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Spark性能優化指南

2020-11-19 14:31:19 資料庫

1 Spark開發調優篇

原則一:避免創建重復的RDD

原則二:盡可能復用同一個RDD

原則三:對多次使用的RDD進行持久化

原則四:盡量避免使用shuffle類算子

因此在我們的開發程序中,能避免則盡可能避免使用reduceByKey、join、distinct、repartition等會進行shuffle的算子,盡量使用map類的非shuffle算子,這樣的話,沒有shuffle操作或者僅有較少shuffle操作的Spark作業,可以大大減少性能開銷,

原則五:使用map-side預聚合的shuffle操作

原則六:使用高性能的算子

1. 使用reduceByKey/aggregateByKey替代groupByKey

詳情見“原則五:使用map-side預聚合的shuffle操作”,

2. 使用mapPartitions替代普通map

mapPartitions類的算子,一次函式呼叫會處理一個partition所有的資料,而不是一次函式呼叫處理一條,性能相對來說會高一些,但是有的時候,使用mapPartitions會出現OOM(記憶體溢位)的問題,因為單次函式呼叫就要處理掉一個partition所有的資料,如果記憶體不夠,垃圾回收時是無法回收掉太多物件的,很可能出現OOM例外,所以使用這類操作時要慎重!

3. 使用foreachPartitions替代foreach

原理類似于“使用mapPartitions替代map”,也是一次函式呼叫處理一個partition的所有資料,而不是一次函式呼叫處理一條資料,在實踐中發現,foreachPartitions類的算子,對性能的提升還是很有幫助的,比如在foreach函式中,將RDD中所有資料寫MySQL,那么如果是普通的foreach算子,就會一條資料一條資料地寫,每次函式呼叫可能就會創建一個資料庫連接,此時就勢必會頻繁地創建和銷毀資料庫連接,性能是非常低下;但是如果用foreachPartitions算子一次性處理一個partition的資料,那么對于每個partition,只要創建一個資料庫連接即可,然后執行批量插入操作,此時性能是比較高的,實踐中發現,對于1萬條左右的資料量寫MySQL,性能可以提升30%以上,

4. 使用filter之后進行coalesce操作

通常對一個RDD執行filter算子過濾掉RDD中較多資料后(比如30%以上的資料),建議使用coalesce算子,手動減少RDD的partition數量,將RDD中的資料壓縮到更少的partition中去,因為filter之后,RDD的每個partition中都會有很多資料被過濾掉,此時如果照常進行后續的計算,其實每個task處理的partition中的資料量并不是很多,有一點資源浪費,而且此時處理的task越多,可能速度反而越慢,因此用coalesce減少partition數量,將RDD中的資料壓縮到更少的partition之后,只要使用更少的task即可處理完所有的partition,在某些場景下,對于性能的提升會有一定的幫助,

5. 使用repartitionAndSortWithinPartitions替代repartition與sort類操作

repartitionAndSortWithinPartitions是Spark官網推薦的一個算子,官方建議,如果需要在repartition重磁區之后,還要進行排序,建議直接使用repartitionAndSortWithinPartitions算子,因為該算子可以一邊進行重磁區的shuffle操作,一邊進行排序,shuffle與sort兩個操作同時進行,比先shuffle再sort來說,性能可能是要高的,

原則七:廣播大變數

原則八:使用Kryo優化序列化性能

原則九:優化資料結構

2 Spark資源調優篇

num-executors

  • 引數說明:該引數用于設定Spark作業總共要用多少個Executor行程來執行,Driver在向YARN集群管理器申請資源時,YARN集群管理器會盡可能按照你的設定來在集群的各個作業節點上,啟動相應數量的Executor行程,這個引數非常之重要,如果不設定的話,默認只會給你啟動少量的Executor行程,此時你的Spark作業的運行速度是非常慢的,
  • 引數調優建議:每個Spark作業的運行一般設定50~100個左右的Executor行程比較合適,設定太少或太多的Executor行程都不好,設定的太少,無法充分利用集群資源;設定的太多的話,大部分佇列可能無法給予充分的資源,

executor-memory

  • 引數說明:該引數用于設定每個Executor行程的記憶體,Executor記憶體的大小,很多時候直接決定了Spark作業的性能,而且跟常見的JVM OOM例外,也有直接的關聯,
  • 引數調優建議:每個Executor行程的記憶體設定4G8G較為合適,但是這只是一個參考值,具體的設定還是得根據不同部門的資源佇列來定,可以看看自己團隊的資源佇列的最大記憶體限制是多少,num-executors乘以executor-memory,是不能超過佇列的最大記憶體量的,此外,如果你是跟團隊里其他人共享這個資源佇列,那么申請的記憶體量最好不要超過資源佇列最大總記憶體的1/31/2,避免你自己的Spark作業占用了佇列所有的資源,導致別的同學的作業無法運行,

executor-cores

  • 引數說明:該引數用于設定每個Executor行程的CPU core數量,這個引數決定了每個Executor行程并行執行task執行緒的能力,因為每個CPU core同一時間只能執行一個task執行緒,因此每個Executor行程的CPU core數量越多,越能夠快速地執行完分配給自己的所有task執行緒,
  • 引數調優建議:Executor的CPU core數量設定為2~4個較為合適,同樣得根據不同部門的資源佇列來定,可以看看自己的資源佇列的最大CPU core限制是多少,再依據設定的Executor數量,來決定每個Executor行程可以分配到幾個CPU core,同樣建議,如果是跟他人共享這個佇列,那么num-executors * executor-cores不要超過佇列總CPU core的1/3~1/2左右比較合適,也是避免影響其他同學的作業運行,

