1、度量準確性指標

1.1AlphaFold極大提高了蛋白質結構預測準確性

2. 原理及應用
2.1 論文介紹

2.2 原理
2.2.1 流程圖

2.2.2 搜索同源序列和模版

2.2.3 特征構造

2.2.4 特征表示

2.2.5 殘基對表示與MSA表示之間互相交換資訊






2.2.6 殘基的抽象表示轉換成具體的三維空間坐標







2.2.7 計算Loss:Frame aligned point error(FAPE)


2.3 訓練的5個模型

3. 安裝與使用
3.1 安裝教程
這里:AlphaFold2安裝程序、在線服務器及使用體驗
3.2 本地版與官方在線版區別

3.3 輸入和輸出檔案

3.4 使用Chimera可視化pLDDT

3.5 通過Colab使用AlphaFold2

3.6 比較本地版、AlphaFold DB和Colab得到的預測結構

參考視頻:
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