我有一個檔案 (.tsv)，其中包含呼叫所有樣本的變體。我想將前三列合并為一列：
示例： 原文：
檔案名=變體.tsv > 我要合并的前三列是：
泳道樣品ID條碼
B31 00-00-NNA-0000 0000
期望的輸出：
ID
B31_00-00-NNA-0000_0000
推薦的方法是什么？
uj5u.com熱心網友回復：
一種方式，使用 perl one-liner：
perl -F'\t' -lane '
if ($. == 1) {
print join("\t", "ID", @F[3..$#F])
} else {
print join("\t", join("_", @F[0,1,2]), @F[3..$#F])
}' variants tsv
@F在選項卡上將每一行拆分為一個陣列 ( )，并使用該陣列的切片列印出標題和后面的行以提取適當的元素，然后將這些元素連接成分隔的字串。
uj5u.com熱心網友回復：
從此開始
lane sampleID Barcode
B31 00-00-NNA-0000 0000
并使用Miller，您可以運行
mlr --tsv put -S '$ID=$lane."_".$sampleID."_".$Barcode' input.tsv >output.tsv
具有
------ ---------------- --------- -------------------------
| lane | sampleID | Barcode | ID |
------ ---------------- --------- -------------------------
| B31 | 00-00-NNA-0000 | 0000 | B31_00-00-NNA-0000_0000 |
------ ---------------- --------- -------------------------
如果您只想要 ID 欄位，則命令是
mlr --tsv put -S '$ID=$lane."_".$sampleID."_".$Barcode' then cut -f ID input.tsv >output.tsv
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