driver-memory

  • 引數說明:該引數用于設定Driver行程的記憶體,
  • 引數調優建議:Driver的記憶體通常來說不設定,或者設定1G左右應該就夠了,唯一需要注意的一點是,如果需要使用collect算子將RDD的資料全部拉取到Driver上進行處理,那么必須確保Driver的記憶體足夠大,否則會出現OOM記憶體溢位的問題,

spark.default.parallelism

  • 引數說明:該引數用于設定每個stage的默認task數量,這個引數極為重要,如果不設定可能會直接影響你的Spark作業性能,
  • 引數調優建議:Spark作業的默認task數量為500~1000個較為合適,很多同學常犯的一個錯誤就是不去設定這個引數,那么此時就會導致Spark自己根據底層HDFS的block數量來設定task的數量,默認是一個HDFS block對應一個task,通常來說,Spark默認設定的數量是偏少的(比如就幾十個task),如果task數量偏少的話,就會導致你前面設定好的Executor的引數都前功盡棄,試想一下,無論你的Executor行程有多少個,記憶體和CPU有多大,但是task只有1個或者10個,那么90%的Executor行程可能根本就沒有task執行,也就是白白浪費了資源!因此Spark官網建議的設定原則是,設定該引數為num-executors * executor-cores的2~3倍較為合適,比如Executor的總CPU core數量為300個,那么設定1000個task是可以的,此時可以充分地利用Spark集群的資源,

spark.storage.memoryFraction

  • 引數說明:該引數用于設定RDD持久化資料在Executor記憶體中能占的比例,默認是0.6,也就是說,默認Executor 60%的記憶體,可以用來保存持久化的RDD資料,根據你選擇的不同的持久化策略,如果記憶體不夠時,可能資料就不會持久化,或者資料會寫入磁盤,
  • 引數調優建議:如果Spark作業中,有較多的RDD持久化操作,該引數的值可以適當提高一些,保證持久化的資料能夠容納在記憶體中,避免記憶體不夠快取所有的資料,導致資料只能寫入磁盤中,降低了性能,但是如果Spark作業中的shuffle類操作比較多,而持久化操作比較少,那么這個引數的值適當降低一些比較合適,此外,如果發現作業由于頻繁的gc導致運行緩慢(通過spark web ui可以觀察到作業的gc耗時),意味著task執行用戶代碼的記憶體不夠用,那么同樣建議調低這個引數的值,

spark.shuffle.memoryFraction

  • 引數說明:該引數用于設定shuffle程序中一個task拉取到上個stage的task的輸出后,進行聚合操作時能夠使用的Executor記憶體的比例,默認是0.2,也就是說,Executor默認只有20%的記憶體用來進行該操作,shuffle操作在進行聚合時,如果發現使用的記憶體超出了這個20%的限制,那么多余的資料就會溢寫到磁盤檔案中去,此時就會極大地降低性能,
  • 引數調優建議:如果Spark作業中的RDD持久化操作較少,shuffle操作較多時,建議降低持久化操作的記憶體占比,提高shuffle操作的記憶體占比比例,避免shuffle程序中資料過多時記憶體不夠用,必須溢寫到磁盤上,降低了性能,此外,如果發現作業由于頻繁的gc導致運行緩慢,意味著task執行用戶代碼的記憶體不夠用,那么同樣建議調低這個引數的值,

資源引數的調優,沒有一個固定的值,需要同學們根據自己的實際情況(包括Spark作業中的shuffle運算元量、RDD持久化運算元量以及spark web ui中顯示的作業gc情況),同時參考本篇文章中給出的原理以及調優建議,合理地設定上述引數,

資源引數參考示例

./bin/spark-submit 
  --master yarn-cluster 
  --num-executors 100 
  --executor-memory 6G 
  --executor-cores 4 
  --driver-memory 1G 
  --conf spark.default.parallelism=1000 
  --conf spark.storage.memoryFraction=0.5 
  --conf spark.shuffle.memoryFraction=0.3 

3 Spark資料傾斜調優篇

解決方案一:使用Hive ETL預處理資料

方案適用場景:導致資料傾斜的是Hive表,如果該Hive表中的資料本身很不均勻(比如某個key對應了100萬資料,其他key才對應了10條資料),而且業務場景需要頻繁使用Spark對Hive表執行某個分析操作,那么比較適合使用這種技術方案,

方案實作思路:此時可以評估一下,是否可以通過Hive來進行資料預處理(即通過Hive ETL預先對資料按照key進行聚合,或者是預先和其他表進行join),然后在Spark作業中針對的資料源就不是原來的Hive表了,而是預處理后的Hive表,此時由于資料已經預先進行過聚合或join操作了,那么在Spark作業中也就不需要使用原先的shuffle類算子執行這類操作了,

方案實作原理:這種方案從根源上解決了資料傾斜,因為徹底避免了在Spark中執行shuffle類算子,那么肯定就不會有資料傾斜的問題了,但是這里也要提醒一下大家,這種方式屬于治標不治本,因為畢竟資料本身就存在分布不均勻的問題,所以Hive ETL中進行group by或者join等shuffle操作時,還是會出現資料傾斜,導致Hive ETL的速度很慢,我們只是把資料傾斜的發生提前到了Hive ETL中,避免Spark程式發生資料傾斜而已,

