主頁 > .NET開發 > 用R和ggplot2簡潔地再現下圖

用R和ggplot2簡潔地再現下圖

2021-12-28 11:33:03 .NET開發

我從用R和ggplot2簡潔地再現下圖

使用相同的想法,我嘗試使用我的資料如下:

library(tidyverse)
library(tidytable)
library(ggforce)
library(ggtext)
library(camcorder)
library(bibliometrix)
library(bibliometrixData)

data(management)

M <- metaTagExtraction(management, "AU_CO")

CO <- 
  tidytable(
      Country   = unlist(strsplit(M$AU_CO,";"))
    , year      = rep(M$PY, lengths(strsplit(M$AU_CO,";")))
    , nAuPerArt = rep(lengths(strsplit(M$AU_CO,";")),lengths(strsplit(M$AU_CO,";")))
  )

df0 <- 
  CO %>% 
  summarise.(
      frequency = length(Country)
    , frequencyFractionalized = sum(1/nAuPerArt)
    , .by = c(Country, year)
  ) %>% 
  arrange.(Country, year)

df1 <- 
  df0 %>% 
  mutate.(
      min_year  = min(year)
    , n_total   = sum(frequency)
    , .by       = Country
  ) %>% 
  mutate.(Country = fct_reorder(Country, min_year)) %>% 
  count(Country, n_total, min_year, year) %>% 
  mutate.(
      a_deg   = as.numeric(Country) * 2.7   8.5
    , a       = a_deg * pi/180
    , x       = -(year - min(year)   10) * cos(a   pi/2.07)
    , y       = (year - min(year)   10) * sin(a   pi/2.07)
    , label_a = ifelse(a_deg > 180, 270 - a_deg, 90 - a_deg)
    , h       = ifelse(a_deg > 180, 1, 0)
    , label   = ifelse(h == 0,
                       paste0(Country, " <span style = 'color:darkorange;'>(", n_total, ")</span>"),
                       paste0(" <span style = 'color:darkorange;'>(", n_total, ")</span>", Country))
  ) %>% 
  arrange.(as.character(Country), year)

df1
# df1 %>% view()


Years <- 
  tidytable(
    r = seq(
        from         = 10
      , to           = 280
      , length.out   = 12
    )
    , l = seq(from = min(df0$year), to = max(df0$year), by = 3)
  ) %>% 
  mutate.(
    lt = ifelse(row_number.() %% 2 == 0, "dotted", "solid")
  )

Years

f1 = "Porpora"

gg_record(dir = "temp", device = "png", width = 10, height = 11, units = "in", dpi = 320)

ggplot(data = df1)  
  # Purple points
  geom_point(data = df1, aes(x = x, y = y, size = n * 10), shape = 21, stroke = 0.15, fill = "purple")  
  # Year circles
  geom_circle(
    data = Years
    , aes(x0 = 0, y0 = 0, r = r, linetype = lt), size = 0.08, color = "grey50"
  )  
  # Year labels
  geom_label(
    data = Years
    , aes(x = 0, y = r, label = l), size = 3, family = f1, label.padding = unit(0.25, "lines"), label.size = NA, fill = "grey95", color = "grey70")  
  # Orange points (totals)
  geom_point(aes(x = -290 * cos(a   pi/2.07), y = 290 * sin(a   pi/2.07), size = n_total), stat = "unique", shape = 21, stroke = 0.5, fill = "orange")  
  # Family names and totals
  geom_richtext(aes(x = -305 * cos(a   pi/2.07),
                    y = 305 * sin(a   pi/2.07),
                    label = label,
                    angle = label_a,
                    hjust = h), stat = "unique", Country = f1, size = 3.5,
                fill = NA, label.color = NA, color = "#0b5029")  
  # Annotations
  annotate("text", 0, 293, label = "Total", Country = f1, color = "orange")  
  scale_size_continuous(range = c(0, 8))  
  scale_color_viridis_c(option = "turbo")  
  coord_fixed(clip = "off", xlim = c(-400, 400))  
  # labs(
  #   caption = "<span style = 'font-size:30px;'>Taxonomic publications, 1757-2021</span><br>
  #   Publications by family and year <span style = 'color:purple;'>(purple circles)</span>and total publications by family <span style = 'color:darkorange;'>(orange circles and text)</span><br>
  #    <span style = 'color:black;'>Source: World Spider Catalog - Graphic: Georgios Karamanis</span>"
  # )  
  theme_void()  
  theme(
    legend.position = "none",
    plot.background = element_rect(fill = "grey95", color = NA),
    plot.margin = margin(0, 20, 20, 20),
    plot.caption = element_markdown(family = f1, hjust = 0.5, margin = margin(100, 0, -100, 0), size = 14, lineheight = 1.4, color = "#0b5029")
  )

