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一次介面超時排查,花費了我兩個星期。。

2021-09-27 14:04:17 後端開發

來源:https://zhenbianshu.github.io/

接著上次的排查,最近在查一個問題,花費了近兩個星期,我一定要總結一下,今天繼續,

Jdk 的 native 方法當然不是終點,雖然發現 Jdk、docker、作業系統 Bug 的可能性極小,但再往底層查卻很可能發現一些常見的配置錯誤,

為了便于復現,我用 JMH 寫了一個簡單的 demo,控制速度不斷地通過 log4j2 寫入日志,將專案打包成 jar 包,就可以很方便地在各處運行了,

@BenchmarkMode(Mode.AverageTime)
@OutputTimeUnit(TimeUnit.MICROSECONDS)
@State(Scope.Benchmark)
@Threads(5)
public class LoggerRunner {
    public static void main(String[] args) throws RunnerException {

        Options options = new OptionsBuilder()
                .include(LoggerRunner.class.getName())
                .warmupIterations(2)
                .forks(1)
                .measurementIterations(1000)
                .build();
        new Runner(options).run();
    }
}

我比較懷疑是 docker 的原因,但是在 docker 內外運行了 jar 包卻發現都能很簡單地復現日志停頓問題,而 jdk 版本眾多,我準備首先排查作業系統配置問題,

系統呼叫


strace 命令很早就使用過,不久前還用它分析過 shell 腳本執行慢的問題( 解決問題,別擴展問題),但我還是不太習慣把 Java 和它聯系起來,幸好有部門的老司機指點,于是就使用 strace 分析了一波 Java 應用,

命令跟分析普通腳本一樣, strace -T -ttt -f -o strace.log java -jar log.jar, -T 選項可以將每一個系統呼叫的耗時列印到系統呼叫的結尾,當然排查時使用 -p pid 附加到 tomcat 上也是可以的,雖然會有很多容易混淆的系統呼叫,

對比 jmh 壓測用例輸出的 log4j2.info() 方法耗時,發現了下圖中的狀況,

一次 write 系統呼叫竟然消耗了 147ms,很明顯地,問題出在 write 系統呼叫上,

檔案系統


結構

這時候就要好好回想一下作業系統的知識了,

在 linux 系統中,萬物皆檔案,而為了給不同的介質提供一種抽象的介面,在應用層和系統層之間,抽象了一個虛擬檔案系統層(virtual file system, VFS),上層的應用程式通過 系統呼叫 system call 操作虛擬檔案系統,進而反饋到下層的硬體層,

由于硬碟等介質操作速度與記憶體不在同一個數量級上,為了平衡兩者之間的速度,linux 便把檔案映射到記憶體中,將硬碟單位塊(block)對應到記憶體中的一個 頁(page)上,這樣,當需要操作檔案時,直接操作記憶體就可以了,當緩沖區操作達到一定量或到達一定的時間后,再將變更統一刷到磁盤上,這樣便有效地減少了磁盤操作,應用也不必等待硬碟操作結束,回應速度得到了提升,

而 write 系統呼叫會將資料寫到記憶體中的 page cache,將 page 標記為 臟頁(dirty) 后回傳,

linux 的 writeback 機制

對于將記憶體緩沖區的內容刷到磁盤上,則有兩種方式:

首先,應用程式在呼叫 write 系統呼叫寫入資料時,如果發現 page cache 的使用量大于了設定的大小,便會主動將記憶體中的臟頁刷到硬碟上,在此期間,所有的 write 系統呼叫都會被阻塞,

系統當然不會容忍不定時的 write 阻塞,linux 還會定時啟動 pdflush 執行緒,判斷記憶體頁達到一定的比例或臟頁存活時間達到設定的時間,將這些臟頁刷回到磁盤上,以避免被動刷緩沖區,這種機制就是 linux 的 writeback 機制,

猜測

了解了以上基礎知識,那么對于 write 系統呼叫為什么會被阻塞,提出了兩種可能:

  • page cache 可用空間不足,導致觸發了主動的 flush,此時會阻塞所有對此 device 的 write,
  • 寫入程序被其他事務阻塞,

首先對于第一種可能:?查看系統配置 dirty_ratio 的大小:20,此值是 page cache 占用系統可用記憶體(real mem + swap)的最大百分比, 我們的記憶體為 32G,沒有啟用 swap,則實際可用的 page cache 大小約為 6G,

