HPCC branchmark測驗使用
在使用程序中參考了在ubuntu下測驗本機的HPCC分數這一篇博文,由于我的環境和這篇文章有所不同,該測驗是在學校的超級計算機上完成的,相關配置有所差別,
1. 下載
在HPC Chellenge下載對應的源檔案hpcc-1.x.x.tar.gz,將安裝包傳輸到超級計算機對應的個人檔案夾下,
使用命令列在合適的位置解壓檔案
tar xzvf hpcc.1.x.x.tar.gz
2. 構建MAKE檔案
進入目錄 ./hpcc.1.5.0/hpl/setup,該目錄下保存有多種構建好的MAKE檔案腳本示例,根據其命名,可以看出對應適合的系統,
將其復制到上級目錄./hpcc1.5.0/hpl中,修改Make.xxx檔案,具體修改專案如下:
MPdir = /home/andywang/mpich-install //本機安裝mpi的位置
MPinc = -I$(MPdir)/include //mpi頭檔案所在的位置
MPlib = $(MPdir)/lib/libmpi.a //mpi靜態庫所在的位置
LAdir = $(HOME)/clapack/lib //blas所在的位置
LAinc = //HPCC沒有用到blas頭檔案,可以空著
LAlib = $(LAdir)/blas_LINUX.a $(LAdir)/lapack_LINUX.a $(LAdir)/libf2c.a
LINKER = $(CC)
根據自己計算的具體情況,選擇對應的路徑和位置,可以使用which等命令來協助查找本機的相關可執行檔案的路徑,
在我的使用環境中,可以配置為:
# MPI 部分:
MPdir = /usr/local/mpi3-icc13
MPinc = -I$(MPdir)/include
MPlib = -L$(MPdir)/include
# LA 部分
LAdir = /opt/intel/mkl
LAinc = -I$(LAdir)/include
LAlib = -L$(LAdir)/lib/intel64/ $(LAdir)/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a -Wl,--start-group $(LAdir)/lib/intel64/libmkl_sequential.a $(LAdir)/lib/intel64/libmkl_core.a -Wl,--end-group -L $(LAdir)/lib/intel64/ -lpthread -lm
# CC 部分
CC = mpicc
CCNOOPT = $(HPL_DEFS)
CCFLAGS = $(HPL_DEFS) -fomit-frame-pointer -O3 -funroll-loops -Wall
# Linker 部分
LINKER = mpicc
LINKFLAGS = -L$(LAdir)/lib/intel64
3. 編譯
在hpl上級目錄,即目錄./hpcc.1.5.0/下進行編譯,使用命令如下,其中xxx為所修改的檔案后綴,
make arch = xxx
如果希望默認為根據某個Make檔案編譯,可以在./hpcc.1.5.0/hpl/Make.top中將arch=UNKONWN修改為對應的檔案后綴,
在我的環境中,編譯程序中出現了報錯資訊stream.c檔案a,b,c未定義,經過查閱相關檔案,發現我的環境編譯器不支持C語言中的restrict,可以通過修改./hpcc.1.5.0/hpl/Stream/stream.c解決問題,
在編譯程序中,可能遇到其他錯誤,通過排查,一般能夠發現對應的路徑或者是檔案問題所在,按照錯誤資訊解決即可,常見有某些檔案沒有找到,一般是錯誤設定了路徑,查看Make檔案中對應的路徑設定即可,
4. 運行
在正常的版本的mpi下,可以使用如下命令列運行,在某些超級計算機上面運行,根據運行的相關要求,將命令列中的mpiexec更換為對應提供的運行命令即可,
mpiexec 64 ./hpcc
通過該命令運行,可能會報錯cannot open file hpccinf.txt,此時檢查目錄./hpcc.1.5.0/下是否存在檔案_hpccinf.txt,如果有,重命名為hpccinf.txt即可,
還有可能報錯Need at least 4 processes for these tests,此時根據要求指定運行執行緒數大于4即可,或者是修改檔案./hpcc-1.5.0/hpccinf.txt,將Ps和Qs的積(Ps*Qs)減小即可,
5. 結果
運行結束后,沒有任何提示資訊,會在目錄./hpcc.1.5.0/下生成檔案hpccoutf.txt,該檔案為此次測驗的詳細結果,
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