產生以下圖表

用R和ggplot2簡潔地再現下圖

但是,我在生成的圖表方面面臨兩個問題。

  1. 如何正確對齊粉紅色點?
  2. 如何使用整個圓圈作為國名?

已編輯

尋找可用于不同資料集的更簡潔和可重現的代碼。最好尋找可以處理不同資料集的通用函式。

uj5u.com熱心網友回復:

您可以在函式內對 x 和 y 值進行計算,以構建ggplot將圓一直延伸并為標簽提供正確高度的函式

我已經調整了一個函式來處理其他資料集。這需要一個整潔格式的資料集,其中:

  • '年' 列
  • 每個“事件”一行
  • 分組變數(例如國家/地區)

我使用這里的諾貝爾獎獲得者資料作為示例資料集來展示實際中的函式。資料設定:

library(tidyverse)
library(ggforce)
library(ggtext)

nobel <- read_csv("archive.csv")

# Filtering in this example to create a plottable dataset
nobel_filt <- nobel %>%
  mutate(country = fct_lump_n(factor(`Birth Country`), n = 50)) %>% 
  filter(country != "Other")

nobel_filt
#> # A tibble: 883 x 19
#>     Year Category   Prize Motivation `Prize Share` `Laureate ID` `Laureate Type`
#>    <dbl> <chr>      <chr> <chr>      <chr>                 <dbl> <chr>          
#>  1  1901 Chemistry  The ~ "\"in rec~ 1/1                     160 Individual     
#>  2  1901 Literature The ~ "\"in spe~ 1/1                     569 Individual     
#>  3  1901 Medicine   The ~ "\"for hi~ 1/1                     293 Individual     
#>  4  1901 Peace      The ~  <NA>      1/2                     462 Individual     
#>  5  1901 Peace      The ~  <NA>      1/2                     463 Individual     
#>  6  1901 Physics    The ~ "\"in rec~ 1/1                       1 Individual     
#>  7  1902 Chemistry  The ~ "\"in rec~ 1/1                     161 Individual     
#>  8  1902 Literature The ~ "\"the gr~ 1/1                     571 Individual     
#>  9  1902 Medicine   The ~ "\"for hi~ 1/1                     294 Individual     
#> 10  1902 Peace      The ~  <NA>      1/2                     464 Individual     
#> # ... with 873 more rows, and 12 more variables: Full Name <chr>,
#> #   Birth Date <date>, Birth City <chr>, Birth Country <chr>, Sex <chr>,
#> #   Organization Name <chr>, Organization City <chr>,
#> #   Organization Country <chr>, Death Date <date>, Death City <chr>,
#> #   Death Country <chr>, country <fct>

然后,此函式將資料框作為引數,以及要分組的列的名稱和標記時間段的列的名稱。它不是超級簡潔,因為有很多資料處理正在進行。但希望在一個函式中它更整潔。


circle_plot <- function(data, group_var, time_var) {

  df_full <-
    data %>%
    select(group = {{group_var}}, year = {{time_var}}) %>% 
    mutate(group = factor(group),
           group = fct_reorder(group, year, .fun = min),
           order = as.numeric(group))
  
