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Openfoam Pstream類探索

2023-02-24 07:17:05 後端開發

對于數值仿真而言,無論是商軟或者開源軟體,并行計算都是非常重要的,
作為一名仿真工程師,如果想把自身數值仿真能力提升一個層次,需要對并行計算有很好的理解與應用


openfoam并行通信主要通過Pstream類完成

Pstream類,類如其名,parallel_stream,并行計算時使用的資訊流
Openfoam對其的介紹是:

Inter-processor communications stream.

處理器間交換資訊流

類似的命名方法我們在c++檔案讀取時說過,std有fstream類讀取寫入檔案/二進制檔案,比如說我們要讀取檔案,會把讀取內容放入快取區內進行操作

#include <iostream>
#include <fstream>  // ifstream類需要包含的頭檔案,
#include <string>     // getline()函式需要包含的頭檔案,
using  namespace std;
 
int main()
{
    string filename = R"(./test.txt)";
 
    //ifstream fin(filename, ios::in);
    ifstream fin;
    fin.open(filename , ios::in);
 
    // 判斷打開檔案是否成功,
    // 失敗的原因主要有:1)目錄不存在;2)檔案不存在;3)沒有權限,Linux平臺下很常見,
    if (fin.is_open() == false)
    {
        cout << "打開檔案" << filename << "失敗,\n";  return 0;
    }
 
    string buffer;
    while (fin >> buffer)
    {
        cout << buffer << endl;
    }
 
    fin.close();	   // 關閉檔案,fin物件失效前會自動呼叫close(),
 
    cout << "操作檔案完成,\n";
}

類似的openfoam也有PstreamBuffers類進行并行通信緩沖
可以這樣使用:

PstreamBuffers pBuffers(Pstream::commsTypes::nonBlocking);

for (label proci = 0; proci < Pstream::nProcs(); proci++)
    { 
        if (proci != Pstream::myProcNo()) 
            {
                someObject vals;
                UOPstream str(proci, pBuffers);
                str << vals; 
            } 
    }

pBuffers.finishedSends(); // no-op for blocking

for (label proci = 0; proci < Pstream::nProcs(); proci++)
    { 
            if (proci != Pstream::myProcNo())
            { 
                UIPstream str(proci, pBuffers);
                someObject vals(str); 
            } 
    }

上面這個程式可以看到,先后使用UOPstream與UIPstream進行緩沖區的檔案輸出與讀取,這就很像ofstream類與ifstream類,甚至命名方式上都有幾分相似,我們打開相應的繼承關系圖

image
image

二者分別服務于IPstream類與OPstream類,我們再打開今天文章的主角,Pstream類繼承關系圖
image
發現IPstream類與OPstream類是Pstream類的衍生類,Pstream類是其基礎
打開Pstream類的原始碼:

點擊查看代碼
namespace Foam
{

/*---------------------------------------------------------------------------*\
                           Class Pstream Declaration
\*---------------------------------------------------------------------------*/

class Pstream
:
    public UPstream
{

protected:

    // Protected data

        //- Transfer buffer
        DynamicList<char> buf_;

public:

    // Declare name of the class and its debug switch
    ClassName("Pstream");


    // Constructors

        //- Construct given optional buffer size
        Pstream
        (
            const commsTypes commsType,
            const label bufSize = 0
        )
        :
            UPstream(commsType),
            buf_(0)
        {
            if (bufSize)
            {
                buf_.setCapacity(bufSize + 2*sizeof(scalar) + 1);
            }
        }


        // Gather and scatter

            //- Gather data. Apply bop to combine Value
            //  from different processors
            template<class T, class BinaryOp>
            static void gather
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                T& Value,
                const BinaryOp& bop,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T, class BinaryOp>
            static void gather
            (
                T& Value,
                const BinaryOp& bop,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

            //- Scatter data. Distribute without modification. Reverse of gather
            template<class T>
            static void scatter
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                T& Value,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T>
            static void scatter
            (
                T& Value,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

