參考:Biopython 安裝
Biopython 安裝
本節解釋了如何在你的機器上安裝Biopython,它的安裝非常簡單,不會超過5分鐘,
第1步 - 驗證Python的安裝
Biopython被設計為與Python 2.5或更高版本一起作業,因此,必須先安裝Python,在你的命令提示符下運行以下命令
> python --version
它的定義如下 –

它顯示python的版本,如果安裝正確的話,否則,請下載最新版本的python,安裝后再運行該命令,
第2步 - 使用pip安裝Biopython
在所有平臺上使用pip從命令列安裝Biopython是很容易的,鍵入下面的命令 –
> pip install biopython
在你的螢屏上將看到以下反應—

對于更新舊版本的Biopython —
> pip install biopython –-upgrade
在你的螢屏上將看到以下反應—

執行這個命令后,在安裝最新版本之前,舊版本的Biopython和NumPy(Biopython依賴于它)將被洗掉,
第3步 - 驗證Biopython的安裝
現在,你已經成功地在你的機器上安裝了Biopython,為了驗證正確安裝了Biopython,請在python控制臺中輸入以下命令 ?

它顯示了Biopython的版本,
替代方法 – 使用源代碼安裝Biopython
要使用源代碼安裝Biopython,請按照下面的說明:
從以下鏈接下載Biopython的最新版本 –https://biopython.org/wiki/Download
截至目前,最新的版本是 biopython-1.72 ,
下載該檔案并解壓壓縮檔案檔案,移動到源代碼檔案夾,并輸入以下命令 –
> python setup.py build
這將從源代碼中構建Biopython,如下所示-

現在,使用下面的命令測驗代碼 –
> python setup.py test

最后,使用下面的命令進行安裝 –
> python setup.py install

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標籤:Python
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