方案優點:實作起來簡單便捷,效果還非常好,完全規避掉了資料傾斜,Spark作業的性能會大幅度提升,

方案缺點:治標不治本,Hive ETL中還是會發生資料傾斜,

方案實踐經驗:在一些Java系統與Spark結合使用的專案中,會出現Java代碼頻繁呼叫Spark作業的場景,而且對Spark作業的執行性能要求很高,就比較適合使用這種方案,將資料傾斜提前到上游的Hive ETL,每天僅執行一次,只有那一次是比較慢的,而之后每次Java呼叫Spark作業時,執行速度都會很快,能夠提供更好的用戶體驗,

專案實踐經驗:在美團·點評的互動式用戶行為分析系統中使用了這種方案,該系統主要是允許用戶通過Java Web系統提交資料分析統計任務,后端通過Java提交Spark作業進行資料分析統計,要求Spark作業速度必須要快,盡量在10分鐘以內,否則速度太慢,用戶體驗會很差,所以我們將有些Spark作業的shuffle操作提前到了Hive ETL中,從而讓Spark直接使用預處理的Hive中間表,盡可能地減少Spark的shuffle操作,大幅度提升了性能,將部分作業的性能提升了6倍以上,

解決方案二:過濾少數導致傾斜的key

方案適用場景:如果發現導致傾斜的key就少數幾個,而且對計算本身的影響并不大的話,那么很適合使用這種方案,比如99%的key就對應10條資料,但是只有一個key對應了100萬資料,從而導致了資料傾斜,

方案實作思路:如果我們判斷那少數幾個資料量特別多的key,對作業的執行和計算結果不是特別重要的話,那么干脆就直接過濾掉那少數幾個key,比如,在Spark SQL中可以使用where子句過濾掉這些key或者在Spark Core中對RDD執行filter算子過濾掉這些key,如果需要每次作業執行時,動態判定哪些key的資料量最多然后再進行過濾,那么可以使用sample算子對RDD進行采樣,然后計算出每個key的數量,取資料量最多的key過濾掉即可,

方案實作原理:將導致資料傾斜的key給過濾掉之后,這些key就不會參與計算了,自然不可能產生資料傾斜,

方案優點:實作簡單,而且效果也很好,可以完全規避掉資料傾斜,

方案缺點:適用場景不多,大多數情況下,導致傾斜的key還是很多的,并不是只有少數幾個,

方案實踐經驗:在專案中我們也采用過這種方案解決資料傾斜,有一次發現某一天Spark作業在運行的時候突然OOM了,追查之后發現,是Hive表中的某一個key在那天資料例外,導致資料量暴增,因此就采取每次執行前先進行采樣,計算出樣本中資料量最大的幾個key之后,直接在程式中將那些key給過濾掉,

解決方案三:提高shuffle操作的并行度

方案適用場景:如果我們必須要對資料傾斜迎難而上,那么建議優先使用這種方案,因為這是處理資料傾斜最簡單的一種方案,

方案實作思路:在對RDD執行shuffle算子時,給shuffle算子傳入一個引數,比如reduceByKey(1000),該引數就設定了這個shuffle算子執行時shuffle read task的數量,對于Spark SQL中的shuffle類陳述句,比如group by、join等,需要設定一個引數,即spark.sql.shuffle.partitions,該引數代表了shuffle read task的并行度,該值默認是200,對于很多場景來說都有點過小,

方案實作原理:增加shuffle read task的數量,可以讓原本分配給一個task的多個key分配給多個task,從而讓每個task處理比原來更少的資料,舉例來說,如果原本有5個key,每個key對應10條資料,這5個key都是分配給一個task的,那么這個task就要處理50條資料,而增加了shuffle read task以后,每個task就分配到一個key,即每個task就處理10條資料,那么自然每個task的執行時間都會變短了,具體原理如下圖所示,

方案優點:實作起來比較簡單,可以有效緩解和減輕資料傾斜的影響,

方案缺點:只是緩解了資料傾斜而已,沒有徹底根除問題,根據實踐經驗來看,其效果有限,

方案實踐經驗:該方案通常無法徹底解決資料傾斜,因為如果出現一些極端情況,比如某個key對應的資料量有100萬,那么無論你的task數量增加到多少,這個對應著100萬資料的key肯定還是會分配到一個task中去處理,因此注定還是會發生資料傾斜的,所以這種方案只能說是在發現資料傾斜時嘗試使用的第一種手段,嘗試去用嘴簡單的方法緩解資料傾斜而已,或者是和其他方案結合起來使用,

解決方案四:兩階段聚合(區域聚合+全域聚合)

方案適用場景:對RDD執行reduceByKey等聚合類shuffle算子或者在Spark SQL中使用group by陳述句進行分組聚合時,比較適用這種方案,

方案實作思路:這個方案的核心實作思路就是進行兩階段聚合,第一次是區域聚合,先給每個key都打上一個亂數,比如10以內的亂數,此時原先一樣的key就變成不一樣的了,比如(hello, 1) (hello, 1) (hello, 1) (hello, 1),就會變成(1_hello, 1) (1_hello, 1) (2_hello, 1) (2_hello, 1),接著對打上亂數后的資料,執行reduceByKey等聚合操作,進行區域聚合,那么區域聚合結果,就會變成了(1_hello, 2) (2_hello, 2),然后將各個key的前綴給去掉,就會變成(hello,2)(hello,2),再次進行全域聚合操作,就可以得到最終結果了,比如(hello, 4),

方案實作原理:將原本相同的key通過附加隨機前綴的方式,變成多個不同的key,就可以讓原本被一個task處理的資料分散到多個task上去做區域聚合,進而解決單個task處理資料量過多的問題,接著去除掉隨機前綴,再次進行全域聚合,就可以得到最終的結果,具體原理見下圖,