        // Combine variants. Inplace combine values from processors.
        // (Uses construct from Istream instead of <<)

            template<class T, class CombineOp>
            static void combineGather
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                T& Value,
                const CombineOp& cop,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T, class CombineOp>
            static void combineGather
            (
                T& Value,
                const CombineOp& cop,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

            //- Scatter data. Reverse of combineGather
            template<class T>
            static void combineScatter
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                T& Value,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T>
            static void combineScatter
            (
                T& Value,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

        // Combine variants working on whole List at a time.

            template<class T, class CombineOp>
            static void listCombineGather
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                List<T>& Value,
                const CombineOp& cop,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T, class CombineOp>
            static void listCombineGather
            (
                List<T>& Value,
                const CombineOp& cop,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

            //- Scatter data. Reverse of combineGather
            template<class T>
            static void listCombineScatter
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                List<T>& Value,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T>
            static void listCombineScatter
            (
                List<T>& Value,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = Pstream::worldComm
            );

        // Combine variants working on whole map at a time. Container needs to
        // have iterators and find() defined.

            template<class Container, class CombineOp>
            static void mapCombineGather
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                Container& Values,
                const CombineOp& cop,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class Container, class CombineOp>
            static void mapCombineGather
            (
                Container& Values,
                const CombineOp& cop,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );

            //- Scatter data. Reverse of combineGather
            template<class Container>
            static void mapCombineScatter
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                Container& Values,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class Container>
            static void mapCombineScatter
            (
                Container& Values,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );



        // Gather/scatter keeping the individual processor data separate.
        // Values is a List of size UPstream::nProcs() where
        // Values[UPstream::myProcNo()] is the data for the current processor.

            //- Gather data but keep individual values separate
            template<class T>
            static void gatherList
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                List<T>& Values,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T>
            static void gatherList
            (
                List<T>& Values,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );

            //- Scatter data. Reverse of gatherList
            template<class T>
            static void scatterList
            (
                const List<commsStruct>& comms,
                List<T>& Values,
                const int tag,
                const label comm
            );

            //- Like above but switches between linear/tree communication
            template<class T>
            static void scatterList
            (
                List<T>& Values,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );


        // Exchange

            //- Helper: exchange contiguous data. Sends sendData, receives into
            //  recvData. If block=true will wait for all transfers to finish.
            template<class Container, class T>
            static void exchange
            (
                const UList<Container>& sendData,
                const labelUList& recvSizes,
                List<Container>& recvData,
                const int tag = UPstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm,
                const bool block = true
            );

            //- Helper: exchange sizes of sendData. sendData is the data per
            //  processor (in the communicator). Returns sizes of sendData
            //  on the sending processor.
            template<class Container>
            static void exchangeSizes
            (
                const Container& sendData,
                labelList& sizes,
                const label comm = UPstream::worldComm
            );

            //- Exchange contiguous data. Sends sendData, receives into
            //  recvData. Determines sizes to receive.
            //  If block=true will wait for all transfers to finish.
            template<class Container, class T>
            static void exchange
            (
                const UList<Container>& sendData,
                List<Container>& recvData,
                const int tag = UPstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm,
                const bool block = true
            );
};

我們看到Pstream類有一個建構式,剩下的都是靜態成員函式,而這些成員函式就是并行通訊的工具箱
這里多問一句,為什么工具箱的函式都是靜態成員函式


為什么這里用靜態成員函式呢

用靜態成員可以變數實作多個物件間的資料共享,比全域變數更安全
這里我詳細說下,舉個例子

Time mytime1;
mytime1.hour=2;
Time mytime2;
mytime2.hour=4;

這段程式中成員變數是跟著物件走的,他們的物件各自占用不同的記憶體地址,彼此互不影響
那我們想做類內的全域變數滿足相互通信需求,在不同物件mytime1和mytime2中共享一個副本,怎么辦
這時static關鍵字就派上用場了,增加了static關鍵字或成員函式不隸屬整個物件,而隸屬于整個類
因為這個變數跟著類走,所以呼叫時用“類名::成員變數名”或“類名::成員變數函式”進行呼叫(當然也可用“物件名.靜態函式名”),表示明確的隸屬關系,不創建物件也可進行訪問編輯
在Pstream類呼叫工具箱中函式時,我們常見到這樣的呼叫方式,而且不創建Pstream物件也可進行呼叫

