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Databend 存盤架構總覽

2022-10-22 08:49:24 資料庫

目的

通過本篇文章帶大家理解一下 Databend 的存盤結構,Databend 內置的 Table 引擎為 Fuse table engine,也是接下來要花重點篇幅要講的,

另外,Databend 還支持外置的 Hive table 及 Icebreg Table ( 即將到來),Fuse table 是 Databend 直接把資料存盤到 S3 類物件存盤上,從而讓用戶達到一個按需付費,無須關注存盤的高可用及擴容,副本這些問題,

Hive Table 是利用 Databend 替換 Hive 的查詢能力,從而減少 Hive 計算節點,起到降本增效的效果(該功能已經使用),

Iceberg Table 正在規劃中 https://github.com/datafuselabs/databend/issues/8216

Fuse Table Engine 基礎概念

在 Fuse Table 中有一些基礎概念先做一個解釋方便更想 Databend Fuse Table 的存盤結構,

1. 什么是 db_id?

這是 Databend 中的一個 internal 的標識 (u64),不是暴露給用戶使用,Databend 對于 create database 會在對應的 bucket/[root] 下面創建一個整數命名的目錄,

2. 什么是 table_id?

這是 Databend 中的一個 internal 的標識 (u64),不是暴露給用戶使用,Databend 對于 create table 會在 /bucket/[root]/<db_id>/ 創建一個整數命名的目錄,

3. Databend 的存 block 檔案是什么?

Databend 最終存盤 block 是以 Parquet 為格式存盤,在存盤上以表為單位,檔案名為:[UUID].parquet, 存盤路徑為:

/bucket/[root]/<db_id>/<table_id>/_b/<32 位 16 進制字串 >_v0.parquet

如:d5ee665801a64a079a8fd2711a71c780_v0.parquet

4. Databend 中 segment 檔案是什么?

Databend 中用于組織 Block 的檔案,一個 segment 可以多含的 Block 塊,檔案是 json 格式: /bucket/[root]/<db_id>/<table_id>/_sg/<32 位 16 進制字串 >_v1.json ,

如:3b5e1325f68e47b0bd1517ffeb888a36_v1.json

5. Snapshot 是什么?

snapshot 相當于每一個資料的一個版本號(uuid, 32 位 16 進制字串),每個寫入動作都會有一個唯一的版本號, json 格式,內部包含對應的 segment 檔案, /bucket/[root]/<db_id>/<table_id>/_ss/<32 位 16 進制字串 >_v1.json,

如:e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb_v1.json

6. Databend 支持什么索引?

Databend 目前支持三類索引:min/max index, sparse index, bloom filter index ,其中 min/max, sparse index 在 Block 的 parquet 及對應的:ss, segment 中都有存盤,bloom fliter 是單獨存盤為 parquet 檔案,

Databend 存盤結構 Databend 整體上的存盤結構大概如下:

/bucket/[root]/snapshot 下面有 N 多的 segment , 一個 segment 里包含至少一個 block, 最多 1000 個 block ,

存盤配置Databend

存盤配置

[storage]
# fs | s3 | azblob | obs
type = "s3"


# To use S3-compatible object storage, uncomment this block and set your values.
[storage.s3]
bucket = "testbucket"
root = "20221012"
endpoint_url = "url"
access_key_id = "=user"
secret_access_key = "mypassword"

上面這段配置的作用:以 s3 方式把檔案存到 testbucket 下面的 20221012 目錄, 最侄訓形成如下的結構:

其中配置中 root 可以省略,

例如:/testbucket/20221012/17818/17825 對應的是 /bucket/root/db_id/table_id 這樣一個結構,

table_id 里面每個目錄的意義

目錄 意義
_b 用于存盤資料的真正block, 以parquet 格式存盤
_i_b_v2 資料本身的 bloom fliter 索引,以 parquet 格式存盤
_sg 全稱:segment 用于管理 block 組成,json 檔案格式, 一個 sg 檔案最少包含一個 block ,最多包含 1000 個 block
_ss 全稱:snapshot, 用于關聯一個版本對應的 segment
last_snapshot_location_hint 指向最后一個 snapshot 存盤的位置

