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基于Docker的Python開發

2020-10-10 02:44:31 其他

作者|GUEST
編譯|VK
來源|Analytics Vidhya

在PyCharm和Visual Studio代碼上支持CUDA

介紹

如果你沒有經驗,建立一個開發環境是不容易的,特別是如果你想學習的技術很多,

本教程旨在向你展示如何在PyCharm或Visual Studio代碼中設定一個基于Docker的Python開發環境,并支持CUDA,

免責宣告

  • 在寫這篇文章的時候,我無法在Windows10 家庭版中使用Docker內部的CUDA(即使是內部版本),所以本教程是在考慮Linux的情況下實作的,盡管基本上沒有什么是特定于平臺的,

  • 只有在專業版上才能使用Docker作為PyCharm的遠程Python解釋器,

  • 我假設你已經在你的機器上安裝了Docker,

  • 我假設你已經在你的機器上安裝了CUDA,如果你仍在設定你的Linux機器,并且你不愿意研究太多,我通常推薦Pop作業系統(https://pop.system76.com/),在該文中(https://support.system76.com/articles/cuda/),你可以找到如何在他們的平臺上非常容易地設定CUDA和cuDNN,文章還提供了在Ubuntu上使用他們的包的說明,

專案結構

在本教程中,我使用了一個只有3個檔案的玩具專案:

生成容器的Dockerfile

requirements.txt包含專案依賴項的檔案,

run.py包含一些要運行的代碼的檔案,顯然,你的個人專案很可能更復雜,你可以使用不同的方法來管理依賴關系,你也可以使用docker-compose.yaml但為了實作我的例子這會毫無意義引入復雜性,

Dockerfile檔案

對于一篇更關注Docker和Dockerfiles的文章,我推薦Docker初學者指南:https://medium.com/codingthesmartway-com-blog/docker-beginners-guide-part-1-images-containers-6f3507fffc98

下面是我們的Dockerfile和一個簡短的注釋

FROM nvidia/cuda:10.2-devel

# 地址: https://github.com/ContinuumIO/docker-images/blob/master/miniconda3/debian/Dockerfile

ENV PATH /opt/conda/bin:$PATH

RUN apt-get update --fix-missing && \
    apt-get install -y wget bzip2 ca-certificates libglib2.0-0 libxext6 libsm6 libxrender1 git mercurial subversion && \
    apt-get clean

RUN wget --quiet https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O ~/miniconda.sh && \
    /bin/bash ~/miniconda.sh -b -p /opt/conda && \
    rm ~/miniconda.sh && \
    /opt/conda/bin/conda clean -tipsy && \
    ln -s /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh /etc/profile.d/conda.sh && \
    echo ". /opt/conda/etc/profile.d/conda.sh" >> ~/.bashrc && \
    echo "conda activate base" >> ~/.bashrc && \
    find /opt/conda/ -follow -type f -name '*.a' -delete && \
    find /opt/conda/ -follow -type f -name '*.js.map' -delete && \
    /opt/conda/bin/conda clean -afy

# 專案設定

WORKDIR /code

COPY requirements.txt .

RUN pip install -r requirements.txt

COPY . .

CMD ["python", "./run.py"]

通俗地說,Dockerfile描述了生成Docker鏡像的程序,該鏡像隨后用于創建Docker容器,這個Dockerfile檔案建立在nvidia/cuda:10.2-devel,鏡像由NVIDIA直接在DockerHub中提供:https://hub.docker.com/r/nvidia/cuda,

nvidia/cuda:10.2-devel是已經安裝了CUDA10.2工具包的開發鏡像

現在你只需要安裝Python開發所需的東西并設定我們的專案,

在Dockerfile的中間部分有一個Miniconda3安裝,我決定使用Miniconda而不是僅僅使用Python,因為它是我大多數專案的首選平臺,

我們沒有利用Miniconda的任何功能,所以這有點過頭了,將Miniconda替換成Dockerfile中的Python,這是留給讀者的一個練習(不要驚慌,只需使用與新的Ubuntu設備相同的命令),

最后一節是關于專案設定的,我們只是安裝依賴項,復制鏡像作業目錄中的所有檔案,并選擇在沒有指定命令的情況下呼叫docker run時啟動的命令,

要構建Docker鏡像,只需使用你選擇的shell導航到包含Dockerfile的路徑并運行:

docker build -t <image_name> .

