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R:根據值范圍重置資料框中的值

2022-11-22 15:11:29 區塊鏈

我有一個像這樣的資料框:

# generate data frame
df = as.data.frame(cbind(c('Chr1', 'Chr1', 'Chr1', 'Chr2', 'Chr2', 'Chr2', 'Chr3', 'Chr3', 'Chr4', 'Chr4', 'Chr5'), 
                         c(121, 1567, 2489, 23, 565, 1789, 551, 1987, 25, 2356, 1111)))
colnames(df) = c('Chr', 'Pos')
df$Pos = as.numeric(df$Pos)
df
    Chr  Pos
1  Chr1  121
2  Chr1 1567
3  Chr1 2489
4  Chr2   23
5  Chr2  565
6  Chr2 1789
7  Chr3  551
8  Chr3 1987
9  Chr4   25
10 Chr4 2356
11 Chr5 1111

現在,我想根據列Pos的當前值更改列中的值。例如,如果Pos<= 1000 中的值,則應500在新列中分配,如果值 <= 2000 但 > 1000,則應1000在新列中分配,等等。

簡單的方法df看起來像這樣:

# alter dataframe
df$Pos = ifelse(df$Pos <= 1000, 500, df$Pos)
df$Pos = ifelse(df$Pos <= 2000 & df$Pos > 1000, 1500, df$Pos)
df$Pos = ifelse(df$Pos <= 3000 & df$Pos > 2000, 2500, df$Pos)
df
    Chr  Pos
1  Chr1  500
2  Chr1 1500
3  Chr1 2500
4  Chr2  500
5  Chr2  500
6  Chr2 1500
7  Chr3  500
8  Chr3 1500
9  Chr4  500
10 Chr4 2500
11 Chr5 1500

這會產生所需的輸出。但是,我的真實資料集要大得多,我無法為每個要重置的值范圍添加額外的條件。因此,我正在尋找更有效的解決方案。這是我嘗試更有效的解決方案:

# generate reference vectors
bin = seq(from = 1000, by = 1000, length.out = 3)
pos = seq(from = 500, by = 1000, length.out = 3)

# reset values
df$Pos = ifelse(df$Pos <= bin & df$Pos > bin-1000, pos, df$Pos)
df

但是,這會引發一條警告訊息:

Warning messages:
1: In df$Pos <= bin :
  longer object length is not a multiple of shorter object length
2: In df$Pos > bin - 1000 :
  longer object length is not a multiple of shorter object length

并且輸出看起來不對(一些值已被重置,其他值尚未重置):

> df
    Chr  Pos
1  Chr1  500
2  Chr1 1500
3  Chr1 2500
4  Chr2  500
5  Chr2  565
6  Chr2 1789
7  Chr3  500
8  Chr3 1500
9  Chr4   25
10 Chr4 2356
11 Chr5 1500

我也嘗試用Map函式解決我的問題,但這也沒有用。請參閱下面的嘗試Map

df2 = Map(function(bin, bin2, pos) {
  df2 = ifelse(df$Pos <= 1000 & df$Pos > bin2, pos, df$Pos)
}, bin, bin-1000, pos)
df2
[[1]]
 [1]  500 1567 2489  500  500 1789  500 1987  500 2356 1111

[[2]]
 [1]  121 1567 2489   23  565 1789  551 1987   25 2356 1111

[[3]]
 [1]  121 1567 2489   23  565 1789  551 1987   25 2356 1111

我覺得我是從一個完全錯誤的角度來解決這個問題的。任何人都知道如何解決這段代碼?

uj5u.com熱心網友回復:

您可以借助cutfindInterval

bin = c(0, seq(from = 1000, by = 1000, length.out = 3))
pos = seq(from = 500, by = 1000, length.out = 3)

df$new_value <- cut(df$Pos, bin, pos)
#cut returns factor output, to change to numbers use the below code
df$new_value <- as.numeric(as.character(df$new_value))
df

#    Chr  Pos new_value
#1  Chr1  121       500
#2  Chr1 1567      1500
#3  Chr1 2489      2500
#4  Chr2   23       500
#5  Chr2  565       500
#6  Chr2 1789      1500
#7  Chr3  551       500
#8  Chr3 1987      1500
#9  Chr4   25       500
#10 Chr4 2356      2500
#11 Chr5 1111      1500

為了清楚和解釋答案,我創建了一個新列,如果您想這樣做,new_value您可以替換原始列。Pos

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qukuanlian/537928.html

標籤:r数据框if语句重置

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