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如果我只能讀取一行并在記憶體中僅存盤一行,如何對文本檔案進行排序

2022-10-17 03:22:31 企業開發

我需要對由換行符分隔的大型文本檔案進行排序。

我需要假設輸入資料太大而無法放入主記憶體,這意味著我只能在記憶體中讀取和存盤檔案的一行。因此,我無法制作用于經典排序演算法(如合并排序、快速排序等)的串列或陣列,因此我被卡住了。

一個人怎么能解決這樣的問題?

uj5u.com熱心網友回復:

在實踐中,一般情況下,只需要使用 Unix 的sort命令即可。

LC_ALL=C sort file_in.txt > file_out.txt

對于一個非常大的檔案,我會去分布式使用排序構建到 mapreduce 中。請參閱MapReduce 排序演算法如何作業?關于那個是如何作業的。一個提示,如果你去分布式,保持分布式。也就是說,輸入檔案、輸出檔案和操作都應該在分布式檔案系統上,這樣你就不會在任何一臺機器上遇到瓶頸。

恰好有一次,我遇到了這兩個不起作用的情況。情況是我需要對來自資料庫的資料集進行排序和組織,但資料太大而無法在資料庫中排序,并且我所在的機器沒有空間容納原始資料集。

我用合并排序解決了這個問題,其中所有超過一定大小的塊都保存在壓縮檔案中。關鍵邏輯是這樣的:

for row in big query:
    last_chunk = new chunk from row
    chunk = None
    while 0 < len(chunks):
        chunk = chunks.pop()
        if chunk.size < 1.2 * last_chunk.size:
            last_chunk = merge(chunk, last_chunk)
        else:
            break
    if chunk is not None:
        chunks.append(chunk)
    chunks.append(last_chunk)
while 1 < len(chunks):
    chunks.append(merge(chunks.pop(), chunks.pop()))

然后在合并邏輯中,我推理了一個塊是否應該在記憶體中或壓縮檔案中結束,如何獲取行以及如何撰寫它們。

(我的問題并沒有這么簡單,因為我正在分組、求和、合并等。基本上復制了一個我無法在資料庫中運行的報告,因為它沒有足夠的作業記憶體來運行它。)

這三個涵蓋了我個人遇到的大檔案的所有情況。


這是基于外部檔案的合并排序的一個不是很好但有效的實作。

首先,您需要demo.txt我們要排序:

hello
world
greetings
earthlings

現在 Python 代碼按排序順序列印它:

from tempfile import TemporaryFile

class FileBuffer():
    def __init__ (self):
        self.current_line = None
        self.fh = TemporaryFile()
        self.state = 'writing'
        self.size = 0

    def add (self, line):
        if self.state != 'writing':
            raise Exception(f"Cannot write to FileBuffer in state {self.state}")
        self.size  = len(line)
        self.fh.write(bytes(line, encoding='utf-8'))

    def finish_writing (self):
        self.fh.seek(0, 0)
        self.state = 'reading'
        self.fetch()
        return self.current_line

    def fetch (self):
        if self.state != 'reading':
            raise Exception(f"Cannot read from FileBuffer in state {self.state}")
        self.current_line = bytes.decode(self.fh.readline())
        if self.current_line == '':
            self.current_line = None
            self.state = 'done'
        return self.current_line

    def __iter__(self):
        return self

    def __next__(self):
        line = self.current_line
        if line is None:
            raise StopIteration
        else:
            self.fetch()
            return line
class BufferedSort():
    def __init__ (self):
        self.buffers = []

    def merge (self):
        buffer1 = self.buffers.pop()
        buffer2 = self.buffers.pop()
        new_buffer = FileBuffer()

        while buffer1.current_line is not None and buffer2.current_line is not None:
            if buffer1.current_line < buffer2.current_line:
                new_buffer.add(buffer1.current_line)
                buffer1.fetch()
            else:
                new_buffer.add(buffer2.current_line)
                buffer2.fetch()

        while buffer1.current_line is not None:
            new_buffer.add(buffer1.current_line)
            buffer1.fetch()

        while buffer2.current_line is not None:
            new_buffer.add(buffer2.current_line)
            buffer2.fetch()

        new_buffer.finish_writing()
        self.buffers.append(new_buffer)

    def add (self, line):
        buffer = FileBuffer()
        buffer.add(line)
        buffer.finish_writing()
        self.buffers.append(buffer)
        while 1 < len(self.buffers) and self.buffers[-2].size < 1.2 * self.buffers[-1].size:
            self.merge()

    def finish_writing(self):
        while 2 < len(self.buffers):
            self.merge()

    def sorted_buffer(self):
        self.finish_writing()
        if len(self.buffers):
            return self.buffers[0]
        else:
            buffer = FileBuffer()
            buffer.state = 'done'
            return buffer

    def __iter__(self):
        return self.sorted_buffer()

sorter = BufferedSort()
with open("demo.txt") as fh:
    for line in fh:
        sorter.add(line)
for line in sorter:
    print(line, end="")

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qiye/514779.html

標籤:Python算法排序文本文件

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