,哈希索引是很多復雜索引的基礎,比如在mysql中就有提供哈希索引的選項,當然哈希索引并不常用,因為它最基礎,同時也意味著它最容易被優化,

上述形式的順序存盤+哈希索引中,增加資料和查找資料相對容易理解,而修改資料則可以通過將新資料追加到檔案尾部,重新生成索引實作,洗掉操作則可以給與哈希索引一個識別符號實作(如對應key置為-1),

但這樣有一個問題,可能會出現磁盤耗盡的情況,針對這一個問題,我們可以將日志檔案拆分成多個一定大小的檔案段(這里的檔案段可以理解為接受統一管理的資料檔案),當一個檔案段達到一定大小,比如4kb的時候,就關閉它,新建一個檔案段,而舊的檔案段可以進行壓縮,前面提到過,洗掉和修改都是通過追加日志相同的key-value實作的,那么早先的資料其實就已經沒用的,所以壓縮的時候只保留最新的key資料,壓縮到程序如下面這張圖所示:

壓縮資料

圖中上面的部分就是順序存盤的資料,可以發現其中有很多的key都是相同的,這是因為順序存盤情況下,修改資料就是不斷新寫入相同的key,這種情況我們要的只有相同key的最新的value,所以壓縮程序也是一個清理磁盤的程序,

壓縮合并程序可以由后臺進行默默進行,所以不必擔心這個程序影響查詢性能,上圖中只有一個資料檔案段,但實際上可以有多個檔案段,多個檔案段也可以合并(類似于Hbase中多個檔案的merge操作),

當然這樣的優化可以極大程度節省空間,但必不可少得會給檢索帶來時間上的損耗,在多個檔案段的情況,每個檔案段都有自己的哈希索引,故而要查找資料會首先根據key查找記憶體中最新檔案段的哈希索引,如果找不到,那么找次新檔案段的哈希索引,接著找次新的哈希索引,直到遍歷所有檔案段的哈希索引,

綜上,順序存盤+哈希索引優點明顯,簡單,高效,缺點是哈希索引需全部存到記憶體(如果將哈希索引放到磁盤那相當于放棄了檢索的高效),并且難以實作區域查詢

為了解決它的這些問題,我們可以將哈希索引做一些小小的改變,具體來說,就是讓檔案段的資料,按key進行排序存盤,這樣會帶來哪些改變呢?

SSTable和LSM tree

將資料檔案段中的資料按key進行排序,并且保證相同的key只出現一次(在壓縮的時候保證),這種格式就稱之為排序字串表,簡稱SStable(Sorted String Table),

將資料按Key進行排序后有以下幾個好處:

  1. 合并更加簡單高效,即使資料檔案段大于記憶體,也可以使用類似歸并排序演算法進行資料段的壓縮,即將一個大檔案拆成多個小資料進行壓縮,如果多個檔案段中有相同的key,那么以最新的檔案段的key為準,
  2. 緩解哈希索引需要整個hashMap存盤到記憶體的窘境,因為key是排序的,所以可以在記憶體中維持一個稀疏索引,存盤每個key的范圍,具體見下圖,并且這個稀疏索引所需的記憶體空間是很小的,

稀疏索引與SStable

通過稍微改變一下檔案段的結果,就獲得如此多的好處,但還有一個問題,前面的哈希索引是基于順序存盤的日志檔案的,要讓SStable按key排序,那就不能順序存盤磁盤了呀(即無法存盤的時候立即寫入磁盤)!!的確是這樣,雖然也可以使用類似B-tree來實作磁盤上的排序存盤,但轉換下思路,其實將資料先保存在記憶體中其實更加方便

