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將X軸移到圖形的頂部，并翻轉Y軸geom_tile

2021-10-16 18:21:44 資料庫

我正試圖重新安排我的geom_tile圖表。我想把x軸移到圖形的頂部，然后翻轉y軸，使圖形左上角的第一個比較是a對a的比較。右邊的a對a的比較是在圖形的左下方。我有兩個問題，當我嘗試做position = top時，x軸的標簽就消失了。我似乎也搞不清楚如何翻轉Y軸。每當我試圖重新排列資料時，只有Y軸的標簽移動，而不是資料。

以下是我正在使用的代碼

ggplot(heat, aes(SNP2。 SNP1)) geom_tile(aes(fill = Score, 寬度=。 95,高度=。 95）。 color = "white"） geom_text(aes(label=) operator">=Score)） scale_fill_gradient2(low = "white"。 high = "red"） labs(x = ""。 y = ""） scale_y_discrete() ） scale_x_discrete() expansion = expansion(mult = c(0。 0））。 指導= guide_axis(angle = 45) ) theme_bw() 主題() axis.ticks. y = element_line(color = NA)。 axis.ticks. x = element_line(color = NA)。 legend.title=element_blank(),。 面板。 border = element_rect(colour = "white"。 fill=NA。 size=1）， plot.background = element_blank(), panel.grid.major = element_blank(), panel.grid.minor = element_blank(), axis.text.x.top = element_blank(), axis.text.y.right = element_blank(), legend.key.height= unit(3. 5, 'cm'）, legend.key.width= unit(0。 5, 'cm'） )

