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MongoDB 謹防索引seek的效率問題

2020-09-14 08:07:14 資料庫

目錄

  • 背景
  • 初步分析
  • 索引seeks的原因
    • 去掉 exists 條件
    • gt 條件和反序
  • 優化思路
  • 小結

宣告:本文同步發表于 MongoDB 中文社區,傳送門:
http://www.mongoing.com/archives/27310

背景

最近線上的一個工單分析服務一直不大穩定,監控平臺時不時發出資料庫操作超時的告警,
運維兄弟溝通后,發現在每天凌晨1點都會出現若干次的業務操作失敗,而資料庫監控上并沒有發現明顯的例外,
在該分析服務的日志中發現了某個資料庫操作產生了 SocketTimeoutException

開發同學一開始希望通過調整 MongoDB Java Driver 的超時引數來規避這個問題,
但經過詳細分析之后,這樣是無法根治問題的,而且超時配置應該如何調整也難以評估,

下面是關于對這個問題的分析、調優的程序,

初步分析

從出錯的資訊上看,是資料庫的操作回應超時了,此時客戶端配置的 SocketReadTimeout 為 60s,
那么,是什么操作會導致資料庫 60s 還沒能回傳呢?

業務操作

左邊的資料庫是一個工單資料表(t_work_order),其中記錄了每張工單的資訊,包括工單編號(oid)、最后修改時間(lastModifiedTime)
分析服務是Java實作的一個應用程式,在每天凌晨1:00 會拉取出前一天修改的工單資訊(要求按工單號排序)進行處理,
由于工單表非常大(千萬級),所以在處理時會采用分頁的做法(每次取1000條),使用按工單號翻頁的方式:

  • 第一次拉取
db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}, 
   "oid": {$exists: true}})
   .sort({"oid":1}).limit(1000)
  • 第二次拉取,以第一次拉取的最后一條記錄的工單號作為起點
db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}, 
   "oid": {$exists: true, $gt: "VXZ190"}})
   .sort({"oid":1}).limit(1000)

..

根據這樣的查詢,開發人員給資料表使用的索引如下:

db.t_work_order.ensureIndexes({
   "oid" : 1,
   "lastModifiedTime" : -1
})

盡管該索引與查詢欄位基本是匹配的,但在實際執行時卻表現出很低的效率:
第一次拉取時間非常的長,經常超過60s導致報錯,而后面的拉取時間則會快一些

為了精確的模擬該場景,我們在測驗環境中預置了小部分資料,對拉取記錄的SQL執行Explain:

db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}
   "oid": {$exists: true}})
   .sort({"oid":1}).limit(1000)
   .explain("executionStats")

輸出結果如下

"nReturned" : 1000,
"executionTimeMillis" : 589,
"totalKeysExamined" : 136661,
"totalDocsExamined" : 1000,

...

"indexBounds" : {
    "oid" : [ 
        "[MinKey, MaxKey]"
    ],
    "lastModifiedTime" : [ 
        "(new Date(1554806697106), new Date(1554803097106))"
    ]
},
"keysExamined" : 136661,
"seeks" : 135662,

在執行程序中發現,檢索1000條記錄,居然需要掃描 13.6 W條索引項!
其中,幾乎所有的開銷都花費在了 一個seeks操作上了,

索引seeks的原因

官方檔案對于 seeks 的解釋如下:
The number of times that we had to seek the index cursor to a new position in order to complete the index scan.

翻譯過來就是:
seeks 是指為了完成索引掃描(stage),執行器必須將游標定位到新位置的次數,

我們都知道 MongoDB 的索引是B+樹的實作(3.x以上),對于連續的葉子節點掃描來說是非常快的(只需要一次尋址),那么seeks操作太多則表示整個掃描程序中出現了大量的尋址(跳過非目標節點),
而且,這個seeks指標是在3.4版本支持的,因此可以推測該操作對性能是存在影響的,

為了探究 seeks 是怎么產生的,我們對查詢陳述句嘗試做了一些變更:

去掉 exists 條件

exists 條件的存在是因為歷史問題(一些舊記錄并不包含工單號的欄位),為了檢查exists查詢是否為關鍵問題,修改如下:

db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}
   })
   .sort({"oid":1}).limit(1000)
   .explain("executionStats")

執行后的結果為:

"nReturned" : 1000,
"executionTimeMillis" : 1533,
"totalKeysExamined" : 272322,
"totalDocsExamined" : 272322,
  
...

"inputStage" : {
  "stage" : "FETCH",
  "filter" : {
      "$and" : [ 
          {
              "lastModifiedTime" : {
                  "$lt" : ISODate("2019-04-09T10:44:57.106Z")
              }
          }, 
          {
              "lastModifiedTime" : {
                  "$gt" : ISODate("2019-04-09T09:44:57.106Z")
              }
          }
      ]
}, 

...

