我有一個檔案,其中第二列包含感興趣的值。我正在嘗試遍歷一組數字 (n) 并使用 R 計算該列中 n-5:n 5 范圍內的值出現的次數。然后我希望將其輸出到.csv(但到目前為止還沒有將其寫入代碼)。
我一直在使用:
library(expss)
SNP_file <- read.csv("testdata.csv", header = FALSE, sep = "\t")
for (n in 31130:31150) {
SNP_Number <- 0
SNP_Number <- count_if(n-5:n 5, SNP_file$V2)
df <- data.frame(column1 = c(n), column2 = c(SNP_Number))
print(df)
}
在 testdata.csv 中,第二列中有 31140 和 31141 的值。
這將回傳如下輸出:
column1 column2
1 31130 1
column1 column2
1 31131 1
column1 column2
1 31132 1
column1 column2
1 31133 1
column1 column2
1 31134 1
column1 column2
1 31135 1
column1 column2
1 31136 1
column1 column2
1 31137 1
column1 column2
1 31138 1
column1 column2
1 31139 1
column1 column2
1 31140 2
column1 column2
1 31141 3
column1 column2
1 31142 3
column1 column2
1 31143 3
column1 column2
1 31144 3
column1 column2
1 31145 3
column1 column2
1 31146 3
column1 column2
1 31147 3
column1 column2
1 31148 3
column1 column2
1 31149 3
column1 column2
1 31150 3
但這開始是因為錯誤地記錄了初始值 1,其中應該是值 0,每次 n 超過 testdata.csv 中的另一個值時,它只會增加,并且一旦 n 在范圍 n-5:n 5。
所以它應該看起來像:
column1 column2
1 31130 0
column1 column2
1 31131 0
column1 column2
1 31132 0
column1 column2
1 31133 0
column1 column2
1 31134 0
column1 column2
1 31135 1
column1 column2
1 31136 2
column1 column2
1 31137 2
column1 column2
1 31138 2
column1 column2
1 31139 2
column1 column2
1 31140 2
column1 column2
1 31141 2
column1 column2
1 31142 2
column1 column2
1 31143 2
column1 column2
1 31144 2
column1 column2
1 31145 2
column1 column2
1 31146 1
column1 column2
1 31147 0
column1 column2
1 31148 0
column1 column2
1 31149 0
column1 column2
1 31150 0
我在這里做錯了什么?
uj5u.com熱心網友回復:
嘗試這個:
vec <- c(22761L, 31140L, 31141L, 36701L, 44108L, 46917L, 51958L, 53661L, 119844L, 119845L, 184836L, 195026L, 249733L, 251024L, 271357L, 287257L, 360638L, 382559L, 384590L, 399027L)
sapply(31130:31150, function(z) sum( (z-5) <= vec & vec <= (z 5) ))
# [1] 0 0 0 0 0 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 0 0 0 0
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