    
  
  year_vals <-
    tibble(year = as.character(seq(min(df_full$year), max(df_full$year), 1)),
           level = 1   1:length(year))
  
  y_vals <- year_vals %>% 
    bind_rows(tribble(~ year, ~ level,
                      "total", max(year_vals$level)   5,
                      "title", max(year_vals$level)   10
    ))
  
  year_labs <-
    tibble(year = as.character(floor(seq(
      min(df_full$year), max(df_full$year), length.out = 10
    )))) %>%
    left_join(y_vals, by = "year")
  
  x_len <- max(df_full$order)
  
  df_ang <- df_full %>% 
    mutate(year = as.character(year)) %>% 
    count(group, order, year) %>% 
    left_join(y_vals, by = "year") %>% 
    mutate(a_deg = order * 350/x_len   5,
           x = - level * cos(a_deg * pi/180   pi/2.07),
           y = level * sin(a_deg * pi/180   pi/2.07))
  
  df_lab <- df_ang %>%
    group_by(group, a_deg) %>%
    summarise(n_total = n()) %>%
    mutate(
      group_name = str_trunc(as.character(group), 30),
      label_a = ifelse(a_deg > 180, 270 - a_deg, 90 - a_deg),
      h = ifelse(a_deg > 180, 1, 0),
      label = ifelse(
        h == 0,
        paste0(
          group_name,
          " <span style = 'color:darkorange;'>(",
          n_total,
          ")</span>"
        ),
        paste0(
          "<span style = 'color:darkorange;'>(",
          n_total,
          ")</span> ",
          group_name
        )
      ),
      year = "title"
    ) %>%
    left_join(y_vals, by = "year") %>%
    mutate(
      x = -level * cos(a_deg * pi / 180   pi / 2.07),
      y = level * sin(a_deg * pi / 180   pi / 2.07),
      total_x = -(level - 5) * cos(a_deg * pi / 180   pi / 2.07),
      total_y = (level - 5) * sin(a_deg * pi / 180   pi / 2.07)
    )
  
  
  ggplot()  
    geom_circle(
      data = year_labs,
      aes(
        x0 = 0,
        y0 = 0,
        r = level
      ),
      size = 0.08,
      color = "grey50"
    )  
    geom_label(
      data = year_labs,
      aes(x = 0, y = level, label = year),
      size = 3,
      label.padding = unit(0.25, "lines"),
      label.size = NA,
      fill = "grey95",
      color = "grey70"
    )  
    geom_point(
      data = df_ang,
      aes(x = x, y = y, size = n),
      shape = 21,
      stroke = 0.15,
      fill = "purple"
    )  
    geom_point(
      data = df_lab,
      aes(total_x, total_y,
        size = n_total
      ),
      stat = "unique",
      shape = 21,
      stroke = 0.5,
      fill = "orange"
    )  
    geom_richtext(
      data = df_lab,
      aes(x, y,
        label = label,
        angle = label_a,
        hjust = h
      ),
      stat = "unique",
      size = 4,
      fill = NA,
      label.color = NA,
      color = "#0b5029"
    )  
    annotate(
      "text",
      0,
      y = y_vals[y_vals$year=="total",]$level,
      label = "Total",
      color = "orange",
      size = 4,
      vjust = 0
    )  
    scale_size_continuous(range = c(1, 9))  
    scale_color_viridis_c(option = "turbo")  
    coord_fixed(clip = "off", xlim = c(-120, 120))  
    theme_void()  
    theme(
      legend.position = "none",
      plot.background = element_rect(fill = "grey95", color = NA),
      plot.margin = margin(100, 180, 150, 180),
    )
  
  }
  

circle_plot(nobel_filt, `Birth Country`, Year)

# ggsave("test.png", height = 10, width = 10)

這將創建以下圖表:

用R和ggplot2簡潔地再現下圖

最大的麻煩(正如您在此處看到的)將更改邊距以適應長標簽并匯出適合文本大小/年份圈數的繪圖大小。這可能必須在每個圖上進行試驗。您可以margin將函式內的呼叫調整為合理的默認值,或者theme向函式呼叫添加更多元素,如下所示:

circle_plot(nobel_filt, `Birth Country`, Year)  
  theme(plot.margin = margin(80, 150, 120, 150))

希望有幫助!

