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做一些資料處理時出現下面報錯,請問如何修改,萬分感謝!!!(腳本和報錯都貼出了)

2020-09-13 04:03:04 其他

萬分感謝!!!!


腳本如下

#coding: utf-8
import pprint
import re
import matplotlib.pyplot as plt

ZongBuShu = 1000000  
filename = 'species.out'
wendu = 'PH 2200K'
dump = 400
timestep_start = 0
timestep_end = ZongBuShu



#拆分每個species的分子,保存成新的字典
def ChaiFenFenZiShi(FenZi):
    i = len(FenZi)
    FenZi_list = []
    while i != 0: 
        result = re.match('[CHON][\d]*',FenZi)
        FenZi_list.append(result.group())
        Q = len(FenZi_list[len(FenZi_list)-1])
        FenZi = FenZi[Q:]
        i = len(FenZi)
    return FenZi_list
#計算相對分子質量
def JiSuanFenZiZhiLiang(FenZi):
    FenZi =  ChaiFenFenZiShi(FenZi)
    n = len(FenZi)
    i = 0
    fenzizhiliang = 0
    yuanzizhiliang = 0
    while i < n:
        YuanZiZhongleiheshumu = FenZi[i]
        yuanzizhonglei = YuanZiZhongleiheshumu[0]
        if yuanzizhonglei == 'C':
            yuanzizhiliang = 12
        elif yuanzizhonglei == 'H':
            yuanzizhiliang = 1
        elif yuanzizhonglei == 'O':
            yuanzizhiliang = 16
        elif yuanzizhonglei == 'N':
            yuanzizhiliang = 14
        yuanzishu = YuanZiZhongleiheshumu.strip(yuanzizhonglei)
        if len(yuanzishu) == 0:
            yuanzishu =1
        else:
             yuanzishu = int(yuanzishu)
        fenzizhiliang = fenzizhiliang + yuanzizhiliang*yuanzishu
        i = i+1
    return fenzizhiliang  

#判斷每個species的種類,重油輕油還是氣體組分
def PanDuanZhongLei(FenZi):
    FenZi =  ChaiFenFenZiShi(FenZi)
    n = len(FenZi)
    i = 0
    yuanzizhiliang = 0
    while i < n:
        YuanZiZhongleiheshumu = FenZi[i]
        yuanzizhonglei = YuanZiZhongleiheshumu[0]
        if yuanzizhonglei == 'C':
            yuanzishu = YuanZiZhongleiheshumu.strip(yuanzizhonglei)
            if len(yuanzishu) == 0:
                yuanzishu = 1
            else:
                yuanzishu = int(yuanzishu)
            if yuanzishu <= 4:
                return '氣體組分'
                break
            elif yuanzishu > 4 and yuanzishu <= 13:
                return '輕質焦油'
            elif yuanzishu > 13 and yuanzishu <=39:
                return '重質焦油'
            elif yuanzishu > 39 :
                return '半焦'
        else:
            pass
        i = i+1
    return '氣體組分'

#將輸入檔案轉化成兩個字典,bushu和ZiDian
def TongJiShengChengWu(filename):
    file = open(filename)
    content_partA = file.readline()
    BANJIAO_ZHANBI_TOTAL = []
    ZHONGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL = []
    QINGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL = []
    QITI_ZHANBI_TOTAL = []
    while content_partA != '':
        content_partB = file.readline()
        A_LIST = content_partA.split()
        B_LIST = content_partB.split()
    
        TIMESTEP = B_LIST[0]
        No_Moles = B_LIST[1]
        No_Specs = B_LIST[2]
        A_LIST = A_LIST[4:] 
        B_LIST = B_LIST[3:]

