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將資料框架中的分類法列印為帶縮進的文本

2021-10-18 13:54:30 企業開發

我有一個subclassOf層次結構,它可以被表示為一個資料框架。subjectsobjects的子類。我想把它列印成一個縮進的串列,其中縮進意味著該術語是上面一行的術語的子類。我正在使用一個遞回函式,感覺我已經很接近了。我可以縮進,但我不認為我找到了縮進的正確位置(通過遞減prefix_level)。

如果這個問題沒有得到很好的組織,請原諒。我愿意接受任何解決方案。它不一定要建立在我所展示的基礎上。

import pandas as pd
current_direct_sco = pd.DataFrame(
    {
        "subject": {
            986: "ENVO:01000025",
            989: "ENVO:01000028",
            990: "ENVO:01000029",
            991: "ENVO:01000030",
            1011: "ENVO:01000050",
            1014: "ENVO:01000053",
            1015: "ENVO:01000054",
            1096: "ENVO:01000127",
            1242: "ENVO:01000252",
            1243: "ENVO:01000253",
        },
        "object": {
            986: "ENVO:01000024",
            989: "ENVO:01000024",
            990: "ENVO:01000024",
            991: "ENVO:01000024",
            1011: "ENVO:01000029",
            1014: "ENVO:01000030",
            1015: "ENVO:01000030",
            1096: "ENVO:01000024",
            1242: "ENVO:00000873",
            1243: "ENVO:00000873",
        },
    }
)

print(current_direct_sco)
| | subject | object|
|------|---------------|---------------|
| 986 | ENVO:01000025 | ENVO:01000024 |
| 989 | ENVO:01000028 | ENVO:01000024 |
990 | ENVO:01000029 | ENVO:01000024 | 990 ?
| 991 | ENVO:01000030 | ENVO:01000024 |
1011 | ENVO:01000050 | ENVO:01000029 | 1011 ?
| 1014 | ENVO:01000053 | ENVO:01000030 |
| 1015 | ENVO:01000054 | ENVO:01000030 |
| 1096 | ENVO:01000127 | ENVO:01000024 |
| 1242 | ENVO:01000252 | ENVO:00000873 !
| 1243 | ENVO:01000253 | ENVO:00000873 |
import igraph as ig
g = ig.Graph.TupleList(
    current_direct_sco.itertuples(index=False), directed=True, vertex_name_attr="label")
)
# requires pycairo
ig.plot(g)

在此輸入圖片描述

roots = listset(current_direct_sco["object"]) - set(current_direct_sco["subject"))
print(roots)

['ENVO:00000873', 'ENVO:01000024']

def recurse_envostarting_term)。
    global prefix_level
    global prefix_chunk
    global current_prefix
    print(current_prefix   starting_term)。
    current_children = list(
        current_direct_sco["subject"].loc[current_direct_sco["object"] == start_term]
    )
    if len(current_children) > 0:
        prefix_level = prefix_level   1:
        current_prefix = prefix_chunk * prefix_level
        for current_child  in current_children:
            recurse_envo(current_child)

for i in roots:
    first_term = i
    prefix_level =0
    prefix_chunk = " "/span>
    current_prefix = " "/span>
    recurse_envo(first_term)

這就是輸出結果。

ENVO:00000873
  ENVO:01000252
  ENVO:01000253
ENVO:01000024
  ENVO:01000025
  ENVO:01000028
  ENVO:01000029
    ENVO:01000050
    ENVO:01000030
      ENVO:01000053
      ENVO:01000054
      ENVO:01000127

但它應該是這樣的(手繪的)。例如,ENVO:01000127不是ENVO:01000030的子類:

ENVO:00000873
  ENVO:01000252
  ENVO:01000253
ENVO:01000024
  ENVO:01000025
  ENVO:01000028
  ENVO:01000029
    ENVO:01000050
  ENVO:01000030
    ENVO:01000053
    ENVO:01000054
  ENVO:01000127

uj5u.com熱心網友回復:

你可以使用遞回:

data = {'subject': {986: 'ENVO:01000025', 989: 'ENVO:01000028', 990: 'ENVO:01000029', 991: 'ENVO:01000030', 1011: 'ENVO:01000050', 1014: 'ENVO:01000053', 1015: 'ENVO:01000054', 1096: 'ENVO:01000127', 1242: 'ENVO:01000252', 1243: 'ENVO:01000253'}, 'object': {986: 'ENVO:01000024', 989: 'ENVO:01000024', 990: 'ENVO:01000024', 991: 'ENVO:01000024', 1011: 'ENVO:01000029', 1014: 'ENVO:01000030', 1015: 'ENVO:01000030', 1096: 'ENVO:01000024', 1242: 'ENVO:00000873', 1243: 'ENVO:00000873'}}。
vals = [[data['subject'/span>][i], data['object'/span>][i]] for i in data['subject']] ]
def nest(n, c = 0) 。
   return ((c*" ") n) ('' ifnot (k: =[nest(a, c 1) for a, b in vals if b == n] ) 
          else '
' ("
".join(k)))

roots = {b for _, b in vals if all(j ! = b for j, _ in vals)} #can replace this definition with list(set(current_direct_sco["object"]) - set(current_direct_sco["subject"))
print('
'.join(nest(b) for b in roots)

輸出:

ENVO:01000024
   ENVO:01000025
   ENVO:01000028
   ENVO:01000029
      ENVO:01000050
   ENVO:01000030
      ENVO:01000053
      ENVO:01000054
   ENVO:01000127
ENVO:00000873
   ENVO:01000252
   ENVO:01000253

一個更簡單的nest的實作,使用一個生成器:

def nest(n, c = 0) 。
   yield (c*") n
   for a, b in vals:
       if b == n:
          yield from nest(a, c 1)

...
print'
'.join(i for b in roots for i in nest(b))

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