下面是一個資料的例子

heat < -結構(list(SNP1 =結構(c(1L。 1L。 1L, 1L, 1L。 1L, 1L, 1L, 1L,/span> 1L。 1L, 1L。 1L, 1L。 1L, 1L。 1L, 1L。 1L, 1L。 1L, 1L。 2L, 2L, 2L,/span> 2L。 2L, 2L。 2L, 2L。 2L, 2L。 2L, 2L。 2L, 2L。 2L, 2L。 2L, 2L, 2L, 2L,/span> 2L。 2L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L, 3L, 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 3L, 3L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 4L, 4L, 4L,/span> 4L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 4L。 4L, 5L。 5L, 5L, 5L, 5L,/span> 5L。 5L, 5L。 5L, 5L。 5L, 5L。 5L, 5L。 5L, 5L。 5L, 5L。 5L, 5L, 5L, 5L,/span> 5L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 6L, 6L, 6L,/span> 6L。 6L, 6L。 6L, 6L。 6L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L, 7L, 7L,/span> 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 7L, 7L。 8L, 8L。 8L, 8L, 8L, 8L,/span> 8L。 8L, 8L。 8L, 8L。 8L, 8L。 8L, 8L。 8L, 8L。 8L, 8L。 8L, 8L, 8L, 8L,/span> 9L。 9L, 9L, 9L, 9L。 9L, 9L。 9L, 9L。 9L, 9L。 9L, 9L。 9L, 9L, 9L, 9L, 9L。 9L, 9L。 9L, 9L, 10L。 10L, 10L。 10L, 10L。 10L, 10L。 10L, 10L, 10L。 10L, 10L。 10L, 10L,, 10L, 10L,, 10L, 10L。 10L, 11L, 11L。 11L, 11L。 11L, 11L, 11L。 11L, 11L, 11L。 11L, 11L。 11L, 11L,/span> 11L。 11L, 11L。 11L, 11L, 11L。 11L, 12L, 12L。 12L, 12L。 12L, 12L,/span> 12L。 12L, 12L。 12L, 12L,, 12L, 12L,, 12L, 12L。 12L, 12L,/span> 12L。 12L, 13L。 13L, 13L, 13L。 13L, 13L, 13L。 13L, 13L。 13L, 13L,/span> 13L。 13L, 13L。 13L, 13L, 13L。 13L, 13L, 13L。 13L,/span> 14L。 14L, 14L,/span> 14L。 14L, 14L。 14L, 14L, 14L。 14L, 14L, 14L。 14L, 14L。 14L, 14L,/span> 14L。 14L, 14L。 14L, 14L, 15L。 15L, 15L, 15L。 15L, 15L。 15L, 15L,/span> 15L。 15L, 15L。 15L, 15L, 15L。 15L, 15L, 15L。 15L, 15L。 15L, 15L,/span> 16L。 16L, 16L。 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 16L。 16L, 16L,/span> 16L。 16L, 16L。 16L, 16L, 16L, 16L, 16L, 17L。 17L, 17L。 17L, 17L, 17L,/span> 17L。 17L, 17L。 17L, 17L, 17L。 17L, 17L, 17L。 17L, 17L。 17L, 17L, 17L,/span> 17L。 17L, 17L。 18L, 18L,, 18L, 18L, 18L。 18L, 18L, 18L, 18L, 18L。 18L, 18L, 18L, 18L, 18L, 18L, 18L, 18L, 18L, 18L。 19L, 19L, 19L。 19L, 19L。 19L, 19L, 19L。 19L, 19L, 19L。 19L, 19L。 19L, 19L, 19L。 19L, 19L。 19L, 19L, 19L。 20L, 20L,, 20L, 20L。 20L, 20L, 20L。 20L, 20L。 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L, 20L。 20L, 20L, 20L。 21L, 21L。 21L, 21L, 21L, 21L, 21L, 21L, 21L, 21L。 21L, 21L, 21L,, 21L, 21L。 21L, 21L, 21L, 21L, 21L）, 。 標簽 = c("a",. "b", "c"。 "d", "e"。 "f", "g", "h"。 "i", "j", "k"。 "l", "m"。 "n", "o", "p", "q"。 "r", "s", "t"。 "u"）。 class = " factor"）。 SNP2 =結構(c(1L。 2L， 3L。 4L, 5L。 6L, 7L, 8L。 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L,/span> 14L。 15L, 16L,/span> 17L。 18L,/span> 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 8L, 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L, 14L, 15L。 16L, 17L, 18L。 19L, 20L。 21L, 1L, 2L。 3L, 4L。 5L, 6L, 7L。 8L, 9L。 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L, 16L。 17L,/span> 18L。 19L, 20L, 21L。 1L, 2L。 3L, 4L。 5L, 6L。 7L, 8L, 9L。 10L, 11L。 12L, 13L, 14L。 15L, 16L, 17L。 18L,/span> 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L, 14L,/span> 15L。 16L,/span> 17L。 18L, 19L, 20L。 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L。 6L, 6L, 7L,/span> 8L。 9L, 10L。 11L, 12L, 13L。 14L, 15L, 16L。 17L,/span> 18L。 19L, 20L, 21L。 1L, 2L。 3L, 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 9L。 10L, 11L。 12L, 13L,/span> 14L。 15L,/span> 16L。 17L, 18L, 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 4L, 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L。 16L,/span> 17L。 18L, 18L, 19L,/span> 20L。 21L, 1L。 2L, 3L, 4L。 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 10L。 11L, 12L,/span> 13L。 14L, 15L。 16L, 17L, 18L。 19L, 20L, 21L。 1L, 2L。 3L, 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L,/span> 14L。 15L,/span> 16L。 17L, 18L,/span> 19L。 20L,/span> 21L。 1L, 2L, 3L。 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 9L。 10L, 11L, 12L。 13L,/span> 14L。 15L, 16L, 17L。 18L, 19L, 20L。 21L, 1L。 2L, 2L, 3L, 4L。 5L, 6L。 7L, 8L, 9L。 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L。 16L, 17L,/span> 18L。 19L, 20L。 21L, 1L, 2L。 3L, 4L。 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 9L, 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L, 16L。 