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Docker 鏡像封裝與深度學習代碼集成

2021-11-03 07:24:38 其他

Docker 安裝 www.baidu.com 一大坨安裝教程,看到你吐血!!!
按照規定的標準輸入與輸出格式開發演算法,將演算法封裝到Docker鏡像內,并將鏡像推送到官方倉庫中,提交鏡像檔案具體要求如下:

CUDA版本要求11.0;
構建鏡像時指定CMD作為默認執行的命令;
容器內禁止使用網路操作,否則會造成容器卡死,影響演算法執行;
資料輸入目錄為/input_path(容器內目錄),目錄權限只讀,此目錄對應資料組織結構中的test目錄;
資料輸出目錄為/output_path(容器內目錄),目錄權限可寫;
演算法入口程式為main.py,所在檔案夾為/work(容器內目錄),main.py需要讀取/input_path中的資料,并將結果輸出到/output_path;

下面是使用Dockerfile配置環境的示例和main.py示例:

Dockerfile示例:

# 基礎鏡像, cuda為11.0,ubuntu18.04
FROM cuda:11.0-cudnn8-runtime-ubuntu18.04  ##自行修改

# 配置程式依賴環境
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
         build-essential \
         cmake \
         curl \
         ca-certificates \
         libjpeg-dev \
         libpng-dev \
         python3 \
         python3-dev \
         python3-pip && \
     rm -rf /var/lib/apt/lists/*

# 安裝torch
RUN pip3 install torch==1.7.1+cu110 torchvision==0.8.2+cu110 torchaudio==0.7.2 -f https://download.pytorch.org/whl/torch_stable.html
RUN pip3 install matplotlib>=3.2.2
RUN pip3 install numpy>=1.18.5
RUN pip3 install scikit-build
RUN pip3 install setuptools>=33.1.1
RUN pip3 install Pillow
RUN pip3 install PyYAML>=5.3.1
RUN pip3 install scipy>=1.4.1
RUN pip3 install torch>=1.7.0
RUN pip3 install tqdm>=4.41.0
RUN pip3 install grpcio
RUN pip3 install tensorboard

RUN pip3 install seaborn>=0.11.0
RUN pip3 install pandas

RUN pip3 install opencv-python>=4.1.2
RUN python3 -m pip install detectron2 -f https://dl.fbaipublicfiles.com/detectron2/wheels/cu110/torch1.7/index.html
# 將程式復制到容器內的/work路徑下
COPY .  /work
#COPY ./weights/best.pt /work/weights/
# 容器啟動命令
CMD ["python3", "-u", "/work/main.py"]

1.main.py示例:

def fun(input_dir, output_dir):
    pass


if __name__ == '__main__':
    parser = argparse.ArgumentParser()
    # 資料集路徑
    parser.add_argument("--input_dir", default='/input_path', help="input path", type=str)
    # 輸出路徑
    parser.add_argument("--output_dir", default='/output_path', help="output path", type=str)
    args = parser.parse_args()
    start_time = time.time()
    torch.backends.cudnn.benchmark = True
    os.environ['CUDA_VISIBLE_DEVICES'] = '0'
    fun(args.input_dir, args.output_dir)
    print('total time:', time.time() - start_time)

2.構建鏡像
撰寫好Dockerfile后,與需要打包的程式放到同一個檔案夾下,然后進行以下步驟:

docker build -t docker.image/<image_name>:1.0.0 .

注意最后的.前面有空格.

3.測驗:
運行完成后可在/data/output_path/中查看輸出結果

docker run -it --rm -v /data/input_path/:/input_path -v /data/output_path/:/output_path docker.image/<image_name>:1.0.0

如果需要進行深度學習演算法更換,只需要替換main.py中的fun函式就可以.

4.Docker 中會用到的指令:

  1. 鏡像構建失敗,需要洗掉tag為的鏡像:
洗掉none的鏡像,要先洗掉鏡像中的容器,要洗掉鏡像中的容器,必須先停止容器,

$ docker images

$ docker rmi $(docker images | grep "none" | awk '{print $3}')
直接洗掉帶none的鏡像,直接報錯了,提示先停止容器,

$ docker stop $(docker ps -a | grep "Exited" | awk '{print $1 }') //停止容器

$ docker rm $(docker ps -a | grep "Exited" | awk '{print $1 }') //洗掉容器

$ docker rmi $(docker images | grep "none" | awk '{print $3}') //洗掉鏡像 
  1. 洗掉所有鏡像:
docker rmi -f $(docker images -qa)
  1. 容器操作:

查看運行容器

docker ps

查看所有容器

docker ps -a

進入容器

其中字串為容器ID:

1.  docker exec -it d27bd3008ad9 /bin/bash
2.  docker attach d27bd3008ad9

1.停用全部運行中的容器:

docker stop $(docker ps -q)