這將生成配置描述的Docker鏡像,并將其命名為image_name,如果在名稱中沒有指定標記,則使用最新的作為默認值,要指定標記,只需在冒號后寫入,

在本教程的其余部分中,我將使用pytorch-development-box這個名稱,

requirements.txt

我只使用Pytorch和Torchvision作為這個專案的依賴項,我經常使用這些包,我會使用他們的CUDA可用性方法來檢查是否一切正常,所以我的requirements.txt是:

torch
torchvision

run.py

我的Python檔案非常簡單,我只是檢查CUDA是否可用,

import torch.cuda

if torch.cuda.is_available():
    print("CUDA is available :D")
else:
    print("CUDA isn't available :(")

設定PyCharm

只有在PyCharm Professional上才能使用Docker的遠程Python解釋器,那么,讓我們看看如何設定它,

構建好Docker鏡像并在PyCharm中打開專案檔案夾后,導航到File > Settings > Project > Python Interpreter

你應該看到這樣的畫面:

現在單擊右上角附近的小齒輪并添加一個新的Python解釋器,

在這里,你需要選擇Docker并在名為image name的下拉選單中選擇之前選擇的鏡像名稱,如下所示:

確認此配置后,請等待索引完成,然后嘗試運行run.py.

CUDA isn't available :(

在這一點上,我們沒有配置讓Docker使用GPU,但我們可以快速修復它,

打開自動生成的運行/除錯配置,并在Docker容器設定的末尾添加--gpus all

你應該得到這樣的結果:

確認此配置并運行它,CUDA結果現在可用!

設定Visual Studio代碼

我將依靠新的Visual Studio代碼的遠程開發擴展來設定通過Docker的開發,

第一步是安裝遠程開發擴展包并打開專案檔案夾:https://marketplace.visualstudio.com/items?itemName=ms-vscode-remote.vscode-remote-extensionpack

使用VisualStudio palette中的“Add Development Container Configuration Files”命令,

選擇使用自己的Dockerfile,

此時devcontainer.json檔案將被創建到一個.devcontainer目錄中,如下所示:

// For format details, see https://aka.ms/vscode-remote/devcontainer.json or this file's README at:
// https://github.com/microsoft/vscode-dev-containers/tree/v0.128.0/containers/docker-existing-dockerfile
{
	"name": "Existing Dockerfile",

	// Sets the run context to one level up instead of the .devcontainer folder.
	"context": "..",

	// Update the 'dockerFile' property if you aren't using the standard 'Dockerfile' filename.
	"dockerFile": "../Dockerfile",

	// Set *default* container specific settings.json values on container create.
	"settings": { 
		"terminal.integrated.shell.linux": null
	},

	// Add the IDs of extensions you want installed when the container is created.
	"extensions": []

	// Use 'forwardPorts' to make a list of ports inside the container available locally.
	// "forwardPorts": [],

	// Uncomment the next line to run commands after the container is created - for example installing curl.
	// "postCreateCommand": "apt-get update && apt-get install -y curl",

	// Uncomment when using a ptrace-based debugger like C++, Go, and Rust
	// "runArgs": [ "--cap-add=SYS_PTRACE", "--security-opt", "seccomp=unconfined" ],

	// Uncomment to use the Docker CLI from inside the container. See https://aka.ms/vscode-remote/samples/docker-from-docker.
	// "mounts": [ "source=/var/run/docker.sock,target=/var/run/docker.sock,type=bind" ],

	// Uncomment to connect as a non-root user. See https://aka.ms/vscode-remote/containers/non-root.
	// "remoteUser": "vscode"
}

將彈出一個提示,要求在容器中重新打開該檔案夾,

在此之前,我們只需要選擇一些在容器中開發時使用的擴展,

轉到Extensions選項卡,瀏覽你需要的擴展,你可以右鍵單擊并選擇Add to devcontainer,將它們添加到配置中,

現在我們只需要添加一個runArgs鍵來啟用GPU,我們就可以開始開發了,

減去注釋,你應該得到這樣的結果:

{
	"name": "Existing Dockerfile",
	"context": "..",
	"dockerFile": "../Dockerfile",
	"settings": {
		"terminal.integrated.shell.linux": null
	},
	"extensions": [
		"ms-python.python"
	],
	// This was added!
	"runArgs": [ 
		"--gpus=all"
	]
}

現在從命令面板,我們可以重建和重新打開容器

結論

現在你已經在IDE中配置了一個非常基本的開發環境,它基于你自己的Docker鏡像,所有這些都支持GPU,

原文鏈接:https://www.analyticsvidhya.com/blog/2020/08/docker-based-python-development-with-cuda-support-on-pycharm-and-or-visual-studio-code/

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