17L, 18L, 19L。 20L,/span> 21L。 1L, 1L, 2L,/span> 3L。 4L, 5L。 6L, 7L, 8L。 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L,/span> 14L。 15L, 16L,/span> 17L。 18L,/span> 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 8L, 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L, 14L, 15L。 16L, 17L, 18L。 19L, 20L。 21L, 1L, 2L。 3L, 4L。 5L, 6L, 7L。 8L, 9L。 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L, 16L。 17L,/span> 18L。 19L, 20L, 21L。 1L, 2L。 3L, 4L。 5L, 6L。 7L, 8L, 9L。 10L, 11L。 12L, 13L, 14L。 15L, 16L, 17L。 18L,/span> 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 10L。 11L,/span> 12L。 13L, 14L,/span> 15L。 16L,/span> 17L。 18L, 19L, 20L。 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 5L。 6L, 6L, 7L,/span> 8L。 9L, 10L。 11L, 12L, 13L。 14L, 15L, 16L。 17L,/span> 18L。 19L, 20L, 21L。 1L, 2L。 3L, 4L, 5L。 6L, 7L。 8L, 9L。 10L, 11L。 12L, 13L,/span> 14L。 15L,/span> 16L。 17L, 18L, 19L。 20L, 21L, 1L。 2L, 3L。 4L, 4L, 5L, 6L。 7L,/span> 8L。 9L, 10L, 11L。 12L,/span> 13L。 14L, 15L。 16L,/span> 17L。 18L, 18L, 19L,/span> 20L。 21L), 。 標簽 = c("a"。 "b", "c"。 "d", "e"。 "h", "i"。 "j", "k"。 "l", "m", "n", "o", "p", "q"。 "r", "s", "t", "u"）。 class = " factor"）。 得分= c(100L。 43L, 40L。 29L, 29L, 38L, 38L。 33L, 21L。 16L, 15L, 22L。 16L, 25L, 26L。 22L,/span> 21L。 25L, 20L, 11L， 23L。 43L, 100L, 44L。 34L, 43L, 35L。 38L, 31L。 23L, 15L, 15L。 16L, 13L。 26L, 28L, 19L。 14L, 17L, 28L。 10L, 24L。 49L, 53L, 100L, 39L, 33L, 32L, 43L。 29L, 29L, 12L。 12L, 25L。 17L, 26L, 22L， 18L。 17L, 18L, 32L。 12L, 24L, 35L。 41L, 39L。 100L, 100L, 21L, 31L。 27L, 21L。 30L, 14L, 14L。 23L, 17L, 23L。 21L, 20L。 18L, 13L, 20L, 13L。 21L, 36L, 53L。 34L, 21L, 100L。 31L, 27L。 33L, 29L, 21L。 20L, 20L。 23L, 20L, 26L。 21L, 9L, 27L。 21L, 19L。 21L, 48L, 43L， 33L。 32L, 32L, 100L。 39L, 28L, 29L。 19L, 19L。 22L, 14L, 22L。 32L, 19L。 10L, 20L, 23L。 12L, 19L, 49L, 49L, 46L。 28L, 28L, 40L, 100L。 33L, 28L, 15L。 15L, 33L, 10L。 18L, 34L。 19L, 16L, 13L。 25L, 13L。 21L, 50L, 47L。 36L, 26L, 40L。 33L, 38L。 100L, 100L, 33L, 21L。 21L, 28L。 17L, 29L, 26L。 28L, 24L, 22L。 16L, 14L。 29L, 33L, 36L， 38L。 38L, 36L, 36L。 35L, 35L, 100L。 24L, 24L。 24L, 20L, 18L。 29L, 20L。 22L, 20L,, 16L, 20L, 26L。 26L, 17L。 19L, 28L, 24L。 19L, 22L。 24L, 100L, 96L。 17L, 35L, 9L。 20L, 19L。 11L, 22L, 15L。 24L, 11L。 25L, 25L, 17L。 19L, 27L, 25L。 19L, 23L。 25L, 100L, 100L, 17L。 35L, 10L, 21L。 19L, 12L, 21L。 15L, 21L。 12L, 38L, 28L， 36L。 32L, 28L, 30L。 44L, 32L, 26L。 18L, 18L。 100L, 14L, 18L。 24L, 30L。 14L, 20L, 18L。 8L, 26L, 29L。 23L, 25L。 25L, 33L, 21L。 15L, 21L。 23L, 40L, 38L。 15L, 100L, 19L。 8L, 12L。 17L, 25L, 17L。 25L, 8L。 47L, 47L, 40L。 34L, 30L, 32L, 26L, 36L。 21L, 11L, 11L， 19L。 19L, 100L, 26L。 19L, 28L, 15L。 23L, 15L。 23L, 49L, 51L。 34L, 32L。 38L, 47L, 49L, 32L, 34L, 23L。 23L, 26L。 9L, 9L, 26L, 100L。 19L, 15L。 17L, 21L, 9L。 19L, 41L, 35L。 28L, 30L。 33L, 28L, 28L, 35L。 24L, 22L, 22L。 33L, 13L, 20L, 20L, 100L。 20L, 15L, 20L。 9L, 26L。 40L, 27L, 27L。 29L, 13L, 16L。 24L, 31L。 27L, 13L, 13L， 16L。 18L, 29L, 16L。 20L, 100L, 18L。 11L, 18L。 31L, 49L, 33L。 29L, 20L。 42L, 31L, 20L。 29L, 24L, 27L。 24L, 22L。 27L, 16L, 18L， 16L。 18L, 100L, 11L, 20L, 11L, 40L。 56L, 53L。 33L, 35L, 37L。 40L, 21L。 26L, 19L, 19L。 21L, 19L, 26L。 23L, 21L。 12L, 12L, 100L, 19L, 28L, 23L, 21L。 21L, 21L, 30L。 19L, 21L。 19L, 21L,/span> 30L。 26L, 9L。 28L, 16L, 9L。 9L, 19L, 21L。 19L, 100L。 14L, 48L, 50L。 40L, 36L。 36L, 31L, 33L。 40L, 26L, 14L。 14L, 31L。 10L, 26L, 21L。 29L, 33L。 12L, 29L, 14L。 100L）。 X = c(NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, NA, NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA。 NA, NA, 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你可以設定limits = rev來反轉一個離散的y軸。對于x軸，position = "top"是有效的，但你有axis.text.x.top = element_blank()作為主題設定。

library(ggplot2) 

# heat <- structure(..) # from OP, omitted for brevity

ggplot(heat, aes(SNP2。 SNP1)) 
  geom_tile(aes(fill = Score, 寬度=。 95,高度=。 95）。  color = "white"）   
  geom_text(aes(label=) operator">=Score)）  
  scale_fill_gradient2(low = "white"。  high = "red"）  
  labs(x = ""。 y = ""）  
  scale_y_discrete()
    限制 = rev
  )  
  scale_x_discrete()
    expansion = expansion(mult = c(0。 0））。  導向= guide_axis(angle = 45）。 
    position = "top"/span>
  )

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