2.洗掉全部容器:

docker rm $(docker ps -aq)

3.一條命令實作停用并洗掉容器:

docker stop $(docker ps -q) & docker rm $(docker ps -aq)
  1. docker系統修剪

docker system prune了以下內容:

所有停止的容器
至少一個容器未使用的所有網路
所有懸空的影像
所有懸空的構建快取 

此清除命令將節省大量硬碟空間,

$ sudo docker system prune
 
WARNING! This will remove:
 1. all stopped containers
 2. all networks not used by at least one container
 3. all dangling images
 4. all dangling build cache
 
Are you sure you want to continue? [y/N] y
Deleted Containers:
10b3f08a93df89818976a29c26f5ccefbda1e2dc2e0205a02e9a3306590a1455
89d9cb3e102dbadc9d314bea0db5feb3110931727e2da0b88d6d88d7d78f4400
49e429f26db40615557a85fdf758cd66afa208dba03f74aea860bb04bb4772b2
3e36a2c0c241f8b815ddc73f398cae97962a6799c244fd5169cd845023c5b657
...
 
Deleted Images:
deleted: sha256:fe111236265a30b8ec54390defb5da60cc7b76a0d3ff0e883691b8b3c663f2e9
deleted: sha256:2e591f44cd334c7896ed01660d45099f4f58169d0584163b6009dea56c3abcbe
deleted: sha256:8b1c255bf0e627c789fc35b3b3b0a1e5033f6be612e01dca08eb1aa4fd161364
...
 
Total reclaimed space: 251.3MB
  1. docker 從鏡像中復制代碼到本地
docker cp <containerId>:/file/path/within/container /host/path/target

注意是containerId 不是 image Id .

如果剛拉取的鏡像, 先操作:

 1. sudo docker run -it your_docker_image:version /bin/bash

 2. docker ps -a

如果Version 是**<none>**,則用tag指令配置tag:

docker tag ec083d1555e4 docker.image/image_name:1.0.15

sudo docker cp -a 427870a03728:/work /home/yourPC/Desktop/1.0.8f/

查看對應鏡像的容器ID.繼續執行copy操作即可.

  1. 本地復制到docker image:
    建議使用Dockerfile的操作:
    有兩個類似Dockerfile指令,COPY或著ADD,這兩者都用于為包括在檔案中的影像

COPY指令和ADD指令的唯一區別在于是否支持從遠程URL獲取資源,COPY指令只能從執行docker build所在的主機上讀取資源并復制到鏡像中,而ADD指令還支持通過URL從遠程服務器讀取資源并復制到鏡像中,
滿足同等功能的情況下,推薦使用COPY指令,ADD指令更擅長讀取本地tar檔案并解壓縮,

  1. COPY指令

COPY指令能夠將構建命令所在的主機本地的檔案或目錄,復制到鏡像檔案系統,

exec格式用法(推薦):

COPY ["<src>",... "<dest>"],推薦,特別適合路徑中帶有空格的情況

shell格式用法:

COPY <src>... <dest>
  1. ADD指令
    ADD指令不僅能夠將構建命令所在的主機本地的檔案或目錄,而且能夠將遠程URL所對應的檔案或目錄,作為資源復制到鏡像檔案系統,
    所以,可以認為ADD是增強版的COPY,支持將遠程URL的資源加入到鏡像的檔案系統,ADD命令能對本地歸檔檔案進行解包而COPY不行,

exec格式用法(推薦):

ADD ["<src>",... "<dest>"],特別適合路徑中帶有空格的情況

shell格式用法:

ADD <src>... <dest>
將當前路徑下所有程式復制到容器內的/work路徑下
	COPY .  /work
  1. COPY指令和ADD指令的用法非常相似,具體注意事項如下:

    源路徑可以有多個
    源路徑是相對于執行build的相對路徑
    源路徑如果是本地路徑,必須是build背景關系中的路徑
    源路徑如果是一個目錄,則該目錄下的所有內容都將被加入到容器,但是該目錄本身不會
    目標路徑必須是絕對路徑,或相對于WORKDIR的相對路徑
    目標路徑如果不存在,則會創建相應的完整路徑
    目標路徑如果不是一個檔案,則必須使用/結束
    路徑中可以使用通配符

  2. 讀取URL遠程資源

RUN mkdir -p /usr/src/things \
    && curl -SL http://example.com/big.tar.xz \
    | tar -xJC /usr/src/things \
    && make -C /usr/src/things all
  1. 切換GPU docker中 nvidia-smi可查看GPU屬性
sudo docker run --gpus all nvidia/cuda:9.0-base nvidia-smi

至此,基本操作基本完成,有用都幫忙點個贊唄,寫檔案確實很耗時間,謝謝!

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/qita/345609.html

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