具體實作流程,是在記憶體中維護一個類似TreeMap的資料結構用于存盤資料(TreeMap底層是基于紅黑樹對存盤的key進行排序的,無論我們按照什么樣的順序存盤資料,TreeMap總是會將資料按照key進行排序),這個TreeMap稱為記憶體表,當記憶體表超過一定閾值的時候,就將其寫入到磁盤中,成為SStable,因為已經排好序,所以寫入的效率其實比想象的要高,后期再對磁盤中的SStable進行壓縮與合并操作,

當需要根據key檢索的時候,會先去記憶體表中檢索,找不到再去最新的SStable,再去次新的SStable,直到遍歷完全部,

上述這種索引結構被稱為之LSM-Tree,全稱是Log-Structured Merge-Tree,即日志合并樹,而這種基于合并和壓縮檔案原理的存盤引擎被稱為LSM存盤引擎,其中比較為人所知的是Hbase,

B-Tree

最后,我們再來討論流傳最久的資料庫村粗結構,與LSM-Tree這幾年才逐漸為人所知不同,B-tree存盤結構擔得起經久不衰這四個字,

B-tree本身是一種樹形的資料結構,更具體點說是一顆平衡查找樹,它也是通過存盤順序的key存盤資料(這一點和SStable有相似之處),不同于前面的LSM-tree的檔案段,B-tree將資料庫分解成固定大小的塊或頁,通常一個頁大小是4kb,這種分配方法更加貼合底層的磁盤,

當需要進行查找的時候,總是從根開始,根據范圍跳轉到對應的key,而其對應的value可以是值本身,也可以是指向存盤對應資料的磁盤地址,下圖是一個具體的例子:

B-tree

而在更新或插入的時候,有可能會出現沒有足夠空間來容納新key的問題,這時候就會發生分裂,分裂操作是比較危險的,在分裂的時候如果資料庫崩潰,可能會導致索引被破壞,為了防止這個問題,可以引入預寫日志(write-ahead log,WAL)機制,mysql的binlog就是這樣的東西,具體說就是在執行操作的時候,將此次操作寫入一個只允許追加的檔案中,這樣一來當崩潰的時候就可以檢查日志并進行恢復,

存盤結構的比對

從使用的角度上來說,B-tree等索引存盤結構多用于OLTP型的資料庫,因為這類資料庫主要以事務,或是行級別的讀取和存盤為主的(比如Mysql),換句話說,這種型別的資料庫更多的操作是小批量或單行級別的更新或讀取,并且可能還有事務方面的需求,這種型別正是B-tree結構所擅長的,

而 LSM-tree則多用于大規模資料情況下的檢索分析和快速寫入的情況,在寫入的性能上,因為上直接寫入記憶體再定期刷入到磁盤中,所以寫入操作對用戶的感知而言上非常迅速的,而檢索速度也因為key順序存盤,可以快速定位到key對應的位置,因而具有較好的檢索性能,

但是LSM-tree比較顯著的應用方向還是在大規模分析這方面,在大規模分析(OLAP)場景下,資料通常都是列式存盤,并且需要全表掃描,其中磁盤資料可以使用二進制進行壓縮,讀取的時候可以有效減少磁盤IO的處理時間(與之相比,B-tree等存盤結構就無法充分壓縮,因為每次都只處理小部分資料),同時在存盤檔案中還能再進一步切分,比如將列式資料按照水平切分成不同的Page,同時存盤一些簡單的索引,用來指定不同Page大概范圍,Hadoop的存盤資料格式Parquet就是類似的設計,

小結

本篇主要討論了幾種基礎的存盤結構和索引以及其對應使用場景,限于篇幅,更多索引的變種無法多加討論,比如B-tree的優化版B+tree,多列索引等,

其實大部分資料庫或者說存盤引擎,都是針對不同的場景下,在舊有的基礎上進行一定程度的微改造創新,但大體的結構依舊是以上述兩三種為準,了解了上述幾種結構,對資料存盤方面應該能夠有一個感性的認知了,

此外本章多參考自《DDIA》第三章節,對分布式系統感興趣的童鞋可以看看此書,肯定不會失望的,

以上~

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