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RDBI系結變數性能

2021-12-23 08:10:03 .NET開發

在 DBI 包中使用系結變數時,我面臨性能問題。我最初的用例是使用 Postgres 資料庫,但為了可重復性,下面我使用記憶體中的 SQLite,它具有完全相同的問題 - 當我通過 id 從某個表中選擇資料時(在 Postgres 中,列被索引)引數化版本運行多次選擇行數比在IN陳述句中粘貼 ID 的 SQL 更長

library(DBI)
library(tictoc)

sample.data <- data.frame(
  id = 1:100000,
  value = rnorm(100000)
)

sqlite <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), ":memory:")
dbWriteTable(
  sqlite, "sample_data",
  sample.data,
  overwrite = T
)

tic("Load by bind")
ids <- 50000:50100
res <- dbSendQuery(sqlite, "SELECT * FROM sample_data WHERE id = $1")
dbBind(res, list(ids))
result <- dbFetch(res)
dbClearResult(res)
toc()

# Load by bind: 0.81 sec elapsed

tic("Load by paste")
ids <- 50000:50100
result2 <- dbGetQuery(sqlite, paste0("SELECT * FROM sample_data WHERE id IN (", paste(ids, collapse = ","), ")"))
toc()

# Load by paste: 0.04 sec elapsed

似乎我應該有一些明顯的錯誤,因為準備好的查詢應該更快(我確實在同一個 Postgres 示例中使用 Python/SQLAlchemy 看到了它)。

uj5u.com熱心網友回復:

你的第一個查詢... id = $1被執行了 101 次;您的第二個查詢... id in (..)執行一次。如果您在 DBMS 端進行審計(此處不進行演示),那么您將看到 101 個單獨的查詢。

在前面,一個常見的錯誤是簡化修改陳述句以使用IN (?)子句,

dbGetQuery(pgcon, "SELECT * FROM sample_data WHERE id in (?)", params = list(ids))

但這也執行了 101 次查詢,感覺與result1.

要將引數系結與更有效的IN (..)子句一起使用,您需要提供那么多問號(或美元數字)。

bench::mark(
  result1 = dbGetQuery(sqlite, "SELECT * FROM sample_data WHERE id = $1", params = list(ids)),
  result2 = dbGetQuery(sqlite, paste0("SELECT * FROM sample_data WHERE id IN (", idcommas, ")")),
  result3 = dbGetQuery(sqlite, paste0("SELECT * FROM sample_data WHERE id IN (", qmarks, ")"),
                       params = as.list(ids)),
  min_iterations = 50
)
# # A tibble: 3 x 13
#   expression      min   median `itr/sec` mem_alloc `gc/sec` n_itr  n_gc total_time result             memory                  time          gc               
#   <bch:expr> <bch:tm> <bch:tm>     <dbl> <bch:byt>    <dbl> <int> <dbl>   <bch:tm> <list>             <list>                  <list>        <list>           
# 1 result1    280.97ms  347.4ms      2.86    20.6KB        0    50     0      17.5s <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [14 x 3]> <bch:tm [50]> <tibble [50 x 3]>
# 2 result2      7.31ms   8.21ms    115.      15.6KB        0    58     0    502.2ms <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [12 x 3]> <bch:tm [58]> <tibble [58 x 3]>
# 3 result3      7.57ms   8.93ms    113.      28.4KB        0    57     0      506ms <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [28 x 3]> <bch:tm [57]> <tibble [57 x 3]>

如果您好奇,它在 postgres 實體上執行相同(明顯更快)(盡管我將您更改$1?:sqlite 接受兩者,odbc/postgres 僅支持 qmarks):

pgcon <- dbConnect(odbc::odbc(), ...) # local docker postgres instance
bench::mark(...)
# # A tibble: 3 x 13
#   expression      min   median `itr/sec` mem_alloc `gc/sec` n_itr  n_gc total_time result             memory                  time          gc               
#   <bch:expr> <bch:tm> <bch:tm>     <dbl> <bch:byt>    <dbl> <int> <dbl>   <bch:tm> <list>             <list>                  <list>        <list>           
# 1 result1     967.4ms    1.05s     0.933    20.6KB        0    50     0     53.57s <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [14 x 3]> <bch:tm [50]> <tibble [50 x 3]>
# 2 result2        57ms   67.7ms    14.4      18.1KB        0    50     0      3.47s <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [13 x 3]> <bch:tm [50]> <tibble [50 x 3]>
# 3 result3      56.9ms  65.17ms    14.3      21.4KB        0    50     0       3.5s <df[,2] [101 x 2]> <Rprofmem[,3] [15 x 3]> <bch:tm [50]> <tibble [50 x 3]>

我還在 odbc/sql-server 上進行了測驗,結果非常相似。

result2并且result3通常在所有三個 DBMS 上都非常接近,實際上在不同的采樣中,前者比后者快,因此我將它們的性能比較稱為清洗。那么,使用系結的動機是什么?在許多情況下,這主要是學術討論:大多數時候,不使用它(而是使用您的paste(ids, collapse=",")方法)并沒有做錯任何事

然而:

  • 無意中的“sql 注入”。從技術上講,SQL 注入必須是惡意的才能被標記為這樣,但我非正式地將 SQL 查詢中的“哎呀”時刻歸因于資料嵌入了引號,并將其粘貼到靜態查詢字串中,我破壞了參考。對我來說幸運的是,它所做的只是破壞了查詢的決議,我沒有洗掉今年的學生記錄

    一個常見的錯誤是嘗試使用sQuote轉義嵌入引號。長話短說:不,SQL 的做法不同。許多 SQL 用戶不知道要轉義嵌入的單引號,必須將其加倍:

    sQuote("he's Irish")
    # [1] "'he's Irish'"                      # WRONG
    
    DBI::dbQuoteString(sqlite, "he's Irish")
    # <SQL> 'he''s Irish'                     # RIGHT for both sqlite and pgcon
    
  • 查詢優化。大多數(全部?我不確定)DBMS 會進行某種形式的查詢優化,試圖利用索引和/或類似措施。為了擅長它,這種優化對查詢進行一次,然后快取。但是,即使您更改查詢的一個字母,也可能會導致快取未命中(我不是說“總是”,因為我還沒有審核快取代碼……但我認為前提很清楚)。這意味著,從更改查詢select * from mytable where a=1... a=2沒有得到快取命中,并進行了優化(再次)。

    對比,與select * from mytable where a=?同引數結合,并從快取中受益。

    請注意,如果您的串列ids更改長度,那么查詢很可能會被重新優化(從 更改id in (?,?)id in (?,?,?));如果這真的是快取未命中,我不知道,同樣沒有審核 DBMSes 代碼。

順便說一句:您提到的“準備好的陳述句”與此查詢優化非常一致,但是您遇到的性能損失更多是關于運行相同查詢 101 次,而不是與快取命中/未命中有關的任何事情。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/net/390449.html

標籤:r PostgreSQL的 sqlite 分贝

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