      
        BANJIAO_ZUFEN = []
        BANJIAO_NUMBER = []
        ZHONGZHIJIAOYOU_ZUFEN = []
        ZHONGZHIJIAOYOU_NUMBER = []
        QINGZHIJIAOYOU_ZUFEN = []
        QINGZHIJIAOYOU_NUMBER = []
        QITI_ZUFEN = []
        QITI_NUMBER = []
        i = 0
        FENZI_ZONGZHILIANG = - 450*18
        BANJIAO_ZONGZHILIANG = 0
        ZHONGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG = 0
        QINGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG = 0
        QITI_ZONGZHILIANG = 0
        while i < len(A_LIST):
            FENZI = A_LIST[i]
            FENZI_NUMBER = B_LIST[i]
            FENZI_ZHILIANG = JiSuanFenZiZhiLiang(FENZI)
            FENZI_TYPE = PanDuanZhongLei(FENZI)
            FENZI_ZONGZHILIANG = FENZI_ZONGZHILIANG + int(FENZI_ZHILIANG) * int(FENZI_NUMBER)
            
            if FENZI_TYPE == '半焦':
                BANJIAO_ZUFEN.append(FENZI)
                BANJIAO_NUMBER.append(FENZI_NUMBER)
                BANJIAO_ZONGZHILIANG = BANJIAO_ZONGZHILIANG + int(FENZI_ZHILIANG) * int(FENZI_NUMBER)
            if FENZI_TYPE == '重質焦油':
                ZHONGZHIJIAOYOU_ZUFEN.append(FENZI)
                ZHONGZHIJIAOYOU_NUMBER.append(FENZI_NUMBER)
                ZHONGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG = ZHONGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG + int(FENZI_ZHILIANG) * int(FENZI_NUMBER)
            if FENZI_TYPE == '輕質焦油':
                QINGZHIJIAOYOU_ZUFEN.append(FENZI)
                QINGZHIJIAOYOU_NUMBER.append(FENZI_NUMBER)
                QINGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG = QINGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG + int(FENZI_ZHILIANG) * int(FENZI_NUMBER)
            if FENZI_TYPE == '氣體組分':
                QITI_ZUFEN.append(FENZI)
                QITI_NUMBER.append(FENZI_NUMBER)
                QITI_ZONGZHILIANG = QITI_ZONGZHILIANG + int(FENZI_ZHILIANG) * int(FENZI_NUMBER)
      
            i = i + 1
  
        J1 = 0
        while J1 < len(BANJIAO_ZUFEN):
    
            J1 = J1 + 1
       
        J2 = 0
        while J2 < len(ZHONGZHIJIAOYOU_ZUFEN):
            J2 = J2 + 1
       
        J3 = 0
        while J3 < len(QINGZHIJIAOYOU_ZUFEN):
            
            J3 = J3 + 1
        J4 = 0
        while J4 < len(QITI_ZUFEN):
            J4 = J4 + 1
        BANJIAO_ZHANBI_TOTAL.append(BANJIAO_ZONGZHILIANG/FENZI_ZONGZHILIANG*100)
        ZHONGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL.append(ZHONGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG/FENZI_ZONGZHILIANG*100)
        QINGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL.append(QINGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG/FENZI_ZONGZHILIANG*100)
        QITI_ZHANBI_TOTAL.append((FENZI_ZONGZHILIANG-QINGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG-ZHONGZHIJIAOYOU_ZONGZHILIANG-BANJIAO_ZONGZHILIANG)/FENZI_ZONGZHILIANG*100)
        content_partA = file.readline()
    return BANJIAO_ZHANBI_TOTAL,ZHONGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL,QINGZHIJIAOYOU_ZHANBI_TOTAL,QITI_ZHANBI_TOTAL
def GET_X(timestep_start,timestep_end,dump):
    timestep_start = timestep_start
    timestep_end = timestep_end
    dump = dump
    X_zuobiao = []
    i = timestep_start
    while i < timestep_end:
        j = i/5000
        X_zuobiao.append(j)
        i =  i + dump
    return X_zuobiao
T = TongJiShengChengWu(filename)
X_zuobiao = GET_X(timestep_start,timestep_end,dump)
BANJIAO = T[0]
ZHONGZHIJIOAYOU = T[1]
QINGZHIJIAOYOU = T[2]
QITI = T[3]
#print(len(BANJIAO))

