在查找和使用管道中呼叫外部命令-有解無憂

我想知道在呼叫外部命令（例如 hlcat）以將它們顯示/轉換為可讀格式之前，是否有一種方法可以在 AIX 6.x 上使用 find 命令從某個目錄（包括子目錄）中搜索所有檔案然后可以通過 grep 命令來查找模式而不是在 shell 中使用回圈嗎？

e.g. find . -type f -name “*.hl7” -exec hlcat {} | grep -l “pattern” \;

上面的命令不起作用，我必須使用 while 回圈來顯示內容并搜索模式，如下所示：

find . -type f -name “*.hl7” -print | while read file; do
hlcat $file | grep -l “pattern”;
done

同時，這些 HL7 檔案已用圓括號重命名，以防止打開它們而不必在檔案名周圍包含雙引號。

e.g. hlcat (patient) filename.hl7 will fail to open.
        hlcat “(patient) filename.hl7” will work.

簡而言之，我正在 find 命令中尋找一種干凈簡潔的單行方法，并使用圓括號名稱查看和搜索這些 HL7 檔案的內容。

非常感謝，喬治

PS HL7 原始資料由一條連續線組成，除非使用 hlcat 等工具將其轉換為可行的讀取格式，否則無法讀取。在

uj5u.com熱心網友回復：

查找包含`pattern`以下內容的 HL7 檔案：

使用 bash：

#!/bin/bash

find . -type f -name '*.hl7' -exec printf '%s\0' {}   |
while IFS='' read -r -d '' filepath
do
    hlcat "$filepath" | egrep -q 'pattern' && printf '%s\n' "$filepath"
done

^{注意： AIXfind沒有這個-print0選項}

或者里面有一個腳本find：

find . -type f -name '*.hl7' -exec sh -c '
    for f; do
        hlcat "$f" | egrep -q pattern && printf "%s\n" "$f";
    done
' _ {}

^{注意： pattern必須正確插入腳本中（可能會導致可讀性降低）}

更新：更換`hlcat`同`cat`向您展示它是如何作業

考慮以下內容簡單的檔案：

檔案名：(Barry) fileX.hl7
內容：Barry
檔案名：(John) fileY.hl7
內容：John
檔案名：(Jolene) fileZ.hl7
內容：Jolene

命令：

find . -type f -name '*.hl7' -exec cat {} \; | egrep -l 'Barry|Jolene'

輸出：

(standard input)

這意味著egrep在其標準輸入中找到了模式...！這就是它所能做的一切，您的awk腳本將做一些等效的事情。

而命令：

find . -type f -name '*.hl7' -exec sh -c '
    for f; do
        cat "$f" | egrep -q "Barry|Jolene" && printf "%s\n" "$f"; 
    done
' _ {}

和

#!/bin/bash
find . -type f -name '*.hl7' -exec printf '%s\0' {}   |
while IFS='' read -r -d '' filepath
do
    cat "$filepath" | egrep -q 'Barry|Jolene' && printf '%s\n' "$filepath"
done

兩個輸出：

./(Jolene) fileZ.hl7
./(Barry) fileX.hl7

哪些是包含模式的檔案。

Now if you're fine without a robust handling of filenames, then your example with the while loop could work, provided that you add double quotes when expanding the filename:

find . -type f -name '*.hl7' -print | while read file; do
  cat "$file" | egrep -q 'Barry|Jolene' && printf '%s\n' "$file"
done

outputs:

./(Jolene) fileZ.hl7
./(Barry) fileX.hl7

But what's the point of not creating bullet-proof code when you can?

uj5u.com熱心網友回復：

在查看HL7 檔案格式后，我可以說您根本不需要hlcat在 HL7 v2檔案中查找患者名字：

使用 AIX 在所有檔案中搜索grep：

find . -type f -name '*.hl7' -exec grep -iEl '^PID\|([^|]*\|){4}[^|]*\^(Barry|Jolene)\^' {}

在檔案中一一搜索，使用awk：

find . -type f -name '*.hl7' -exec awk -v regexp='^(Barry|Jolene)$' '
    BEGIN { FS="|" }
    $1 == "PID" { split($6, name, "^"); if (toupper(name[2]) ~ toupper(regexp)) { found = 1 } }
    END { exit !found }
' {} \; -print

在所有檔案中搜索，只需一次awk呼叫：

find . -type f -name '*.hl7' -exec awk -v regexp='^(Barry|Jolene)$' '
    BEGIN { FS="|" }
    FNR == 1 { if( found ) print filename; found = 0; filename = FILENAME }
    $1 == "PID" { split($6, name, "^"); if (toupper(name[2]) ~ toupper(regexp)) { found = 1 } }
    END { if ( found ) print filename }
' {}

限制：如果您有 HL7 v3檔案，則上述命令都不起作用。

在查找和使用管道中呼叫外部命令

查找包含pattern以下內容的 HL7 檔案：

更新：更換hlcat同cat向您展示它是如何作業

評論：

查找包含`pattern`以下內容的 HL7 檔案：

更新：更換`hlcat`同`cat`向您展示它是如何作業