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生成具有兩個字串列之間的字串相似距離的新列的有效方法

2022-04-30 05:13:35 企業開發

(1138812, 14)我有一個帶有形狀和列的熊貓資料框

['id', 'name', 'latitude', 'longitude', 'address', 'city', 'state',
       'zip', 'country', 'url', 'phone', 'categories', 'point_of_interest',
       'id_2', 'name_2', 'latitude_2', 'longitude_2', 'address_2', 'city_2',
       'state_2', 'zip_2', 'country_2', 'url_2', 'phone_2', 'categories_2',
       'point_of_interest_2', 'match']

我想基于使用Levenshteindifflib difflib.SequenceMatcher().ratio()的字串相似距離創建新列,Levenshtein.distance()以及在每個列Levenshtein.jaro_winkler()之間LongestCommonSubstring()

['name', 'address', 'city', 'state',
       zip', 'country', 'url', 'phone', 'categories']

和相應_2的后綴列。最后它會給我 9*4 = 36 個新列。現在,我正在使用df.iterrows()回圈資料框并制作列串列。但這非常非常耗費時間和記憶體。使用完整的 16GB 記憶體需要 3.5 小時才能完成整個資料幀。我正在嘗試在時間和記憶方面找到一種更好的方法來獲得我的結果。我的代碼:

import Levenshtein
import difflib
from tqdm.notebook import tqdm
columns = ['name', 'address', 'city', 'state',
           'zip', 'country', 'url', 'phone', 'categories']
data_dict = {}
for i in columns:
    data_dict[f"{i}_geshs"] = []
    data_dict[f"{i}_levens"] = []
    data_dict[f"{i}_jaros"] = []
    data_dict[f"{i}_lcss"] = []
for i,row in tqdm(train.iterrows(),total = train.shape[0]):
    for j in columns:
        data_dict[f"{j}_geshs"].append(difflib.SequenceMatcher(None, row[j], row[f"{j}_2"]).ratio())
        data_dict[f"{j}_levens"].append(Levenshtein.distance(row[j], row[f"{j}_2"]))
        data_dict[f"{j}_jaros"].append(Levenshtein.jaro_winkler(row[j], row[f"{j}_2"]))
        data_dict[f"{j}_lcss"].append(LCS(str(row[j]), str(row[f"{j}_2"])))
data = pd.DataFrame(data_dict)
train = pd.concat(train, data, axis = 1)

uj5u.com熱心網友回復:

從如下所示的資料框開始:

地址 城市 狀態 壓縮 網址 電話 類別 名字_2 地址2 城市_2 state_2 zip_2 url_2 電話_2 類別_2
蘿莉 680布爾十字路口 達拉斯 德克薩斯州 75277 url_shortened 214-533-2179 花崗巖表面 奧古斯丁 7 席勒十字路口 拉伯克 德克薩斯州 79410 url_shortened 806-729-7419 屋頂(金屬)
德米特里 05 柯立芝之路 查爾斯頓 西弗吉尼亞 25356 url_shortened 304-906-6384 結構和雜項鋼(制造) 科爾尼 0547克萊蒙斯廣場 皮奧里亞 伊利諾伊州 61651 url_shortened 309-326-4252 框架(鋼)

并且是形狀1024000 rows × 16 columns

import difflib
import Levenshtein
import numpy as np
import pandas as pd
from pandarallel import pandarallel
pandarallel.initialize(nb_workers=8) # Customize based on # of cores, or leave blank to use all

def dists(x, y):
    matcher = difflib.SequenceMatcher(None, x, y)
    geshs = matcher.ratio()
    levens = Levenshtein.distance(x, y)
    jaros = Levenshtein.jaro_winkler(x, y)
    lcss = matcher.find_longest_match(0, len(x), len(y)) # I wasn't sure how you'd done this one.
    return [geshs, levens, jaros, lcss]


df = pd.read_csv('MOCK_DATA.csv')
df = df.astype(str) # force all fields to strings.

cols = df.columns
cols = np.array_split(cols, 2) # assumes there's a matching `_2` column for every column.
for x, y in zip(*cols):
    (df[x   '_geshs'], 
     df[x   '_levens'], 
     df[x   '_jaros'], 
     df[x   '_lcss']) = df.parallel_apply(lambda z: dists(z[x], z[y]), axis=1, result_type='expand')
    # Replace parallel_apply with apply to run non-parallel.

(除了保留原始列)我在 3 分鐘內得到這些列,沒有并行化,它仍然可能只需要 ~20-30 分鐘。python 的峰值記憶體使用量僅為 3GB 左右,并且在沒有并行化的情況下會低得多

first_name_geshs first_name_levens first_name_jaros first_name_lcss 地址_geshs address_levens 地址_jaros 地址_lcss city_geshs city_levens city_jaros city_lcss state_geshs state_levens state_jaros state_lcss zip_geshs zip_levens zip_jaros zip_lcss url_geshs url_levens url_jaros url_lcss phone_geshs phone_levens phone_jaros phone_lcss 類別_geshs category_levens 類別_jaros 類別_lcss
0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3
0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3 0 1 2 3

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標籤:Python 熊猫 编辑距离 差异库

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