// 在head節點收集資訊
Pstream::gatherList(nInternalFaces);
Pstream::gatherList(nBoundaries);

因為類的靜態成員脫離了與物件的關系,普通成員變數的記憶體分配是在物件初始化時完成的,對于靜態成員必須在程式的全域區進行清晰的初始化
全域區的初始化程序可由某個.cpp源檔案的開頭的靜態成員函式完成,如下所示:

void Time::func(int testValue)
{
	mystatic = testValue ;
}

或者在全域區這樣寫:

int Time::mystatic=10;

這樣能保證這個靜態成員變數能夠被正常使用,
此外靜態成員函式只能呼叫靜態成員變數,也沒有this指標可以使用
這里上一張圖可能更方便理解
image

C++程式運行時,靜態變數和全域變數存盤在資料段,所以需要在全域區通過直接分配記憶體或者靜態函式進行分配記憶體
因而靜態成員的生命周期與程式運行周期相同,在程式中只有一份,無論創建物件與否,或者創建多少物件
說到這里可能大家對Openfoam的并行通信多了一些理解,只要開始了并行計算那么就可以通過Pstream類內的成員函式進行通信呼叫,在同樣的資料段副本上進行資訊流溝通


接下來依次說下類中各個工具的使用

收發資料
Pstream::gather()與Pstream::scatter()分別有兩個多載,分別是收集以及散布資料,不如后面Pstream::gatherList()與Pstream::scatterList()常用,這里不細說了
Pstream::combineGather()、Pstream::combineScatter()多載情況與上同,用于就地集中收集或散布的資料,不太常用

Pstream::listCombineGather()、Pstream::listCombineScatter()多載情況與上同,用于一次整合list容器中的變數
Pstream::mapCombineGather()、Pstream::mapCombineScatter()多載情況與上同,用于一次整合整個map容器中的變數

Pstream::gatherList()以及Pstream::scatterList()的第二個多載比較常用,

template<class T>
            static void gatherList
            (
                List<T>& Values,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );
template<class T>
            static void scatterList
            (
                List<T>& Values,
                const int tag = Pstream::msgType(),
                const label comm = UPstream::worldComm
            );

Pstream::gatherList()以及Pstream::scatterList()的輸入第一個引數是Values
這個Values需要自己整合下,Values是UPstream::nProcs()數量大小的List,比如說我要收集內部面可以這樣創建需要收集的List

List<label> nIternalFaces(Pstream::nProcs());
nIternalFaces[Pstream::myProcNo()] = mesh.Cf().size();//比如說看看每個節點分到了多少網格
Pstream::gatherList(nIternalFaces);//在頭結點收集資料

Pstream::scatterList()與之類似
Pstream::gatherList()以及Pstream::scatterList()的輸入第二個引數是Pstream::msgType(),默認為1,可以不輸入

int Foam::UPstream::msgType_(1);

Pstream::gatherList()以及Pstream::scatterList()的輸入第三個引數是Pstream::msgType(),默認為0,可以不輸入

Foam::label Foam::UPstream::worldComm(0);

交換資料
Pstream::exchange()有兩個多載,用于交換連續的資料,一般情況下等待其他所有傳輸完成再傳輸,可通過默認引數block()修改優先權
Pstream::exchangeSizes()用于交換資料的大小


下面是Pstream類函式相互關系
image


結語

并行開發遠不止收發資料這么簡單,還有很多類可說的,后續會一一進行介紹,并對openfoam并行計算進行優化

一起探索openfoam也是相當有趣的一件事,非常歡迎私信討論
指正的價值要比打賞更重要,下面是個人聯系方式,能結交到志同道合的朋友是我的榮幸
image

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    ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:57:23 more
  • 例外宣告

    相比于斷言適用于排除邏輯上不可能存在的狀態,例外通常是用于邏輯上可能發生的錯誤。 例外宣告 Item 1:當函式不可能拋出例外或不能接受拋出例外時,使用noexcept 理由 如果不打算拋出例外的話,程式就會認為無法處理這種錯誤,并且應當盡早終止,如此可以有效地阻止例外的傳播與擴散。 示例 //不可 ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:57:27 more
  • Codeforces 1400E Clear the Multiset(貪心 + 分治)