方案優點:對于聚合類的shuffle操作導致的資料傾斜,效果是非常不錯的,通常都可以解決掉資料傾斜,或者至少是大幅度緩解資料傾斜,將Spark作業的性能提升數倍以上,

方案缺點:僅僅適用于聚合類的shuffle操作,適用范圍相對較窄,如果是join類的shuffle操作,還得用其他的解決方案,

// 第一步,給RDD中的每個key都打上一個隨機前綴,

JavaPairRDD<String, Long> randomPrefixRdd = rdd.mapToPair(

    new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, String, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2<String, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)

          throws Exception {

        Random random = new Random();

        int prefix = random.nextInt(10);

        return new Tuple2<String, Long>(prefix + "" + tuple.1, tuple._2);

      }

    });

// 第二步,對打上隨機前綴的key進行區域聚合,

JavaPairRDD<String, Long> localAggrRdd = randomPrefixRdd.reduceByKey(

    new Function2<Long, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {

        return v1 + v2;

      }

    });

// 第三步,去除RDD中每個key的隨機前綴,

JavaPairRDD<Long, Long> removedRandomPrefixRdd = localAggrRdd.mapToPair(

    new PairFunction<Tuple2<String,Long>, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<String, Long> tuple)

          throws Exception {

        long originalKey = Long.valueOf(tuple.1.split("")[1]);

        return new Tuple2<Long, Long>(originalKey, tuple._2);

      }

    });

// 第四步,對去除了隨機前綴的RDD進行全域聚合,

JavaPairRDD<Long, Long> globalAggrRdd = removedRandomPrefixRdd.reduceByKey(

    new Function2<Long, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {

        return v1 + v2;

      }

    });



解決方案五:將reduce join轉為map join

方案適用場景:在對RDD使用join類操作,或者是在Spark SQL中使用join陳述句時,而且join操作中的一個RDD或表的資料量比較小(比如幾百M或者一兩G),比較適用此方案,

方案實作思路:不使用join算子進行連接操作,而使用Broadcast變數與map類算子實作join操作,進而完全規避掉shuffle類的操作,徹底避免資料傾斜的發生和出現,將較小RDD中的資料直接通過collect算子拉取到Driver端的記憶體中來,然后對其創建一個Broadcast變數;接著對另外一個RDD執行map類算子,在算子函式內,從Broadcast變數中獲取較小RDD的全量資料,與當前RDD的每一條資料按照連接key進行比對,如果連接key相同的話,那么就將兩個RDD的資料用你需要的方式連接起來,

方案實作原理:普通的join是會走shuffle程序的,而一旦shuffle,就相當于會將相同key的資料拉取到一個shuffle read task中再進行join,此時就是reduce join,但是如果一個RDD是比較小的,則可以采用廣播小RDD全量資料+map算子來實作與join同樣的效果,也就是map join,此時就不會發生shuffle操作,也就不會發生資料傾斜,具體原理如下圖所示,

方案優點:對join操作導致的資料傾斜,效果非常好,因為根本就不會發生shuffle,也就根本不會發生資料傾斜,

方案缺點:適用場景較少,因為這個方案只適用于一個大表和一個小表的情況,畢竟我們需要將小表進行廣播,此時會比較消耗記憶體資源,driver和每個Executor記憶體中都會駐留一份小RDD的全量資料,如果我們廣播出去的RDD資料比較大,比如10G以上,那么就可能發生記憶體溢位了,因此并不適合兩個都是大表的情況,

// 首先將資料量比較小的RDD的資料,collect到Driver中來,*

List<Tuple2<Long, Row>> rdd1Data = https://www.cnblogs.com/weijiqian/archive/2020/11/19/rdd1.collect()

// 然后使用Spark的廣播功能,將小RDD的資料轉換成廣播變數,這樣每個Executor就只有一份RDD的資料,

// 可以盡可能節省記憶體空間,并且減少網路傳輸性能開銷,

final Broadcast>> rdd1DataBroadcast = sc.broadcast(rdd1Data);

// 對另外一個RDD執行map類操作,而不再是join類操作,

JavaPairRDD> joinedRdd = rdd2.mapToPair(

    new PairFunction, String, Tuple2>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2> call(Tuple2 tuple)

          throws Exception {

        // 在算子函式中,通過廣播變數,獲取到本地Executor中的rdd1資料,

        List> rdd1Data = rdd1DataBroadcast.value();

        // 可以將rdd1的資料轉換為一個Map,便于后面進行join操作,

        Map rdd1DataMap = new HashMap();

        for(Tuple2 data : rdd1Data) {

          rdd1DataMap.put(data.1, data.2);

        }

        // 獲取當前RDD資料的key以及value,

        String key = tuple._1;

        String value = tuple._2;

        // 從rdd1資料Map中,根據key獲取到可以join到的資料,

        Row rdd1Value = rdd1DataMap.get(key);

        return new Tuple2(key, new Tuple2(value, rdd1Value));

      }

    });

// 這里得提示一下,

// 上面的做法,僅僅適用于rdd1中的key沒有重復,全部是唯一的場景,

// 如果rdd1中有多個相同的key,那么就得用flatMap類的操作,在進行join的時候不能用map,而是得遍歷rdd1所有資料進行join,

// rdd2中每條資料都可能會回傳多條join后的資料,

解決方案六:采樣傾斜key并分拆join操作

方案適用場景:兩個RDD/Hive表進行join的時候,如果資料量都比較大,無法采用“解決方案五”,那么此時可以看一下兩個RDD/Hive表中的key分布情況,如果出現資料傾斜,是因為其中某一個RDD/Hive表中的少數幾個key的資料量過大,而另一個RDD/Hive表中的所有key都分布比較均勻,那么采用這個解決方案是比較合適的,