reprex 包(v2.0.1)于 2021 年 12 月 27 日創建

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/net/395365.html

標籤:r ggplot2 整理宇宙 数据可视化

上一篇:從函式呼叫的ggplot中的EXPSS標簽

下一篇:我想從我的ggplots中排除一個觀察/元組。我只想顯示每個國家而不是世界總數

標籤雲
其他(157675) Python(38076) JavaScript(25376) Java(17977) C(15215) 區塊鏈(8255) C#(7972) AI(7469) 爪哇(7425) MySQL(7132) html(6777) 基礎類(6313) sql(6102) 熊猫(6058) PHP(5869) 数组(5741) R(5409) Linux(5327) 反应(5209) 腳本語言(PerlPython)(5129) 非技術區(4971) Android(4554) 数据框(4311) css(4259) 节点.js(4032) C語言(3288) json(3245) 列表(3129) 扑(3119) C++語言(3117) 安卓(2998) 打字稿(2995) VBA(2789) Java相關(2746) 疑難問題(2699) 细绳(2522) 單片機工控(2479) iOS(2429) ASP.NET(2402) MongoDB(2323) 麻木的(2285) 正则表达式(2254) 字典(2211) 循环(2198) 迅速(2185) 擅长(2169) 镖(2155) 功能(1967) .NET技术(1958) Web開發(1951) python-3.x(1918) HtmlCss(1915) 弹簧靴(1913) C++(1909) xml(1889) PostgreSQL(1872) .NETCore(1853) 谷歌表格(1846) Unity3D(1843) for循环(1842)

熱門瀏覽
  • WebAPI簡介

    Web體系結構: 有三個核心:資源(resource),URL(統一資源識別符號)和表示 他們的關系是這樣的:一個資源由一個URL進行標識,HTTP客戶端使用URL定位資源,表示是從資源回傳資料,媒體型別是資源回傳的資料格式。 接下來我們說下HTTP. HTTP協議的系統是一種無狀態的方式,使用請求/ ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:07:47 more
  • asp.net core 3.1 入口:Program.cs中的Main函式

    本文分析Program.cs 中Main()函式中代碼的運行順序分析asp.net core程式的啟動,重點不是剖析原始碼,而是理清程式開始時執行的順序。到呼叫了哪些實體,哪些法方。asp.net core 3.1 的程式入口在專案Program.cs檔案里,如下。ususing System; us ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:07:49 more
  • asp.net網站作為websocket服務端的應用該如何寫

    最近被websocket的一個問題困擾了很久,有一個需求是在web網站中搭建websocket服務。客戶端通過網頁與服務器建立連接,然后服務器根據ip給客戶端網頁發送資訊。 其實,這個需求并不難,只是剛開始對websocket的內容不太了解。上網搜索了一下,有通過asp.net core 實作的、有 ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:08:02 more
  • ASP.NET 開源匯入匯出庫Magicodes.IE Docker中使用

    Magicodes.IE在Docker中使用 更新歷史 2019.02.13 【Nuget】版本更新到2.0.2 【匯入】修復單列匯入的Bug,單元測驗“OneColumnImporter_Test”。問題見(https://github.com/dotnetcore/Magicodes.IE/is ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:08:05 more
  • 在webform中使用ajax

    如果你用過Asp.net webform, 說明你也算是.NET 開發的老兵了。WEBform應該是2011 2013左右,當時還用visual studio 2005、 visual studio 2008。后來基本都用的是MVC。 如果是新開發的專案,估計沒人會用webform技術。但是有些舊版 ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:08:50 more
  • iis添加asp.net網站,訪問提示:由于擴展配置問題而無法提供您請求的

    今天在iis服務器配置asp.net網站,遇到一個問題,記錄一下: 問題:由于擴展配置問題而無法提供您請求的頁面。如果該頁面是腳本,請添加處理程式。如果應下載檔案,請添加 MIME 映射。 WindowServer2012服務器,添加角色安裝完.netframework和iis之后,運行aspx頁面 ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:10:00 more
  • WebAPI-處理架構

    帶著問題去思考,大家好! 問題1:HTTP請求和回傳相應的HTTP回應資訊之間發生了什么? 1:首先是最底層,托管層,位于WebAPI和底層HTTP堆疊之間 2:其次是 訊息處理程式管道層,這里比如日志和快取。OWIN的參考是將訊息處理程式管道的一些功能下移到堆疊下端的OWIN中間件了。 3:控制器處理 ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:11:13 more
  • 微信門戶開發框架-使用指導說明書

