我有一個箱線圖（見下文），我想根據指定的調色板按變數著色。我不確定如何為它們著色，因為代碼基于 Phyloseq 包。我嘗試aes()過plot_richness，但它似乎只適用于geom_boxplot().
library(ggplot2)
library(phyloseq)
palette <- c("#B0F2E7", "#166AD0", "#F89EE9", "#DA0000", "#C6C3D3", "#23202C")
plot_richness(physeq_shime, x='System', measures='Shannon') theme_bw()
xlab('SHIME') scale_y_continuous(limits=c(2.0,3.2))
geom_boxplot(aes(fill='System'))
如何按照自定義調色板的順序填充箱線圖？
提前致謝。
uj5u.com熱心網友回復：
這對我有用
library(ggplot2)
library(phyloseq)
palette <- c("#B0F2E7", "#166AD0", "#F89EE9", "#DA0000", "#C6C3D3", "#23202C")
plot_richness(physeq_shime, x='System', measures='Shannon') theme_bw()
xlab('SHIME') scale_y_continuous(limits=c(2.0,3.2))
geom_boxplot(lwd=0.9, alpha=0.7, aes(fill=sample_data(physeq_shime)$System))
scale_fill_manual(values=palette)
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