方案實作思路:

  • 對包含少數幾個資料量過大的key的那個RDD,通過sample算子采樣出一份樣本來,然后統計一下每個key的數量,計算出來資料量最大的是哪幾個key,
  • 然后將這幾個key對應的資料從原來的RDD中拆分出來,形成一個單獨的RDD,并給每個key都打上n以內的亂數作為前綴,而不會導致傾斜的大部分key形成另外一個RDD,
  • 接著將需要join的另一個RDD,也過濾出來那幾個傾斜key對應的資料并形成一個單獨的RDD,將每條資料膨脹成n條資料,這n條資料都按順序附加一個0~n的前綴,不會導致傾斜的大部分key也形成另外一個RDD,
  • 再將附加了隨機前綴的獨立RDD與另一個膨脹n倍的獨立RDD進行join,此時就可以將原先相同的key打散成n份,分散到多個task中去進行join了,
  • 而另外兩個普通的RDD就照常join即可,
  • 最后將兩次join的結果使用union算子合并起來即可,就是最終的join結果,

方案實作原理:對于join導致的資料傾斜,如果只是某幾個key導致了傾斜,可以將少數幾個key分拆成獨立RDD,并附加隨機前綴打散成n份去進行join,此時這幾個key對應的資料就不會集中在少數幾個task上,而是分散到多個task進行join了,具體原理見下圖,

方案優點:對于join導致的資料傾斜,如果只是某幾個key導致了傾斜,采用該方式可以用最有效的方式打散key進行join,而且只需要針對少數傾斜key對應的資料進行擴容n倍,不需要對全量資料進行擴容,避免了占用過多記憶體,

方案缺點:如果導致傾斜的key特別多的話,比如成千上萬個key都導致資料傾斜,那么這種方式也不適合,


// 首先從包含了少數幾個導致資料傾斜key的rdd1中,采樣10%的樣本資料,*

JavaPairRDD<Long, String> sampledRDD = rdd1.sample(false, 0.1);

// 對樣本資料RDD統計出每個key的出現次數,并按出現次數降序排序,

// 對降序排序后的資料,取出top 1或者top 100的資料,也就是key最多的前n個資料,

// 具體取出多少個資料量最多的key,由大家自己決定,我們這里就取1個作為示范,

JavaPairRDD<Long, Long> mappedSampledRDD = sampledRDD.mapToPair(

    new PairFunction<Tuple2<Long,String>, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, String> tuple)

          throws Exception {

        return new Tuple2<Long, Long>(tuple._1, 1L);

      }   

    });

JavaPairRDD<Long, Long> countedSampledRDD = mappedSampledRDD.reduceByKey(

    new Function2<Long, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Long call(Long v1, Long v2) throws Exception {

        return v1 + v2;

      }

    });

JavaPairRDD<Long, Long> reversedSampledRDD = countedSampledRDD.mapToPair( 

    new PairFunction<Tuple2<Long,Long>, Long, Long>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2<Long, Long> call(Tuple2<Long, Long> tuple)

          throws Exception {

        return new Tuple2<Long, Long>(tuple.2, tuple.1);

      }

    });

final Long skewedUserid = reversedSampledRDD.sortByKey(false).take(1).get(0)._2;

// 從rdd1中分拆出導致資料傾斜的key,形成獨立的RDD,

JavaPairRDD<Long, String> skewedRDD = rdd1.filter(

    new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {

        return tuple._1.equals(skewedUserid);

      }

    });

// 從rdd1中分拆出不導致資料傾斜的普通key,形成獨立的RDD,

JavaPairRDD<Long, String> commonRDD = rdd1.filter(

    new Function<Tuple2<Long,String>, Boolean>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Boolean call(Tuple2<Long, String> tuple) throws Exception {

        return !tuple._1.equals(skewedUserid);

      } 

    });

// rdd2,就是那個所有key的分布相對較為均勻的rdd,

// 這里將rdd2中,前面獲取到的key對應的資料,過濾出來,分拆成單獨的rdd,并對rdd中的資料使用flatMap算子都擴容100倍,

// 對擴容的每條資料,都打上0~100的前綴,

JavaPairRDD<String, Row> skewedRdd2 = rdd2.filter(

     new Function<Tuple2<Long,Row>, Boolean>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Boolean call(Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {

        return tuple._1.equals(skewedUserid);

      }

    }).flatMapToPair(new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(

          Tuple2<Long, Row> tuple) throws Exception {

        Random random = new Random();

        List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();

        for(int i = 0; i < 100; i++) {

          list.add(new Tuple2<String, Row>(i + "" + tuple.1, tuple._2));

        }

        return list;

      }

    });

// 將rdd1中分拆出來的導致傾斜的key的獨立rdd,每條資料都打上100以內的隨機前綴,

// 然后將這個rdd1中分拆出來的獨立rdd,與上面rdd2中分拆出來的獨立rdd,進行join,

JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD1 = skewedRDD.mapToPair(

    new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {

      private static final long serialVersionUID = 1L;

      @Override

      public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)

          throws Exception {

        Random random = new Random();

        int prefix = random.nextInt(100);

        return new Tuple2<String, String>(prefix + "" + tuple.1, tuple._2);