    微信門戶應用管理系統,采用基于 MVC + Bootstrap + Ajax + Enterprise Library的技術路線,界面層采用Boostrap + Metronic組合的前端框架,資料訪問層支持Oracle、SQLServer、MySQL、PostgreSQL等資料庫。框架以MVC5,... ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:15:18 more
  • WebAPI-HTTP編程模型

    帶著問題去思考,大家好!它是什么?它包含什么?它能干什么? 訊息 HTTP編程模型的核心就是訊息抽象,表示為:HttPRequestMessage,HttpResponseMessage.用于客戶端和服務端之間交換請求和回應訊息。 HttpMethod類包含了一組靜態屬性: private stat ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:15:23 more
  • 部署WebApi隨筆

    一、跨域 NuGet參考Microsoft.AspNet.WebApi.Cors WebApiConfig.cs中配置: // Web API 配置和服務 config.EnableCors(new EnableCorsAttribute("*", "*", "*")); 二、清除默認回傳XML格式 ......

    uj5u.com 2020-09-09 22:15:48 more
最新发布
  • C#多執行緒學習(二) 如何操縱一個執行緒

    <a href="https://www.cnblogs.com/x-zhi/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/2943582/20220801082530.png" alt="" /></...

    uj5u.com 2023-04-19 09:17:20 more
  • C#多執行緒學習(二) 如何操縱一個執行緒

    C#多執行緒學習(二) 如何操縱一個執行緒 執行緒學習第一篇:C#多執行緒學習(一) 多執行緒的相關概念 下面我們就動手來創建一個執行緒,使用Thread類創建執行緒時,只需提供執行緒入口即可。(執行緒入口使程式知道該讓這個執行緒干什么事) 在C#中,執行緒入口是通過ThreadStart代理(delegate)來提供的 ......

    uj5u.com 2023-04-19 09:16:49 more
  • 記一次 .NET某醫療器械清洗系統 卡死分析

    <a href="https://www.cnblogs.com/huangxincheng/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/214741/20200614104537.png" alt="" /&g...

    uj5u.com 2023-04-18 08:39:04 more
  • 記一次 .NET某醫療器械清洗系統 卡死分析

    一:背景 1. 講故事 前段時間協助訓練營里的一位朋友分析了一個程式卡死的問題,回過頭來看這個案例比較經典,這篇稍微整理一下供后來者少踩坑吧。 二:WinDbg 分析 1. 為什么會卡死 因為是表單程式,理所當然就是看主執行緒此時正在做什么? 可以用 ~0s ; k 看一下便知。 0:000> k # ......

    uj5u.com 2023-04-18 08:33:10 more
  • SignalR, No Connection with that ID,IIS

    <a href="https://www.cnblogs.com/smartstar/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/u36196.jpg" alt="" /></a>...

    uj5u.com 2023-03-30 17:21:52 more
  • 一次對pool的誤用導致的.net頻繁gc的診斷分析

    <a href="https://www.cnblogs.com/dotnet-diagnostic/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/3115652/20230225090434.png" alt=""...

    uj5u.com 2023-03-28 10:15:33 more
  • 一次對pool的誤用導致的.net頻繁gc的診斷分析

    <a href="https://www.cnblogs.com/dotnet-diagnostic/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/3115652/20230225090434.png" alt=""...

    uj5u.com 2023-03-28 10:13:31 more
  • C#遍歷指定檔案夾中所有檔案的3種方法

    <a href="https://www.cnblogs.com/xbhp/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/957602/20230310105611.png" alt="" /></a&...

    uj5u.com 2023-03-27 14:46:55 more
  • C#/VB.NET:如何將PDF轉為PDF/A

    <a href="https://www.cnblogs.com/Carina-baby/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/2859233/20220427162558.png" alt="" />...

    uj5u.com 2023-03-27 14:46:35 more
  • 武裝你的WEBAPI-OData聚合查詢

    <a href="https://www.cnblogs.com/podolski/" target="_blank"><img width="48" height="48" class="pfs" src="https://pic.cnblogs.com/face/616093/20140323000327.png" alt="" /><...

    uj5u.com 2023-03-27 14:46:16 more