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使用回圈移位計算排序陣列的交集的快速演算法

2022-10-27 04:59:17 .NET開發

我正在尋找一種更快的演算法來解決以下問題:

  • 輸入:兩個整數陣列,A范圍B[0, N),均為固定長度d,假定按排序順序給出,沒有重復元素。
  • 輸出:之間的最大可能交集(即共同元素的數量)A和回圈移位B是否大于某個指定的閾值t通過 的回圈移位B,我的意思是[(b s) % N for b in B]某個整數的陣列s

如果重要的話,我會在 Rust 中實作它(盡管我對一般演算法改進比對特定語言的優化更感興趣),實際上,t它會小于 10,d通常在 15 到 150 之間,并將N大致在2*d*d.

我當前的演算法基本上如下(注意,d并且N是在編譯時定義的常量):

fn max_shifted_overlap_geq(A: [u32; d], B: [u32; d], threshold: u32) -> bool {
    for i in 0..d {
        for j in 0..d {
            let s = N   A[i] - B[j];
            let mut B_s = [0; d];
            for k in 0..d {
                B_s[k] = (B[k]   s) % N;
            }
            B_s.sort();
            // Actually, I do an insertion-sort in place as I construct B_s,
            // but I'm writing it this way here for simplicity.
            if sorted_intersection_count(&A, &B_s) >= threshold {
                return true;
            }
        }
    }
    false
}

所以我只是從可能的值中選擇移位A[i] - B[j](因為不是這種形式的移位給出零交集),然后我只是構造回圈移位B并以相當幼稚的方式計算共同元素的數量。

有沒有更有效的演算法,記住陣列的大小相當小?特別是,有沒有更好的方法來找到更可能產生大重疊的變化?

編輯:為了提供額外的背景關系(如下要求),這出現在 QC-MDPC 代碼的研究中:陣串列示生成奇偶校驗矩陣的回圈塊的二進制向量的支持,并且這個條件與回圈移位定義了一類具有一些密碼含義的“弱密鑰”。(我最初沒有提到這一點,因為這個問題看起來很有趣,并且不需要任何編碼理論或密碼學知識。)

編輯 2:修復了代碼中的一些拼寫錯誤,并切換到一種更好的方法來計算排序串列的交叉點。(奇怪的是,我實際上在早期版本中使用了改進的演算法,并且代碼運行速度較慢,但??這可能是由于實作錯誤或代碼中其他地方現已修復的問題。)

編輯 3:對于遇到類似問題的任何人的未來參考,這是我當前的實作,使用下面 virchau13 答案的關鍵思想以及一些小的額外優化。這在實踐中似乎非常有效。(為了清楚起見,我重命名了一些變數——arr1以及arr2輸入陣列,而LEN不是d陣列長度。)

fn relative_shifts(arr1: &[u32; LEN], arr2: &[u32; LEN]) -> [[u32; LEN]; LEN] {
    let n = N as u32;
    let mut shifts = [[0; LEN]; LEN];
    for i in 0..LEN {
        for j in 0..LEN {
            shifts[i][j] = if arr1[i] < arr2[j] {
                n   arr1[i] - arr2[j]
            } else {
                arr1[i] - arr2[j]
            }; // this equals (arr1[i] - arr2[j]) % n
        }
    }
    shifts
}
fn max_shifted_overlap_geq(arr1: &[u32; LEN], arr2: &[u32; LEN], threshold: u8) -> bool {
    let shifts = relative_shifts(arr1, arr2);
    let mut shift_counts = [0; N];
    for i in 0..LEN {
        for j in 0..LEN {
            let count = &mut shift_counts[shifts[i][j] as usize];
            *count  = 1;
            if *count >= threshold {
                return true;
            }
        }
    }
    false
}

幾個實作說明:

  1. 這可以很容易地修改為產生最大可能的交集作為一個值(通過在超過閾值時取最大值而不是短路)或一組索引對(通過也將索引對附加(i, j)到與每個班次關聯的串列中s因為它是計算出來的)。
  2. 我們不需要假設陣列是排序的。就此而言,我認為我們也不需要假設陣列的長度相同,盡管我還沒有針對不同長度的陣列進行測驗。

uj5u.com熱心網友回復:

我認為可以將演算法降低到 O(d^2)。這只是(未經測驗的)猜測。

對于兩個元素A[i]B[j]要回圈相等,(B[j] s) % N必須相等A[i]如果s = s_orig滿足這個方程,那么s = s_orig % n也滿足這個方程,這意味著我們可以限制s0 <= s < N使用這個限制,我們可以證明兩個元素回圈相等當且僅當B[j] s等于A[i]or A[i] N(因為0 <= A[i],B[i] < N),這與說s必須等于A[i] - B[j]or相同N A[i] - B[j]但是,由于0 <= s < N,第一項僅在差為正或為零時才有意義,而第二項僅在差為負時才有意義;即我們可以說s必須等于運算式if A[i] - B[j] < 0 { N A[i] - B[j] } else { A[i] - B[j] }另一種寫法是s = (N A[i] - B[j]) % N.

請注意,由于s每一對只有一個 的值,當且僅當它們中的每一個的值相同時(i,j),兩個(i1,j1)和對都重疊(i2,j2)s

所以這是最終的演算法:

  1. 首先列舉和之間所有可能的s回圈差異AB并將它們放入一個二維陣列中possible_values: [[usize; d]; d] possible_values[i][j] = (N A[i] - B[j]) % N這是 O(d^2)。

  2. 接下來,找到所有唯一s值(即 的唯一值possible_values[i][j])并將每個值具有的索引串列存盤s在 hashmapunique_possible_values: HashMap<usize, Vec<(usize, usize)>>中。這句話不是很清楚,所以這就是我的意思:

let unique_possible_values: HashMap<usize, Vec<(usize, usize)>> = HashMap::new();
for i in 0..d {
    for j in 0..d {
        let indexes_with_same_value = 
            unique_possible_values
                .entry(possible_values[i][j])
                .or_insert(Vec::new());
        indexes_with_same_value.push((i, j));
    }
}

換句話說,hashmap 的每個條目都存盤(i,j)共享相同possible_values[i][j]值的 2D 索引串列。這是 O(d^2)。

  1. 然后,對于每個唯一s值 ( for (s, indexes) in &unique_possible_values),計算它具有的回圈相等元素的數量。這等于唯一值的數量和唯一i值的數量j,可以及時計算O(indexes.len())我不打算為此撰寫代碼,但這應該不難,而且是 O(d^2) (因為您迭代的每個 2D 索引只發生一次)。

  2. 取步驟 3 中所有計數的最大值。這是最壞情況 O(d^2) 和平均情況顯著降低。這個最終值對應于 A 和 B 回圈交叉點的最大可能大小。

  3. 檢查該值是否超過threshold. 如果是,則回傳 true;否則,回傳假。

該演算法基本上列舉所有可能s的值并計算最大交叉點長度,但以一種有效的方式。

uj5u.com熱心網友回復:

您可以將每個輸入陣列轉換為長度為 N 的新向量,其中 1 表示出現的值,0 表示其他值。

然后計算兩個向量之間的回圈互相關,找到最大值——即最大交集的大小。

時間以相關計算為主,使用 FFT 技術需要 O(N log N) 時間。這比 d 3好,但它相當復雜,所以它是否會更快可能取決于 N 是否是 2 的冪以及具體實作。如果您有可用于 FFT 的 GPU,那么它會快得多。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/net/520459.html

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