      }

    })

    .join(skewedUserid2infoRDD)

    .mapToPair(new PairFunction<Tuple2<String,Tuple2<String,Row>>, Long, Tuple2<String, Row>>() {

            private static final long serialVersionUID = 1L;

            @Override

            public Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>> call(

              Tuple2<String, Tuple2<String, Row>> tuple)

              throws Exception {

              long key = Long.valueOf(tuple.1.split("")[1]);

              return new Tuple2<Long, Tuple2<String, Row>>(key, tuple._2);

            }

          });

// 將rdd1中分拆出來的包含普通key的獨立rdd,直接與rdd2進行join,

JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD2 = commonRDD.join(rdd2);

// 將傾斜key join后的結果與普通key join后的結果,uinon起來,

// 就是最終的join結果,

JavaPairRDD<Long, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = joinedRDD1.union(joinedRDD2);

解決方案七:使用隨機前綴和擴容RDD進行join

方案適用場景:如果在進行join操作時,RDD中有大量的key導致資料傾斜,那么進行分拆key也沒什么意義,此時就只能使用最后一種方案來解決問題了,

方案實作思路:

  • 該方案的實作思路基本和“解決方案六”類似,首先查看RDD/Hive表中的資料分布情況,找到那個造成資料傾斜的RDD/Hive表,比如有多個key都對應了超過1萬條資料,
  • 然后將該RDD的每條資料都打上一個n以內的隨機前綴,
  • 同時對另外一個正常的RDD進行擴容,將每條資料都擴容成n條資料,擴容出來的每條資料都依次打上一個0~n的前綴,
  • 最后將兩個處理后的RDD進行join即可,

方案實作原理:將原先一樣的key通過附加隨機前綴變成不一樣的key,然后就可以將這些處理后的“不同key”分散到多個task中去處理,而不是讓一個task處理大量的相同key,該方案與“解決方案六”的不同之處就在于,上一種方案是盡量只對少數傾斜key對應的資料進行特殊處理,由于處理程序需要擴容RDD,因此上一種方案擴容RDD后對記憶體的占用并不大;而這一種方案是針對有大量傾斜key的情況,沒法將部分key拆分出來進行單獨處理,因此只能對整個RDD進行資料擴容,對記憶體資源要求很高,

方案優點:對join型別的資料傾斜基本都可以處理,而且效果也相對比較顯著,性能提升效果非常不錯,

方案缺點:該方案更多的是緩解資料傾斜,而不是徹底避免資料傾斜,而且需要對整個RDD進行擴容,對記憶體資源要求很高,

方案實踐經驗:曾經開發一個資料需求的時候,發現一個join導致了資料傾斜,優化之前,作業的執行時間大約是60分鐘左右;使用該方案優化之后,執行時間縮短到10分鐘左右,性能提升了6倍,

// 首先將其中一個key分布相對較為均勻的RDD膨脹100倍,*

JavaPairRDD<String, Row> expandedRDD = rdd1.flatMapToPair(

?    new PairFlatMapFunction<Tuple2<Long,Row>, String, Row>() {

?      private static final long serialVersionUID = 1L;

?      @Override

?      public Iterable<Tuple2<String, Row>> call(Tuple2<Long, Row> tuple)

?          throws Exception {

?        List<Tuple2<String, Row>> list = new ArrayList<Tuple2<String, Row>>();

?        for(int i = 0; i < 100; i++) {

?          list.add(new Tuple2<String, Row>(0 + "_" + tuple._1, tuple._2));

?        }

?        return list;

?      }

?    });

*// 其次,將另一個有資料傾斜key的RDD,每條資料都打上100以內的隨機前綴,*

JavaPairRDD<String, String> mappedRDD = rdd2.mapToPair(

?    new PairFunction<Tuple2<Long,String>, String, String>() {

?      private static final long serialVersionUID = 1L;

?      @Override

?      public Tuple2<String, String> call(Tuple2<Long, String> tuple)

?          throws Exception {

?        Random random = new Random();

?        int prefix = random.nextInt(100);

?        return new Tuple2<String, String>(prefix + "_" + tuple._1, tuple._2);

?      }

?    });

*// 將兩個處理后的RDD進行join即可,*

JavaPairRDD<String, Tuple2<String, Row>> joinedRDD = mappedRDD.join(expandedRDD);

解決方案八:多種方案組合使用

在實踐中發現,很多情況下,如果只是處理較為簡單的資料傾斜場景,那么使用上述方案中的某一種基本就可以解決,但是如果要處理一個較為復雜的資料傾斜場景,那么可能需要將多種方案組合起來使用,比如說,我們針對出現了多個資料傾斜環節的Spark作業,可以先運用解決方案一和二,預處理一部分資料,并過濾一部分資料來緩解;其次可以對某些shuffle操作提升并行度,優化其性能;最后還可以針對不同的聚合或join操作,選擇一種方案來優化其性能,大家需要對這些方案的思路和原理都透徹理解之后,在實踐中根據各種不同的情況,靈活運用多種方案,來解決自己的資料傾斜問題,

4 Spark shuffle調優篇

大多數Spark作業的性能主要就是消耗在了shuffle環節,因為該環節包含了大量的磁盤IO、序列化、網路資料傳輸等操作,因此,如果要讓作業的性能更上一層樓,就有必要對shuffle程序進行調優,但是也必須提醒大家的是,影響一個Spark作業性能的因素,主要還是代碼開發、資源引數以及資料傾斜,shuffle調優只能在整個Spark的性能調優中占到一小部分而已,因此大家務必把握住調優的基本原則,千萬不要舍本逐末,下面我們就給大家詳細講解shuffle的原理,以及相關引數的說明,同時給出各個引數的調優建議,

