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[離線計算-Spark|Hive] HDFS小檔案處理

2022-01-21 06:40:53 資料庫

背景

HDFS 小檔案過多會對hadoop 擴展性以及穩定性造成影響, 因為要在namenode 上存盤維護大量元資訊.

大量的小檔案也會導致很差的查詢分析性能,因為查詢引擎執行查詢時需要進行太多次檔案的打開/讀取/關閉.

小檔案解決思路

通常能想到的方案就是通過Spark API 對檔案目錄下的小檔案進行讀取,然后通過Spark的算子repartition操作進行合并小檔案,repartition 磁區數通過輸入檔案的總大小和期望輸出檔案的大小通過預計算而得,

總體流程如下:

TLYig1.png

該方案適合針對已發現有小檔案問題,然后對其進行處理. 下面介紹下hudi是如何實作在寫入時實作對小檔案的智能處理.

Hudi小檔案處理

Hudi會自管理檔案大小,避免向查詢引擎暴露小檔案,其中自動處理檔案大小起很大作用

在進行insert/upsert操作時,Hudi可以將檔案大小維護在一個指定檔案大小

hudi 小檔案處理流程:

7rIbi8.png

每次寫入都會遵循此程序,以確保Hudi表中沒有小檔案,

核心代碼:

寫入檔案分配:

org.apache.hudi.table.action.commit.UpsertPartitioner#assignInserts

 //獲取磁區路徑
 Set<String> partitionPaths = profile.getPartitionPaths();

 //根據先前提交期間寫入的記錄獲取平均記錄大小,用于估計有多少記錄打包到一個檔案中,
 long averageRecordSize = averageBytesPerRecord(table.getMetaClient().getActiveTimeline().getCommitTimeline().filterCompletedInstants(),config);
 
 LOG.info("AvgRecordSize => " + averageRecordSize);

 //獲取每個磁區檔案路徑下小檔案
 Map<String, List<SmallFile>> partitionSmallFilesMap =
        getSmallFilesForPartitions(new ArrayList<String>(partitionPaths), jsc);


for (String partitionPath : partitionPaths) {
     ...
    
     List<SmallFile> smallFiles = partitionSmallFilesMap.get(partitionPath);
    //未分配的寫入記錄
    long totalUnassignedInserts = pStat.getNumInserts();  

    ...

    for (SmallFile smallFile : smallFiles) {
      //hoodie.parquet.max.file.size 資料檔案最大大小,Hudi將試著維護檔案大小到該指定值
      //算出資料檔案大小 - 小檔案 就是剩余可以寫入檔案大小, 除以平均記錄大小就是插入的記錄行數      
      long recordsToAppend = Math.min((config.getParquetMaxFileSize() - smallFile.sizeBytes) / averageRecordSize, totalUnassignedInserts);

        //分配記錄到小檔案中
        if (recordsToAppend > 0 && totalUnassignedInserts > 0) {
            // create a new bucket or re-use an existing bucket
            int bucket;
            if (updateLocationToBucket.containsKey(smallFile.location.getFileId())) {
              bucket = updateLocationToBucket.get(smallFile.location.getFileId());
              LOG.info("Assigning " + recordsToAppend + " inserts to existing update bucket " + bucket);
            } else {
              bucket = addUpdateBucket(partitionPath, smallFile.location.getFileId());
              LOG.info("Assigning " + recordsToAppend + " inserts to new update bucket " + bucket);
            }
            bucketNumbers.add(bucket);
            recordsPerBucket.add(recordsToAppend);
            //減去已經分配的記錄數
            totalUnassignedInserts -= recordsToAppend;
          }  


        //如果記錄沒有分配完
        if (totalUnassignedInserts > 0) {
            //hoodie.copyonwrite.insert.split.size 每個磁區條數
            long insertRecordsPerBucket = config.getCopyOnWriteInsertSplitSize();
            //是否自動計算每個磁區條數
            if (config.shouldAutoTuneInsertSplits()) {
                insertRecordsPerBucket = config.getParquetMaxFileSize() / averageRecordSize;
            }

           //計算要創建的bucket
           int insertBuckets = (int) Math.ceil((1.0 * totalUnassignedInserts) / insertRecordsPerBucket); 
           
          ...
          
          for (int b = 0; b < insertBuckets; b++) {
            bucketNumbers.add(totalBuckets);
            if (b == insertBuckets - 1) {
              //針對最后一個buket處理,就是寫完剩下的記錄
              recordsPerBucket.add(totalUnassignedInserts - (insertBuckets - 1) * insertRecordsPerBucket);
            } else {
              recordsPerBucket.add(insertRecordsPerBucket);
            }
            BucketInfo bucketInfo = new BucketInfo();
            bucketInfo.bucketType = BucketType.INSERT;
            bucketInfo.partitionPath = partitionPath;
            bucketInfo.fileIdPrefix = FSUtils.createNewFileIdPfx();
            bucketInfoMap.put(totalBuckets, bucketInfo);
            totalBuckets++;
          }

        }

    }

}


獲取每個磁區路徑下小檔案:
org.apache.hudi.table.action.commit.UpsertPartitioner#getSmallFiles

 if (!commitTimeline.empty()) { // if we have some commits
      HoodieInstant latestCommitTime = commitTimeline.lastInstant().get();
      List<HoodieBaseFile> allFiles = table.getBaseFileOnlyView()
          .getLatestBaseFilesBeforeOrOn(partitionPath, latestCommitTime.getTimestamp()).collect(Collectors.toList());

      for (HoodieBaseFile file : allFiles) {

        //獲取小于 hoodie.parquet.small.file.limit 引數值就為小檔案
        if (file.getFileSize() < config.getParquetSmallFileLimit()) {
          String filename = file.getFileName();
          SmallFile sf = new SmallFile();
          sf.location = new HoodieRecordLocation(FSUtils.getCommitTime(filename), FSUtils.getFileId(filename));
          sf.sizeBytes = file.getFileSize();
          smallFileLocations.add(sf);
        }
      }
    }

UpsertPartitioner繼承spark的Partitioner, hudi在寫入的時候會利用spark 自定磁區的機制優化記錄分配到不同檔案的能力, 從而達到在寫入時不斷優化解決小檔案問題.

涉及到的關鍵配置:

  • hoodie.parquet.max.file.size:資料檔案最大大小,Hudi將試著維護檔案大小到該指定值;

  • hoodie.parquet.small.file.limit:小于該大小的檔案均被視為小檔案;

  • hoodie.copyonwrite.insert.split.size:單檔案中插入記錄條數,此值應與單個檔案中的記錄數匹配(可以根據最大檔案大小和每個記錄大小來確定)

在hudi寫入時候如何使用、配置引數?

在寫入hudi的代碼中 .option中配置上述引數大小,如下:

.option(HoodieStorageConfig.DEFAULT_PARQUET_FILE_MAX_BYTES, 120 * 1024 * 1024)

總結

本文主要介紹小檔案的處理方法思路,以及通過閱讀原始碼和相關資料學習hudi 如何在寫入時智能的處理小檔案問題新思路.Hudi利用spark 自定義磁區的機制優化記錄分配到不同檔案的能力,達到小檔案的合并處理.

參考

  1. https://www.cnblogs.com/leesf456/p/14642991.html
本文作者: chaplinthink, 關注領域:大資料、基礎架構、系統設計, 一個熱愛學習、分享的大資料工程師

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/shujuku/417118.html

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