M1 = 0
SUM = 0
SUM_TOP = 0
BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU = []
while M1 < len(BANJIAO):
    SUM = BANJIAO[M1] + ZHONGZHIJIOAYOU[M1]
    BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU.append(SUM)
    M1 = M1 + 1
N1 = 0
BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU_QINGZHIJIAOYOU = []
while N1 < len(BANJIAO):
    SUM_TOP = BANJIAO[N1] + ZHONGZHIJIOAYOU[N1] + QINGZHIJIAOYOU[N1]
    BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU_QINGZHIJIAOYOU.append(SUM_TOP)
    N1 = N1 +1



print(BANJIAO[-5:-1])
BANJIAO_FILENAME = 'banjiao_' + filename
BANJIAO_FILE = open(BANJIAO_FILENAME,'w')
BANJIAO_FILE.write(str(BANJIAO))
BANJIAO_FILE.close()

plt.figure(figsize=(6,4))
plt.title(wendu,fontsize = '16',weight = 'bold')
plt.xlabel('Time(ps)',fontsize = '16',weight = 'bold')
plt.ylabel('Percent(%)',fontsize = '16',weight = 'bold')
plt.xticks(fontsize = '14',weight = 'bold')
plt.yticks(fontsize = '14',weight = 'bold')
width = 0.1

p1 = plt.bar(X_zuobiao, BANJIAO, width, color='blue', label = 'w')  
p2 = plt.bar(X_zuobiao, ZHONGZHIJIOAYOU, width, bottom=BANJIAO,color='green',label = 'e')
p3 = plt.bar(X_zuobiao, QINGZHIJIAOYOU, width, bottom=BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU,color='red',label = 'r')
p4 = plt.bar(X_zuobiao, QITI, width, bottom=BANJIAO_ZHONGZHIJIAOYOU_QINGZHIJIAOYOU,color='black',label = 't')
plt.subplots_adjust(left = 0.15)
plt.subplots_adjust(bottom = 0.15)
#plt.legend(bbox_to_anchor=[1, 1])
plt.savefig(wendu + '.png')
#plt.show()






[b]報錯如下[/b]

RESTART: C:\Users\84358\Desktop\zufen\2\species分析腳本3.0(PH組分演變).py ======
[219.22695738354804, 219.78196233894946, 223.21110009910802, 219.46481665014866]
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\84358\Desktop\zufen\2\species分析腳本3.0(PH組分演變).py", line 214, in <module>
    p1 = plt.bar(X_zuobiao, BANJIAO, width, color='blue', label = 'w')
  File "C:\Users\84358\AppData\Local\Programs\Python\Python37\lib\site-packages\matplotlib\pyplot.py", line 2472, in bar
    **({"data": data} if data is not None else {}), **kwargs)
  File "C:\Users\84358\AppData\Local\Programs\Python\Python37\lib\site-packages\matplotlib\__init__.py", line 1431, in inner
    return func(ax, *map(sanitize_sequence, args), **kwargs)
  File "C:\Users\84358\AppData\Local\Programs\Python\Python37\lib\site-packages\matplotlib\axes\_axes.py", line 2432, in bar
    np.atleast_1d(x), height, width, y, linewidth)
  File "<__array_function__ internals>", line 6, in broadcast_arrays
  File "C:\Users\84358\AppData\Local\Programs\Python\Python37\lib\site-packages\numpy\lib\stride_tricks.py", line 258, in broadcast_arrays
    shape = _broadcast_shape(*args)
  File "C:\Users\84358\AppData\Local\Programs\Python\Python37\lib\site-packages\numpy\lib\stride_tricks.py", line 189, in _broadcast_shape
    b = np.broadcast(*args[:32])
ValueError: shape mismatch: objects cannot be broadcast to a single shape

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qita/19825.html

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