一、ShuffleManager發展概述

在Spark的原始碼中,負責shuffle程序的執行、計算和處理的組件主要就是ShuffleManager,也即shuffle管理器,而隨著Spark的版本的發展,ShuffleManager也在不斷迭代,變得越來越先進,

在Spark 1.2以前,默認的shuffle計算引擎是HashShuffleManager,該ShuffleManager而HashShuffleManager有著一個非常嚴重的弊端,就是會產生大量的中間磁盤檔案,進而由大量的磁盤IO操作影響了性能,

因此在Spark 1.2以后的版本中,默認的ShuffleManager改成了SortShuffleManager,SortShuffleManager相較于HashShuffleManager來說,有了一定的改進,主要就在于,每個Task在進行shuffle操作時,雖然也會產生較多的臨時磁盤檔案,但是最后會將所有的臨時檔案合并(merge)成一個磁盤檔案,因此每個Task就只有一個磁盤檔案,在下一個stage的shuffle read task拉取自己的資料時,只要根據索引讀取每個磁盤檔案中的部分資料即可,

下面我們詳細分析一下HashShuffleManager和SortShuffleManager的原理,

二、HashShuffleManager運行原理

1、未經優化的HashShuffleManager

下圖說明了未經優化的HashShuffleManager的原理,這里我們先明確一個假設前提:每個Executor只有1個CPU core,也就是說,無論這個Executor上分配多少個task執行緒,同一時間都只能執行一個task執行緒,

我們先從shuffle write開始說起,shuffle write階段,主要就是在一個stage結束計算之后,為了下一個stage可以執行shuffle類的算子(比如reduceByKey),而將每個task處理的資料按key進行“分類”,所謂“分類”,就是對相同的key執行hash演算法,從而將相同key都寫入同一個磁盤檔案中,而每一個磁盤檔案都只屬于下游stage的一個task,在將資料寫入磁盤之前,會先將資料寫入記憶體緩沖中,當記憶體緩沖填滿之后,才會溢寫到磁盤檔案中去,

那么每個執行shuffle write的task,要為下一個stage創建多少個磁盤檔案呢?很簡單,下一個stage的task有多少個,當前stage的每個task就要創建多少份磁盤檔案,比如下一個stage總共有100個task,那么當前stage的每個task都要創建100份磁盤檔案,如果當前stage有50個task,總共有10個Executor,每個Executor執行5個Task,那么每個Executor上總共就要創建500個磁盤檔案,所有Executor上會創建5000個磁盤檔案,由此可見,未經優化的shuffle write操作所產生的磁盤檔案的數量是極其驚人的,

接著我們來說說shuffle read,shuffle read,通常就是一個stage剛開始時要做的事情,此時該stage的每一個task就需要將上一個stage的計算結果中的所有相同key,從各個節點上通過網路都拉取到自己所在的節點上,然后進行key的聚合或連接等操作,由于shuffle write的程序中,task給下游stage的每個task都創建了一個磁盤檔案,因此shuffle read的程序中,每個task只要從上游stage的所有task所在節點上,拉取屬于自己的那一個磁盤檔案即可,

shuffle read的拉取程序是一邊拉取一邊進行聚合的,每個shuffle read task都會有一個自己的buffer緩沖,每次都只能拉取與buffer緩沖相同大小的資料,然后通過記憶體中的一個Map進行聚合等操作,聚合完一批資料后,再拉取下一批資料,并放到buffer緩沖中進行聚合操作,以此類推,直到最后將所有資料到拉取完,并得到最終的結果,

2、優化后的HashShuffleManager

下圖說明了優化后的HashShuffleManager的原理,這里說的優化,是指我們可以設定一個引數,spark.shuffle.consolidateFiles,該引數默認值為false,將其設定為true即可開啟優化機制,通常來說,如果我們使用HashShuffleManager,那么都建議開啟這個選項,

開啟consolidate機制之后,在shuffle write程序中,task就不是為下游stage的每個task創建一個磁盤檔案了,此時會出現shuffleFileGroup的概念,每個shuffleFileGroup會對應一批磁盤檔案,磁盤檔案的數量與下游stage的task數量是相同的,一個Executor上有多少個CPU core,就可以并行執行多少個task,而第一批并行執行的每個task都會創建一個shuffleFileGroup,并將資料寫入對應的磁盤檔案內,

當Executor的CPU core執行完一批task,接著執行下一批task時,下一批task就會復用之前已有的shuffleFileGroup,包括其中的磁盤檔案,也就是說,此時task會將資料寫入已有的磁盤檔案中,而不會寫入新的磁盤檔案中,因此,consolidate機制允許不同的task復用同一批磁盤檔案,這樣就可以有效將多個task的磁盤檔案進行一定程度上的合并,從而大幅度減少磁盤檔案的數量,進而提升shuffle write的性能,

假設第二個stage有100個task,第一個stage有50個task,總共還是有10個Executor,每個Executor執行5個task,那么原本使用未經優化的HashShuffleManager時,每個Executor會產生500個磁盤檔案,所有Executor會產生5000個磁盤檔案的,但是此時經過優化之后,每個Executor創建的磁盤檔案的數量的計算公式為:CPU core的數量 * 下一個stage的task數量,也就是說,每個Executor此時只會創建100個磁盤檔案,所有Executor只會創建1000個磁盤檔案,

