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如何對具有最小閾值的numpy陣列中的分數總和進行分類

2021-10-20 18:16:00 .NET開發

我有一個包含 50 名患者和100 個評分資料點的 numpy 2D 陣列

scores = array([[7.0, 10.0, 12.0, ..., 0.0],
[0.0, 11.0, 34.0, ..., 1.0],
.
.
.
[0.0, 33.0, 34.0, ..., 50.0]])

每個分數都是一個非負浮點值,將根據范圍條件 {v < 20: 'A', 20 <= v 映射到類別 {a, b, c}(代表輕度、中度、嚴重) <= 50 : 'B', 50 <= v : 'C'}。這可以使用((25 < a) & (a < 100)).sum()as in this thread來完成

現在我需要每個患者類別,基于最大得分,他獲得,條件是該分配計數的類別的資料點是> =一定的閾值(比如20%)。

例如(以100 個資料點中的20%作為閾值):

  • 如果患者 i 得分為25 個資料點的嚴重程度為“C”-> 他被歸類為 C(嚴重)
  • 如果患者 i 獲得了15個嚴重程度為“C”的資料點15個嚴重程度為“B”的資料點 -> 他被歸類為 B(中等)。

有沒有辦法在 numpy 中自動做到這一點?

先感謝您。

更新: 預期輸出應該是格式相同的數字或患者 (50,) 長度的一維陣列 categories = ['A', 'C', 'A', .... 'B'],其中每個值是患者的總體類別。

uj5u.com熱心網友回復:

映射值

您可以使用numpy.select

scores = np.array([[7.0, 10.0, 12.0, 0.0],
                   [0.0, 11.0, 34.0, 55],
                   [55,55,0,44],
                   ])

out = np.select([scores<20, (20<=scores)&(scores<50), 50<=scores],
                ['A', 'B', 'C'])

輸出:

array([['A', 'A', 'A', 'A'],
       ['A', 'A', 'B', 'C'],
       ['C', 'C', 'A', 'B']], dtype='<U3')

獲得最頻繁

這里使用numpy.unique

categories np.unique(out, axis=1)[:,0]

輸出:

array(['A', 'A', 'C'], dtype='<U3')

uj5u.com熱心網友回復:

我一步完成

data = get_the_data()
data[:, :-1].sort()  # sort the data descending along the last dimension.
data_categorized = data[:, 20]  # Threshold is 20% at least
# Now I can categorize directly
out = np.select([data<20, (20<=data)&(data<50), 50<=data], ['A', 'B', 'C'])

我沒有對每個資料點進行分類,然后根據至少 20% 的嚴重程度閾值將患者作為一個整體進行分類,而是對陣列進行降序排序,然后將專案編號為 20(滿分 100)。

按降序排序,我確信當我選擇第 20 項時,它之前的所有項都具有相同或更高的嚴重性。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/net/326710.html

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