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使用dplyr將資料框中的值(基于特定分組)乘以單獨的矩陣

2022-11-10 14:41:02 前端設計

我需要將資料框中的值(基于特定分組)乘以一個單獨的矩陣,該矩陣對這些值施加某種權重。乘法是我撰寫的函式的一部分。我知道如何以最基本的方式做到這一點。但我無法理解如何在更現實的環境中做到這一點。我希望我的例子能說明這個問題。

我有以下示例資料集:

set.seed(45)
tibble(site = rep(c(LETTERS[1:3]), each = 6),
       name = rep(c(letters[10:15]), 3),
       size = runif(18)) %>%
  arrange(site, name) -> d_tibble

我還有一個可以代表某種權重的矩陣:

d_matrix <- matrix(0, 6, 6)
diag(d_matrix) <- 1
rownames(d_matrix) <- letters[10:15]
colnames(d_matrix) <- letters[10:15]

d_matrix
##   j k l m n o
## j 1 0 0 0 0 0
## k 0 1 0 0 0 0
## l 0 0 1 0 0 0
## m 0 0 0 1 0 0
## n 0 0 0 0 1 0
## o 0 0 0 0 0 1

我還有一個函式應該將向量乘以p矩陣b

test_fct <- function(a, b) {
  p <- a / sum(a)
  sum(p * (p %*% b))
}

然后我想做這樣的事情,即使用我的函式summarise()

#d_tibble %>%
#  group_by(site) %>%
#  summarise(y = test_fct(size, b))

但我不知道如何b將矩陣(即矩陣)放入我的自定義函式中,以便它的列名在按 .name分組時與變數匹配site

我嘗試的一種方法是將矩陣合并到資料框中 - 這樣我就可以將所有內容都放在一個資料框中:

d_tibble %>%
  left_join(d_matrix %>%
              as_tibble() %>%
              mutate(name = colnames(d_matrix))) -> tibble_matrix_join

比我擁有所有這些但我需要以某種方式訪問name??給定site分組的變數的唯一值,以便為我的函式中的向量/矩陣乘法選擇正確的列(j、k、l、m、n、o)test_fct()

#tibble_matrix_join %>%
#  group_by(site) %>%
#  summarise(result = test_fct(size, b))

我試圖檢查一般設定是否有效,即僅適用于一個站點并包括矩陣中的所有名稱,它確實:

d_tibble %>% 
    filter(site == "A") %>% 
    pull(size) -> my_x 

test_fct(my_x, d_matrix)
## [1] 0.1858158

my_p <- my_x/sum(my_x)
sum(my_p * (my_p %*% d_matrix))
## [1] 0.1858158

uj5u.com熱心網友回復:

對于該示例,d_matrix 中的所有列都可以在所有“站點”的 tibble 的“名稱”列中找到。如果不是這樣,我們可以這樣做

library(dplyr)
d_tibble %>%
   group_by(site) %>% 
   summarise(out = test_fct(size, d_matrix[intersect(row.names(d_matrix), 
         name), intersect(colnames(d_matrix), 
         name), drop = FALSE]), .groups = "drop")

-輸出

# A tibble: 3 × 2
  site    out
  <chr> <dbl>
1 A     0.186
2 B     0.264
3 C     0.218

- 測驗較小的資料

d_tibble %>% 
  slice_sample(n = 12) %>%
  arrange(site, name) %>% 
  group_by(site) %>% 
   summarise(out = test_fct(size, d_matrix[intersect(row.names(d_matrix), 
         name), intersect(colnames(d_matrix), 
         name), drop = FALSE]), .groups = "drop")

-輸出

# A tibble: 3 × 2
  site    out
  <chr> <dbl>
1 A     0.227
2 B     0.416
3 C     0.481

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qianduan/530791.html

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