    鏈接:https://codeforces.com/problemset/problem/1400/E 來源:Codeforces 思路:給你一個陣列,現在你可以進行兩種操作,操作1:將一段沒有 0 的區間進行減一的操作,操作2:將 i 位置上的元素歸零。最終問:將這個陣列的全部元素歸零后操作的最少 ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:57:30 more
  • UVA11610 【Reverse Prime】

    本人看到此題沒有翻譯,就附帶了一個自己的翻譯版本 思考 這一題,它的第一個要求是找出所有 $7$ 位反向質數及其質因數的個數。 我們應該需要質數篩篩選1~$10^{7}$的所有數,這里就不慢慢介紹了。但是,重讀題,我們突然發現反向質數都是 $7$ 位,而將它反過來后的數字卻是 $6$ 位數,這就說明 ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:57:36 more
  • 統計區間素數數量

    1 #pragma GCC optimize(2) 2 #include <bits/stdc++.h> 3 using namespace std; 4 bool isprime[1000000010]; 5 vector<int> prime; 6 inline int getlist(int ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:57:47 more
  • C/C++編程筆記:C++中的 const 變數詳解,教你正確認識const用法

    1、C中的const 1、區域const變數存放在堆疊區中,會分配記憶體(也就是說可以通過地址間接修改變數的值)。測驗代碼如下: 運行結果: 2、全域const變數存放在只讀資料段(不能通過地址修改,會發生寫入錯誤), 默認為外部聯編,可以給其他源檔案使用(需要用extern關鍵字修飾) 運行結果: ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:58:04 more
  • 【C++犯錯記錄】VS2019 MFC添加資源不懂如何修改資源宏ID

    1. 首先在資源視圖中,添加資源 2. 點擊新添加的資源,復制自動生成的ID 3. 在解決方案資源管理器中找到Resource.h檔案,編輯,使用整個專案搜索和替換的方式快速替換 宏宣告 4. Ctrl+Shift+F 全域搜索,點擊查找全部,然后逐個替換 5. 為什么使用搜索替換而不使用屬性視窗直 ......

    uj5u.com 2020-09-10 00:59:11 more
  • 【C++犯錯記錄】VS2019 MFC不懂的批量添加資源

    1. 打開資源頭檔案Resource.h,在其中預先定義好宏 ID(不清楚其實ID值應該設定多少,可以先新建一個相同的資源項,再在這個資源的ID值的基礎上遞增即可) 2. 在資源視圖中選中專案資源,按F7編輯資源檔案,按 ID 型別 相對路徑的形式添加 資源。(別忘了先把檔案拷貝到專案中的res檔案 ......

    uj5u.com 2020-09-10 01:00:19 more
  • C/C++編程筆記:關于C++的參考型別,專供新手入門使用

    今天要講的是C++中我最喜歡的一個用法——參考,也叫別名。 參考就是給一個變數名取一個變數名,方便我們間接地使用這個變數。我們可以給一個變數創建N個參考,這N + 1個變數共享了同一塊記憶體區域。(參考型別的變數會占用記憶體空間,占用的記憶體空間的大小和指標型別的大小是相同的。雖然參考是一個物件的別名,但 ......

    uj5u.com 2020-09-10 01:00:22 more
  • 【C/C++編程筆記】從頭開始學習C ++:初學者完整指南

    眾所周知,C ++的學習曲線陡峭,但是花時間學習這種語言將為您的職業帶來奇跡,并使您與其他開發人員區分開。您會更輕松地學習新語言,形成真正的解決問題的技能,并在編程的基礎上打下堅實的基礎。 C ++將幫助您養成良好的編程習慣(即清晰一致的編碼風格,在撰寫代碼時注釋代碼,并限制類內部的可見性),并且由 ......

    uj5u.com 2020-09-10 01:00:41 more
最新发布
  • Rust中的智能指標:Box<T> Rc<T> Arc<T> Cell<T> RefCell<T> Weak

