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如何在組內連接ggplot中的分組點?

2022-05-18 05:39:18 區塊鏈

我有一個包含兩組的資料集 - 實驗組和控制組。每個參與者每組貢獻兩個回應,代表不同的學習方式。這些在下面帶有抖動的箱形圖中表示。我想使用 ggplot 將每個參與者的兩個回應與線條連接起來(因此對照組中的每條紅線都對應于對照組中的每條綠松石線),但是我不知道如何在條件下做到這一點。有人可以幫忙嗎?我是 R 新手,真的需要指導。

然后,如果增加 = TRUE,我需要將條件內線條的顏色更改為黑色,如果增加 = FALSE,我需要將線條的顏色更改為紅色。

理想情況下,我需要它看起來像 Jon 的示例,但使用基于 True 或 False 的黑色或紅色線條:Connecting grouped points with lines in ggplot

資料和 ggplot 如下所示:

d <- data.frame (
  Subject = c("1", "2", "3", "4"),
  Group  = c("Exp", "Exp", "Control", "Control"),
  Tr = c("14", "11", "4", "23"),
  Sr = c("56", "78", "12", "10"),
  Increase = c("TRUE", "TRUE", "TRUE", "FALSE")
)

# put the data in long format
d <- d %>%
  gather(key = "Strategy", value = "raw", Tr, Sr)

d %>%
  ggplot(aes(x = Group, y = raw, color = Strategy))  
  geom_boxplot(width = 0.5, lwd = 0.5)  
  geom_jitter(width = 0.15)  
  geom_line(aes(group = raw),
            color = "grey",
            arrow = arrow(type = "closed",
                          length = unit(0.075, "inches"))) 

uj5u.com熱心網友回復:

靈感來自您鏈接到的答案- @Jon 的答案

有幾個關鍵的事情要理解解決方案

  1. 由于您需要連接點和線,因此您需要它們都應用完全相同的隨機抖動,或者最好在資料進入繪圖之前抖動資料,這就是我所做的。
  2. 由于要應用抖動的變數不是數字,因此請注意 R 將字符向量繪制Group為一個因子,解釋為數字 1,2,3,.. 對應于因子級別。因此,我們創建了一個數值向量 group_jit,其值在 1 和 2 左右,其偏移量基于著色變數Strategy,在 1 和 2 左右略微左右移動。
  3. 由于您有兩個獨立的色標,因此最好將組表示為fill,將線條表示為colour,以避免單個圖例上有 4 個東西。

這是代碼 -

library(tidyverse)

# Load data
d <- data.frame (
  Subject = c("1", "2", "3", "4"),
  Group  = c("Exp", "Exp", "Control", "Control"),
  Tr = c("14", "11", "4", "23"),
  Sr = c("56", "78", "12", "10"),
  Increase = c("TRUE", "TRUE", "TRUE", "FALSE")
)

width_jitter <- 0.2 # 1 means full width between points

# put the data in long format
d_jit <- d %>%
  gather(key = "Strategy", value = "raw", Tr, Sr) %>% 
  
  # type conversions
  mutate(across(c(Group, Strategy), as_factor)) %>% # convert to factors
  mutate(raw = as.numeric(raw)) %>% # make raw as numbers
  
  # position on x axis is based on combination of Group and jittered Strategy. Mix to taste.
  mutate(group_jit = as.numeric(Group)   jitter(as.numeric(Strategy) - 1.5) * width_jitter * 2,
         grouping = interaction(Subject, Strategy))

# plotting
d_jit %>%
  ggplot(aes(x = Group, y = raw, fill = Strategy))  
  geom_boxplot(width = 0.5, lwd = 0.5, alpha = 0.05, show.legend = FALSE)  
  geom_point(aes(x = group_jit), size = 3, shape = 21)  
  
  geom_line(aes(x = group_jit,
                group = Subject,
                colour = Increase),
            alpha = 0.5,
            arrow = arrow(type = "closed",
                          length = unit(0.075, "inches"))
            )   
  scale_colour_manual(values = c('red', 'black'))

如何在組內連接ggplot中的分組點?

reprex 包于 2022-05-14 創建(v2.0.1)

為了完整起見,進行抖動的另一種更優雅的方法是為and命令提供一個position引數,該函式會像這樣添加隨機抖動(來源:@erocoar 的答案geom_pointgeom_line

position = ggplot2::position_jitterdodge(dodge.width = 0.75, jitter.width = 0.3, seed = 1)

這樣資料本身不會改變,并且繪圖會處理抖動細節

  • jitterdodge是否閃避(x 軸變數的偏移)和抖動(彩色點的小噪聲)
  • 這里的seed引數是關鍵,因為它確保為獨立呼叫它的點和線函式回傳相同的隨機值

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qukuanlian/476669.html

標籤:r ggplot2 阴谋

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