三、SortShuffleManager運行原理

SortShuffleManager的運行機制主要分成兩種,一種是普通運行機制,另一種是bypass運行機制,當shuffle read task的數量小于等于spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold引數的值時(默認為200),就會啟用bypass機制,

四、shuffle相關引數調優

以下是Shffule程序中的一些主要引數,這里詳細講解了各個引數的功能、默認值以及基于實踐經驗給出的調優建議,

spark.shuffle.file.buffer

  • 默認值:32k
  • 引數說明:該引數用于設定shuffle write task的BufferedOutputStream的buffer緩沖大小,將資料寫到磁盤檔案之前,會先寫入buffer緩沖中,待緩沖寫滿之后,才會溢寫到磁盤,
  • 調優建議:如果作業可用的記憶體資源較為充足的話,可以適當增加這個引數的大小(比如64k),從而減少shuffle write程序中溢寫磁盤檔案的次數,也就可以減少磁盤IO次數,進而提升性能,在實踐中發現,合理調節該引數,性能會有1%~5%的提升,

spark.reducer.maxSizeInFlight

  • 默認值:48m
  • 引數說明:該引數用于設定shuffle read task的buffer緩沖大小,而這個buffer緩沖決定了每次能夠拉取多少資料,
  • 調優建議:如果作業可用的記憶體資源較為充足的話,可以適當增加這個引數的大小(比如96m),從而減少拉取資料的次數,也就可以減少網路傳輸的次數,進而提升性能,在實踐中發現,合理調節該引數,性能會有1%~5%的提升,

spark.shuffle.io.maxRetries

  • 默認值:3
  • 引數說明:shuffle read task從shuffle write task所在節點拉取屬于自己的資料時,如果因為網路例外導致拉取失敗,是會自動進行重試的,該引數就代表了可以重試的最大次數,如果在指定次數之內拉取還是沒有成功,就可能會導致作業執行失敗,
  • 調優建議:對于那些包含了特別耗時的shuffle操作的作業,建議增加重試最大次數(比如60次),以避免由于JVM的full gc或者網路不穩定等因素導致的資料拉取失敗,在實踐中發現,對于針對超大資料量(數十億~上百億)的shuffle程序,調節該引數可以大幅度提升穩定性,

spark.shuffle.io.retryWait

  • 默認值:5s
  • 引數說明:具體解釋同上,該引數代表了每次重試拉取資料的等待間隔,默認是5s,
  • 調優建議:建議加大間隔時長(比如60s),以增加shuffle操作的穩定性,

spark.shuffle.memoryFraction

  • 默認值:0.2
  • 引數說明:該引數代表了Executor記憶體中,分配給shuffle read task進行聚合操作的記憶體比例,默認是20%,
  • 調優建議:在資源引數調優中講解過這個引數,如果記憶體充足,而且很少使用持久化操作,建議調高這個比例,給shuffle read的聚合操作更多記憶體,以避免由于記憶體不足導致聚合程序中頻繁讀寫磁盤,在實踐中發現,合理調節該引數可以將性能提升10%左右,

spark.shuffle.manager

  • 默認值:sort
  • 引數說明:該引數用于設定ShuffleManager的型別,Spark 1.5以后,有三個可選項:hash、sort和tungsten-sort,HashShuffleManager是Spark 1.2以前的默認選項,但是Spark 1.2以及之后的版本默認都是SortShuffleManager了,tungsten-sort與sort類似,但是使用了tungsten計劃中的堆外記憶體管理機制,記憶體使用效率更高,
  • 調優建議:由于SortShuffleManager默認會對資料進行排序,因此如果你的業務邏輯中需要該排序機制的話,則使用默認的SortShuffleManager就可以;而如果你的業務邏輯不需要對資料進行排序,那么建議參考后面的幾個引數調優,通過bypass機制或優化的HashShuffleManager來避免排序操作,同時提供較好的磁盤讀寫性能,這里要注意的是,tungsten-sort要慎用,因為之前發現了一些相應的bug,

spark.shuffle.sort.bypassMergeThreshold

  • 默認值:200
  • 引數說明:當ShuffleManager為SortShuffleManager時,如果shuffle read task的數量小于這個閾值(默認是200),則shuffle write程序中不會進行排序操作,而是直接按照未經優化的HashShuffleManager的方式去寫資料,但是最后會將每個task產生的所有臨時磁盤檔案都合并成一個檔案,并會創建單獨的索引檔案,
  • 調優建議:當你使用SortShuffleManager時,如果的確不需要排序操作,那么建議將這個引數調大一些,大于shuffle read task的數量,那么此時就會自動啟用bypass機制,map-side就不會進行排序了,減少了排序的性能開銷,但是這種方式下,依然會產生大量的磁盤檔案,因此shuffle write性能有待提高,

spark.shuffle.consolidateFiles

  • 默認值:false
  • 引數說明:如果使用HashShuffleManager,該引數有效,如果設定為true,那么就會開啟consolidate機制,會大幅度合并shuffle write的輸出檔案,對于shuffle read task數量特別多的情況下,這種方法可以極大地減少磁盤IO開銷,提升性能,
  • 調優建議:如果的確不需要SortShuffleManager的排序機制,那么除了使用bypass機制,還可以嘗試將spark.shffle.manager引數手動指定為hash,使用HashShuffleManager,同時開啟consolidate機制,在實踐中嘗試過,發現其性能比開啟了bypass機制的SortShuffleManager要高出10%~30%,

原文:公眾號:大資料架構

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