    Rust中的智能指標是什么 智能指標(smart pointers)是一類資料結構,是擁有資料所有權和額外功能的指標。是指標的進一步發展 指標(pointer)是一個包含記憶體地址的變數的通用概念。這個地址參考,或 ” 指向”(points at)一些其 他資料 。參考以 & 符號為標志并借用了他們所 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:24:10 more
  • Java的值傳遞和參考傳遞

    值傳遞不會改變本身,參考傳遞(如果傳遞的值需要實體化到堆里)如果發生修改了會改變本身。 1.基本資料型別都是值傳遞 package com.example.basic; public class Test { public static void main(String[] args) { int ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:24:04 more
  • [2]SpinalHDL教程——Scala簡單入門

    第一個 Scala 程式 shell里面輸入 $ scala scala> 1 + 1 res0: Int = 2 scala> println("Hello World!") Hello World! 檔案形式 object HelloWorld { /* 這是我的第一個 Scala 程式 * 以 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:23:58 more
  • 理解函式指標和回呼函式

    理解 函式指標 指向函式的指標。比如: 理解函式指標的偽代碼 void (*p)(int type, char *data); // 定義一個函式指標p void func(int type, char *data); // 宣告一個函式func p = func; // 將指標p指向函式func ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:23:52 more
  • Django筆記二十五之資料庫函式之日期函式

    本文首發于公眾號:Hunter后端 原文鏈接:Django筆記二十五之資料庫函式之日期函式 日期函式主要介紹兩個大類,Extract() 和 Trunc() Extract() 函式作用是提取日期,比如我們可以提取一個日期欄位的年份,月份,日等資料 Trunc() 的作用則是截取,比如 2022-0 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:23:45 more
  • 一天吃透JVM面試八股文

    什么是JVM? JVM,全稱Java Virtual Machine(Java虛擬機),是通過在實際的計算機上仿真模擬各種計算機功能來實作的。由一套位元組碼指令集、一組暫存器、一個堆疊、一個垃圾回收堆和一個存盤方法域等組成。JVM屏蔽了與作業系統平臺相關的資訊,使得Java程式只需要生成在Java虛擬機 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:23:31 more
  • 使用Java接入小程式訂閱訊息!

    更新完微信服務號的模板訊息之后,我又趕緊把微信小程式的訂閱訊息給實作了!之前我一直以為微信小程式也是要企業才能申請,沒想到小程式個人就能申請。 訊息推送平臺🔥推送下發【郵件】【短信】【微信服務號】【微信小程式】【企業微信】【釘釘】等訊息型別。 https://gitee.com/zhongfuch ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:22:59 more
  • java -- 緩沖流、轉換流、序列化流

    緩沖流 緩沖流, 也叫高效流, 按照資料型別分類: 位元組緩沖流:BufferedInputStream,BufferedOutputStream 字符緩沖流:BufferedReader,BufferedWriter 緩沖流的基本原理,是在創建流物件時,會創建一個內置的默認大小的緩沖區陣列,通過緩沖 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:22:49 more
  • Java-SpringBoot-Range請求頭設定實作視頻分段傳輸

    老實說,人太懶了,現在基本都不喜歡寫筆記了,但是網上有關Range請求頭的文章都太水了 下面是抄的一段StackOverflow的代碼...自己大修改過的,寫的注釋挺全的,應該直接看得懂,就不解釋了 寫的不好...只是希望能給視頻網站開發的新手一點點幫助吧. 業務場景:視頻分段傳輸、視頻多段傳輸(理 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:22:42 more
  • Windows 10開發教程_編程入門自學教程_菜鳥教程-免費教程分享

    教程簡介 Windows 10開發入門教程 - 從簡單的步驟了解Windows 10開發,從基本到高級概念,包括簡介,UWP,第一個應用程式,商店,XAML控制元件,資料系結,XAML性能,自適應設計,自適應UI,自適應代碼,檔案管理,SQLite資料庫,應用程式到應用程式通信,應用程式本地化,應用程式 ......

    uj5u.com 2023-04-20 07:22:35 more