"indexBounds" : {
    "oid" : [ 
        "[MinKey, MaxKey]"
    ],
    "lastModifiedTime" : [ 
        "[MaxKey, MinKey]"
    ]
},
"keysExamined" : 272322,
"seeks" : 1,

這里發現,去掉 exists 之后,seeks 變成了1次,但整個查詢掃描了 27.2W 條索引項! 剛好是去掉之前的2倍,
seeks 變為1次說明已經使用了葉節點順序掃描的方式,然而由于掃描范圍非常大,為了找到目標記錄,會執行順序掃描并過濾大量不符合條件的記錄
在 FETCH 階段出現了 filter可說明這一點,與此同時,我們檢查了資料表的特征:同一個工單號是存在兩條記錄的!于是可以說明:

  • 在存在exists查詢條件時,執行器會選擇按工單號進行seeks跳躍式檢索,如下圖:

  • 在不存在exists條件的情況下,執行器選擇了葉節點順序掃描的方式,如下圖:

gt 條件和反序

除了第一次查詢之外,我們對后續的分頁查詢也進行了分析,如下:

db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}, 
   "oid": {$exists: true, $gt: "VXZ190"}})
   .sort({"oid":1}).limit(1000)
   .explain("executionStats")

上面的陳述句中,主要是增加了$gt: "VXZ190"這一個條件,執行程序如下:

"nReturned" : 1000,
"executionTimeMillis" : 6,
"totalKeysExamined" : 1004,
"totalDocsExamined" : 1000,

...

"indexBounds" : {
    "oid" : [ 
        "(\"VXZ190\", {})"
    ],
    "lastModifiedTime" : [ 
        "(new Date(1554806697106), new Date(1554803097106))"
    ]
},
"keysExamined" : 1004,
"seeks" : 5,

可以發現,seeks的數量非常少,而且檢索程序只掃描了1004條記錄,效率是很高的,
那么,是不是意味著在后面的資料中,滿足查詢的條件的記錄非常密集呢?

為了驗證這一點,我們將一開始第一次分頁的查詢做一下調整,改為按工單號降序的方式(從后往前掃描):

db.t_work_order.find({
   "lastModifiedTime":{
      $gt: new Date("2019-04-09T09:44:57.106Z"),
      $lt: new Date("2019-04-09T10:44:57.106Z")}, 
   "oid": {$exists: true}})
   .sort({"oid":-1}).limit(1000)
   .explain("executionStats")

新的"反序查詢陳述句"的執行程序如下:

"nReturned" : 1000,
"executionTimeMillis" : 6,
"totalKeysExamined" : 1001,
"totalDocsExamined" : 1000,

...

"direction" : "backward",
"indexBounds" : {
    "oid" : [ 
        "[MaxKey, MinKey]"
    ],
    "lastModifiedTime" : [ 
        "(new Date(1554803097106), new Date(1554806697106))"
    ]
},
"keysExamined" : 1001,
"seeks" : 2,

可以看到,執行的效率更高了,幾乎不需要什么 seeks 操作!
經過一番確認后,我們獲知了在所有資料的分布中,工單號越大的記錄其更新時間值也越大,基本上我們想查詢的目標資料都集中在尾端

于是就會出現一開始提到的,第一次查詢非常慢甚至超時,而后面的查詢就快了,

上面提到的兩個查詢執行路線如圖所示:

  • 加入$gt 條件,從中間開始檢索

  • 反序,從后面開始檢索

優化思路

通過分析,我們知道了問題的癥結在于索引的掃描范圍過大,那么如何優化,以避免掃描大量記錄呢?
從現有的索引及條件來看,由于同時存在gt、exists以及葉子節點的時間范圍限定,不可避免的會產生seeks操作,
而且查詢的性能是不穩定的,跟資料分布、具體查詢條件都有很大的關系
于是一開始所提到的僅僅是增加 socketTimeout 的閾值可能只是治標不治本,一旦資料的索引值分布變化或者資料量持續增大,可能會發生更嚴重的事情,

回到一開始的需求場景,定時器要求讀取每天更新的工單(按工單號排序),再進行分批處理
那么,按斬訓零為整的思路,新增一個lastModifiedDay欄位,這個存盤的就是lastModifiedTime對應的日期值(低位取整),這樣在同一天內更新的工單記錄都有同樣的值,

建立組合索引 {lastModifiedDay:1, oid:1},相應的查詢條件改為:

{
  "lastModifiedDay": new Date("2019-04-09 00:00:00.000"),
  "oid": {$gt: "VXZ190"}
}  
-- limit 1000

執行結果如下:

"nReturned" : 1000,
"executionTimeMillis" : 6,
"totalKeysExamined" : 1000,
"totalDocsExamined" : 1000,

...

"indexBounds" : {
    "lastModifiedDay" : [ 
        "(new Date(1554803000000), new Date(1554803000000))"
    ],
    "oid" : [ 
        "(\"VXZ190\", {})"
    ]
},
"keysExamined" : 1000,
"seeks" : 1,

這樣優化之后,每次查詢最多只掃描1000條記錄,查詢速度是非常快的!

小結

本質上,這就是一種空間換時間的方法,即通過存盤一個額外的索引欄位來加速查詢,通過增加少量的存盤開銷提升了整體的效能,
在對于許多問題進行優化時,經常是需要從應用場景觸發,適當的轉換思路,
比如在本文的問題中,是不是一定要增加欄位呢?如果業務上可以接受不按工單號排序進行讀取,那么僅使用更新時間欄位進行分頁拉取也是可以達到效果的,具體還是要由業務場景來定,

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/shujuku/32637.html

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