另外,與 pdflush 相關的系統配置:系統會每 vm.dirty_writeback_centisecs (5s) 喚醒一次 pdflush 執行緒, 發現臟頁比例超過 vm.dirty_background_ratio (10%) 或 臟頁存活時間超過 vm.dirty_expire_centisecs(30s) 時,會將臟頁刷回硬碟,

查看 /proc/meminfoDirty/Writeback 項的變化,并對比服務的檔案寫入速度,結論是資料會被 pdflush 刷回到硬碟,不會觸發被動 flush 以阻塞 write 系統呼叫,

ext4 的 journal 特性


write 被阻塞的原因

繼續搜索資料,在一篇文章(Why buffered writes are sometimes stalled )中看到 write 系統呼叫被阻塞有以下可能:

  • 要寫入的資料依賴讀取的結果時,但記錄日志不依賴讀檔案;
  • wirte page 時有別的執行緒在呼叫 fsync() 等主動 flush 臟頁的方法,但由于鎖的存在,log 在寫入時不會有其他的執行緒操作;
  • 格式為 ext3/4 的檔案系統在記錄 journal log 時會阻塞 write,而我們的系統檔案格式為 ext4,維基百科上的一個條目( https://en.wikipedia.org/wiki/Journaling_block_device ) 也描述了這種可能,

journal

journal 是 檔案系統保證資料一致性的一種手段,在寫入資料前,將即將進行的各個操作步驟記錄下來,一旦系統掉電,恢復時讀取這些日志繼續操作就可以了,但批量的 journal commit 是一個事務,flush 時會阻塞 write 的提交,

我們可以使用 dumpe2fs /dev/disk | grep features 查看磁盤支持的特性,其中有 has_journal 代表檔案系統支持 journal 特性,

ext4 格式的檔案系統在掛載時可以選擇 (jouranling、ordered、writeback) 三種之一的 journal 記錄模式,

三種模式分別有以下特性:

  • journal:在將資料寫入檔案系統前,必須等待 metadata 和 journal 已經落盤了,
  • ordered:不記錄資料的 journal,只記錄 metadata 的 journal 日志,且需要保證所有資料在其 metadata journal 被 commit 之前落盤,ext4 在不添加掛載引數時使用此模式,
  • writeback: 資料可能在 metadata journal 被提交之后落盤,可能導致舊資料在系統掉電后恢復到磁盤中,

當然,我們也可以選擇直接禁用 journal,使用 tune2fs -O ^has_journal /dev/disk,只能操作未被掛載的磁盤,

猜測因為 journal 觸發了臟頁落盤,而臟頁落盤導致 write 被阻塞,所以解決 journal 問題就可以解決介面超時問題,

解決方案與壓測結果


以下是我總結的幾個介面超時問題的解決方案:

  1. log4j2 日志模式改異步,但有可能會在系統重啟時丟失日志,另外在異步佇列 ringbuffer 被填滿未消費后,新日志會自動使用同步模式,
  2. 調整系統刷臟頁的配置,將檢查臟頁和臟頁過期時間設定得更短(1s 以內),但理論上會略微提升系統負載(未明顯觀察到),
  3. 掛載硬碟時使用 data=https://www.cnblogs.com/javastack/archive/2021/09/27/writeback 選項修改 journal 模式,但可能導致系統重啟后檔案包含已洗掉的內容,
  4. 禁用 ext4 的 journal 特性,但可能會導致系統檔案的不一致,
  5. 把 ext4 的 journal 日志遷移到更快的磁盤上,如 ssd、閃存等,操作復雜,不易維護,
  6. 使用 xfs、fat 等 檔案系統格式,特性不了解,影響不可知,

當然,對于這幾種方案,我也做了壓測,以下是壓測的結果,

檔案系統特性 介面超時比例
ext4(同線上) 0.202%
xfs檔案系統 0.06%
page過期時間和pdflush啟動時間都設定為 0.8s 0.017%
ext4 掛載時 journal 模式為 writeback 0%
禁用 ext4 的 journal 特性 0%
log4j2 使用異步日志 0%

小結


介面超時問題總算是告一段落,查了很久,不過解決它之后也非常有成就感,遺憾的是沒有在 linux 內核代碼中找到證據,160M 的代碼,分層也不熟悉,實在是無從查起,希望以后有機會能慢慢接觸吧,

程式員還是要懂些作業系統知識的,不僅幫我們在應對這種詭異的問題時不至于束手無策,也可以在做一些業務設計時能有所參考,

又熟悉了一些系統工具和命令,腳手架上又豐富了,

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