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將各種dfs與不同的列連接,但洗掉重復

2022-02-21 17:48:01 企業開發

我一直在網上抓取一個包含許多化合物資訊的網站。問題是盡管所有頁面都有一些相同的資訊,但它并不一致。所以這意味著每次提取我都會有不同數量的列。我想在 Excel 檔案中組織所有內容,以便更輕松地過濾我想要的資訊,但我遇到了很多麻煩。

示例(盡管提取的不僅僅是 3 個資料幀):DF 1 - 從網頁抓取第一頁

化合物名稱 研究型別 Cas 編號 歐共體名稱 評論 結論
阿司匹林 具體的 3439-73-9 阿司匹林 重復 得到正式認可的

DF 2 - 來自網路抓取

化合物名稱 研究型別 Cas 編號 歐共體名稱 評論 結論 概括
表皮生長因子受體 具體的 738-9-8 表皮生長因子受體 重復 不批準 無定論

DF 3 - 來自網路抓取

化合物名稱 研究型別 Cas 編號 評論 結論
苯甲醛 具體的 384-92-2 重復 不批準

我想要的是這樣的:

最終 DF(影像) 將各種 dfs 與不同的列連接,但洗掉重復

我用 pd.concat 嘗試了很多東西,但所有嘗試都沒有成功。

我得到的最接近的是與此類似的東西,重復列:

化合物名稱 研究型別 Cas 編號 歐共體名稱 評論 結論
阿司匹林 具體的 3439-73-9 阿司匹林 重復 得到正式認可的
化合物名稱 研究型別 Cas 編號 評論 結論
苯甲醛 具體的 384-92-2 重復 不批準
化合物名稱 研究型別 Cas 編號 歐共體名稱 評論 結論
表皮生長因子受體 具體的 738-9-8 表皮生長因子受體 重復 不批準

這是我正在嘗試撰寫的一些當前代碼:

compound_info = []
descriptor_info = []
df_list = []
df = pd.DataFrame()
df_final = pd.DataFrame(columns=['Compound Name',
                                'Study Type',
                                'CAS Number',
                                'EC Name',
                                'Remarks',
                                'Conclusions'])

for i in range(1,num_btn_selecionar 1):
   time.sleep(10)
   driver.find_element_by_xpath('//*[@id="SectionHeader"]/div[3]/select/option['   str(i)  ']').click()
   page_source = driver.page_source
   soup = BeautifulSoup(page_source, "html.parser")
   info = soup.find_all("dl", {'class':'HorDL'})
   lista_info = len(info)
   all_info_compound = []
   all_descrip_compound = []
   for y in range(0, lista_info):
       for z in info[y].find_all('dd'):
           all_info_compound.append(z.text)
       for w in info[y].find_all('dt'):
           all_descrip_compound.append(w.text)
   compound_info.append(all_info_compound)
   descriptor_info.append(all_descrip_compound)
   
   data_tuples = list(zip(all_descrip_compound[1:],all_info_compound[1:]))
   temp_df = pd.DataFrame(data_tuples)
   data_transposed = temp_df.T
   #df_list.append(data_transposed)
   pd.concat([df_final,data_transposed], ignore_index=True, axis=0) 

我得到的錯誤是:

InvalidIndexError: Reindexing only valid with uniquely valued Index objects

我將非常感謝您的幫助!

uj5u.com熱心網友回復:

pd.concat應該做的作業。該錯誤的原因是 中的一個資料框concat很可能是data_transposed有兩列共享相同的名稱。要看到這一點,您可以將最后一行替換為

try:
    df_final = pd.concat([df_final,data_transposed], ignore_index=True, axis=0)
except Exception as e:
    print('Error:', e)
    print('df_final:', df_final.columns)
    print('data_transposed:', data_transposed.columns) 

同樣在你的最后一行中,你永遠不會用新的連接的覆寫你df_final的,你需要df_final = 在前面,因為我已經添加到我上面的代碼中。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qiye/429604.html

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