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查詢其他兩個陣列對齊的陣列

2022-06-22 19:45:55 區塊鏈

我有 3 個陣列,x,yq. 陣列xy具有相同長度的,q是一個查詢陣列。假設x和中的所有值q都是唯一的。對于 的每個值q,我想在 中找到對應值的索引x然后我想在y. 如果 fromq中沒有出現值x,我想回傳np.nan

作為一個具體示例,請考慮以下陣列:

x = np.array([1, 2, 3])                                                                  
y = np.array([4, 5, 6])                                                                  
q = np.array([2, 0])                                                                     

因為只有值 2 出現在 中x,所以正確的回傳值是:

out = np.array([5, np.nan])                                                              

使用 for 回圈,可以這樣做:

out = []                                                                                 
for i in range(len(q)):                                                                  
    for j in range(len(x)):                                                              
        if np.allclose(q[i], x[j]):                                                      
            out.append(y[j])                                                             
            break                                                                        
    else:                                                                                
        out.append(np.nan)                                                               
output = np.array(out)                                                                     

顯然,這是相當緩慢的。有沒有更簡單的方法可以使用 numpy 內置函式來做到這一點np.argwhere或者使用熊貓會更容易嗎?

uj5u.com熱心網友回復:

Numpy 廣播應該可以作業。

# a mask that flags any matches
m = q == x[:, None]
# replace any value in q without any match in x by np.nan
res = np.where(m.any(0), y[:, None] * m, np.nan).sum(0)
res
# array([ 5., nan])

我應該注意,這僅x在沒有重復項的情況下才有效。


因為它依賴于構建len(x) x len(q)陣列,如果q很大,上面的解決方案會遇到記憶體問題。在這種情況下,另一個 pandas 解決方案將更有效地作業:

# map q to y via x
res = pd.Series(q).map(pd.Series(y, index=x)).values

uj5u.com熱心網友回復:

我認為您可以在一行中解決此問題,但使用一行和一些廣播:

out = [y[bl].item() if bl.any() else None for bl in x[None,:]==q[:,None] ]

在我看來,這是一個優雅的解決方案,但讀起來有點混亂。我會一步一步去。

  1. x[None,:]==q[:,None]將 q 中的每個值與 x 中的每個值進行比較并回傳(len(q),len(x)布爾陣列(在這種情況下為[[False,True,False], [False,False,False]]
  2. 您可以使用具有相同長度的布爾陣列對 y 進行索引len(y)所以你可以呼叫y[ [False,True,False] ]來獲取 y[1] 的值。
  3. 如果 bool 陣列包含所有 false 那么你必須放一個None所以這就是為什么使用if-else

uj5u.com熱心網友回復:

這里也是如何使用np.argwhere使用更舒適的 Pandas 或 numpy。

out_idx = [y[np.argwhere(x==value).reshape(-1)] for value in q]
out = [x[0] if len(x) else np.nan for x in out_idx]

uj5u.com熱心網友回復:

這是一種解決您的問題的方法:

query_results = pd.DataFrame(index=q).join(pd.DataFrame({'y':y}, index=x)).T.to_numpy()[0]

輸出:

[ 5. nan]

uj5u.com熱心網友回復:

如果性能是這個問題的主要目標,您可以使用 numba 庫和 jitting 加速回圈代碼,這將非常快:

x = np.random.permutation(2000)[:1100]
y = np.random.permutation(2000)[:1100]
q = np.random.permutation(3000)[:500]
print((q > 2000).sum())


@nb.njit
def numba_(x, y, q):
    out = []
    for i in range(len(q)):
        for j in range(len(x)):
            if q[i] == x[j]:
                out.append(y[j])
                break
        else:
            out.append(np.nan)
    return np.array(out)

或并行模式:

@nb.njit(parallel=True)
def numba_p(x, y, q):
    out = np.empty(q.shape[0])
    out.fill(np.nan)
    for i in nb.prange(q.shape[0]):
        for j in range(x.shape[0]):
            if q[i] == x[j]:
                out[i] = y[j]
                break
    return out

在大型陣列上,它比非機器人答案 ( np.where)constantstranger答案快得多,并且對于非機器人答案 (Pandas)幾乎相同

100 loops, best of 5: 4.4  ms per loop          <-- not a robot       (np.where)
100 loops, best of 5: 337  μs per loop          <-- not a robot       (Pandas)
100 loops, best of 5: 350  μs per loop          <-- numba
100 loops, best of 5: 341  μs per loop          <-- numba_p
100 loops, best of 5: 2.18 ms per loop          <-- constantstranger  (Pandas)

注意在新版本中將在性能方面得到很大改進np.where這可以幫助非機器人答案在更大的陣列上擊敗常量陌生人答案。

更新: 在我對更大陣列的新測驗中,不是機器人答案(熊貓)要快得多(最快)。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qukuanlian/494400.html

標籤:Python 数组 熊猫 麻木的

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