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有沒有一種簡單的方法可以用蠻力演算法計算兩個圖的圖編輯距離?

2022-01-29 03:14:25 區塊鏈

在不使用 networkx 內置函式的情況下,是否有一種簡單的蠻力演算法可以計算G1和之間的圖形編輯距離G2

我在網上搜索,但我只能找到很難的最優解

uj5u.com熱心網友回復:

這是一個非常低效的程序,但它確實解決了問題。這個想法是從“編輯圖”進行類似 Dijkstra 的最短路徑搜索,其中編輯圖中的節點表示圖,兩個節點之間有一條邊G_aG_b如果有一個編輯需要G_aG_b. 請注意,您將需要一個函式is_isomorphic(Gx,Gy)來測驗是否是GxGy構圖(您可以通過檢查所有節點排列來檢查,同樣非常昂貴)。

尋找最短編輯距離的演算法如下:

initialize: current_node as  G1,
            visited_nodes as G1,
            current_minimum_cost_dictionary={G1:0}
            #overload == for Graph Class so that G==F iff is_isomorphic(G,F)
while G2 not in visited nodes:
    cost = current_minimum_cost_dictionary[G2]
    neighbor_graphs_set = calculate_distinct_neighbor_nodes(current_node)
        for graph in neighbor_graphs_set:
            if graph not in visited_nodes:
                visited_nodes.push(graph)
                current_minimum_cost_dictionary[graph] = cost   1
            else:
                current_minimum_cost_dictionary[graph] = min(cost   1, current_minimum_cost_dictionary[graph])
    #set current_node to the Graph with the minimum value in current_minimum_cost
return current_minimum_cost_dictionary(G2)
        
 
 

            

calculate_distinct_neighbor_nodes回傳作為輸入圖鄰居的一組不同圖(直到同構)。如果 x 可以通過 1 次編輯從 y 獲得(反之亦然),則兩個圖 x,y 是鄰居。

uj5u.com熱心網友回復:

根據 Juan Carlos Ramirez 的回復(他給出了演算法的偽代碼),我終于實作了我期待的丑陋的 brutforce 演算法。正如對話中提到的,它只處理小圖,因為復雜性是指數級的。以下 Python 代碼使用:

  1. networkx (用于圖形操作)
  2. algorithmx (用于圖形 2D 渲染)
  from networkx.classes.function import nodes
  
  import algorithmx
  import networkx as nx
  from algorithmx.networkx import add_graph
  
  canvas1 = algorithmx.jupyter_canvas()
  canvas2 = algorithmx.jupyter_canvas()
  # Create a directed graph
  G1 = nx.Graph()
  G2 = nx.Graph()
  
  # G1.add_edges_from([(1, 2), (7, 4), (2, 7),(3, 7)])
  # G2.add_edges_from([(1, 2), (3, 4), (2, 3), (3, 5)])
  
  G1.add_edges_from([(1, 2), (5, 4), (2, 5),(3, 5)])
  G2.add_edges_from([(1, 2), (3, 4), (2, 3), (3, 1)])
  
  
  
  def graph_distance(G1, G2):
    tmp_graphs = []
    next_graphs = [G1]
    dist = 0
    nId = 1000
  
    while 1:
      print(dist)
      for graph in next_graphs:
        if nx.is_isomorphic(graph, G2): # Check isomorphism for each built graph
          return dist
  
  
        new_graph = graph.copy()
        new_graph.add_node(len(graph.nodes))
        tmp_graphs.append(new_graph) # Add one vertex (that will be connected to the rest of the graph in the next iterations)
  
        graph_copy = graph.copy()
        for node in graph.nodes : # Add edge
          for newNeighbour in graph.nodes :
            if not graph.has_edge(node, newNeighbour):
              new_graph = graph.copy()
              new_graph.add_edge(node, newNeighbour)
              tmp_graphs.append(new_graph)
        
        for node in graph.nodes : # Delete edge
          for newNeighbour in graph.nodes:
            if graph.has_edge(node, newNeighbour):
              new_graph = graph.copy()
              new_graph.remove_edge(node, newNeighbour)
              tmp_graphs.append(new_graph)
            
        for node in graph.nodes : # Delete vetex
          new_graph = graph.copy()
          new_graph.remove_node(node)
          tmp_graphs.append(new_graph)
  
      dist =1
      next_graphs = tmp_graphs
      tmp_graphs = []
      
      
   
        
  print("Graph edit distance is:",graph_distance(G1, G2))
  add_graph(canvas1, G1)
  add_graph(canvas2, G2)

  canvas1
  # canvas2

取消注釋 canvas1/canvas2 以顯示您想要的

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