我有以下錯誤：
Bio.Application.ApplicationError: Non-zero return code 2 from ‘psiblast -out 7Bio.Application.ApplicationError: Non-zero return code 2 from ‘psiblast -out 7NDB_B_WT.out -query 7NDB_B_WT.fasta -db /mnt/research/common-data/Bio/blastdb/nr -evalue 5000 -num_iterations 3 -out_ascii_pssm 7NDB_B_WT.pssm’, message ‘BLAST Database error: No alias or index file found for protein database [/mnt/research/common-data/Bio/blastdb/nr] in search path [/media/leon//Machine_learning_model_binding_free_energy_BFE_change_predictions/TopNetmAb/7NDB/features/7NDB_B_A_344_S::]’NDB_B_WT.out -query 7NDB_B_WT.fasta -db /mnt/research/common-data/Bio/blastdb/nr -evalue 5000 -num_iterations 3 -out_ascii_pssm 7NDB_B_WT.pssm’, message ‘BLAST Database error: No alias or index file found for protein database [/mnt/research/common-data/Bio/blastdb/nr] in search path [/media/leon//Machine_learning_model_binding_free_energy_BFE_change_predictions/TopNetmAb/7NDB/features/7NDB_B_A_344_S::]’
我從blast 資料庫下載了“nr”檔案，并在目錄[/mnt/research/common-data/Bio/blastdb/nr] 中創建了一個資料庫鏈接。但錯誤仍然存??在。
拜托，有人可以幫我嗎？
uj5u.com熱心網友回復：
成功了！問題在于我解壓縮 nr 檔案的方式。以前我使用以下命令： $ formatdb -i nr.fa -p T
現在我使用了： $ makeblastdb -in nr.fa -dbtype prot -out nr
問題解決了。
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