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在R中的for回圈內分組

2022-04-27 11:51:04 後端開發

我正在使用在一篇科學論文中發現的修改后的分位數回歸函式。(來源:https ://arxiv.org/pdf/2111.04805.pdf )

我嘗試將此特定方法應用于我的資料集,但我想根據我的資料集中的條件執行此分位數回歸。這意味著我想實作類似于 group_by 條件的東西,如下所示:

qr_models = data %>%
  group_by(latitude) %>%
  do(model = rq(julian_day~year, tau = 1:99/100, method = "fn", data= .))

它在論文中的編碼方式如下,回圈是我想添加 group_by 的地方:

for (i in 1:n) {
  alpha = i/(n 1)
  alphas[i] = alpha
  betas <- smrq(X,y,tau=alpha) 
  vals0[i] <- sum(y<(X %*% betas))
}

其中 n 是n <- 99(選擇的分位數解析度);vals0 <- rep(0,n)alphas <- rep(0,n)我傾向于避免在 R 中使用回圈,所以我對如何做有點迷茫。

以防萬一需要理解,該smrq()功能是前面提到的論文中描述的功能,并且編碼如下:

smrq <- function(X, y, tau){
  p = ncol(X)
  op.result <- optim(rep(0, p),
                     fn = minimize.logcosh,
                     method = 'BFGS',
                     X = X,
                     y = y,
                     tau = tau)
  beta <- op.result$par
  return (beta)
}

其中 X 是解釋變數矩陣,y 是回應變數。

我希望它足夠清楚,如果需要更多詳細資訊,我將很樂意更新我的帖子。非常感謝您的寶貴幫助。

uj5u.com熱心網友回復:

考慮將作者的整個處理程序封裝在用戶定義的方法中,該方法接收資料(swiss來自作者)作為輸入引數以及其他變數,包括公式(Fertility ~ .來自作者)和回應列("Fertility"來自作者)。

然后,使用 傳遞資料子集group_by此外,作者for回圈可以重構為向量化回圈,例如sapplyvapply因為回傳是數字向量。

廣義函式

minimize.logcosh <- function(par, X, y, tau) {
    diff <- y-(X %*% par)
    check <- (tau-0.5)*diff (0.5/0.7)*logcosh(0.7*diff) 0.4
    return(sum(check))
}

smrq <- function(X, y, tau){
    p <- ncol(X)
    op.result <- optim(
        rep(0, p),
        fn = minimize.logcosh,
        method = 'BFGS',
        X = X,
        y = y,
        tau = tau
    )
    beta <- op.result$par
    return(beta)
}

run_smrq <- function(data, fml, response) {
    x <- model.matrix(fml, data)[,-1]
    y <- data[[response]]
    X <- cbind(x, rep(1,nrow(x)))

    n <- 99
    betas <- sapply(1:n, function(i) smrq(X, y, tau=i/(n 1)))
    # betas <- vapply(1:n, function(i) smrq(X, y, tau=i/(n 1)), numeric(1))
    return(betas)        
}

來電者

測驗作者的例子

swiss <- datasets::swiss
smrq_models <- run_smrq(data=swiss, fml=Fertility~., response="Fertility")

dplyr (使用group_map

smrq_models <- data %>%
  group_by(latitude) %>%
  group_map(~ run_smrq(data=., fml=julian_day~year, response="julian_day")

base (使用by,面向物件的包裝器tapply

smrq_models <- by(
   data, 
   data$latitude, 
   function(sub) run_smrq(data=sub, fml=julian_day~year, response="julian_day")
)

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標籤:r for循环 回归 分组

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