驗證環境

驗證1  ss/sg/_b/_i_b_v2 關系

為了分析他們的關系,這里通過一個 create database/ create table / insert 例子來看看他們是怎么生成的,

create database wubx;
use wubx;
create table tb1(id int, c1 varchar);
insert into tb1 values(1, 'databend');
show create table tb1;

最后通過 show create table 可以看到:

CREATE TABLE `tb1` (
  `id` INT,
  `c1` VARCHAR
) ENGINE=FUSE SNAPSHOT_LOCATION='17818/17825/_ss/e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb_v1.json'

這里可以看到:

  • wubx 的 db_id 是:17818
  • tb1 的 table_id 是:17825
  • 對應的第一個 snapshot 檔案是:17818/17825/_ss/e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb_v1.json

1.查詢對應的 snapshot

MySQL [wubx]> select snapshot_id, snapshot_location from fuse_snapshot('wubx','tb1')\G;
*************************** 1. row ***************************
      snapshot_id: e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb
snapshot_location: 17818/17825/_ss/e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb_v1.json
1 row in set (0.005 sec)

2.接下來我們看一下,這個 snapshot 中包含那些 segment:

MySQL [wubx]> select * from fuse_segment('wubx','tb1', 'e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb')\G;
*************************** 1. row ***************************
     file_location: 17818/17825/_sg/3b5e1325f68e47b0bd1517ffeb888a36_v1.json
    format_version: 1
       block_count: 1
         row_count: 1
bytes_uncompressed: 28
  bytes_compressed: 296
1 row in set (0.006 sec)

從這個查詢中可以看到 snapshot: e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb 只包含一個 segment: 17818/17825/_sg/3b5e1325f68e47b0bd1517ffeb888a36_v1.json, 而這個 segment 只有一個 1 block,這個 Block 只有 1 行資料,對應的 JSON 檔案:

{
    "format_version": 1,
    "blocks": [
        {
            ...
            "location": [
                "17818/17825/_b/d5ee665801a64a079a8fd2711a71c780_v0.parquet",
                0
            ],
            "bloom_filter_index_location": [
                "17818/17825/_i_b_v2/d5ee665801a64a079a8fd2711a71c780_v2.parquet",
                2
            ],
            "bloom_filter_index_size": 470,
            "compression": "Lz4Raw"
        }
    ],
    "summary": {
            ...
        }
}

原始檔案較長,有興趣的可以詳細閱讀一個原檔案,

3.對應的 block 查詢

MySQL [wubx]> select * from fuse_block('wubx','tb1')\G;
*************************** 1. row ***************************
          snapshot_id: e7ccbdcff8d54ebe9aee85d9fbb3dbcb
            timestamp: 2022-10-14 06:53:55.147359
       block_location: 17818/17825/_b/d5ee665801a64a079a8fd2711a71c780_v0.parquet
           block_size: 28
bloom_filter_location: 17818/17825/_i_b_v2/d5ee665801a64a079a8fd2711a71c780_v2.parquet
    bloom_filter_size: 470
1 row in set (0.006 sec)

驗證1 總結:

  1. 任何一次寫入都會生成對應的 snapshot (用于 time travel)
  1. 生成的 block 會被 Segment 參考,一個寫入產生的 block 數量在小于 1000 個的情況下都會屬于一個 segment 中,如果超過 1000 個 block 會生成多個 segement (這個操作太大了,就不證明了)
  1. 如果上面情況,一次 insert 也會生成:一個 snapshot , 一個 segment ,一個 block,一個 bloom fliter block

基于上面的原理:

對于 Databend 寫入推薦使用批量寫入,不推薦單條的 insert 做生成中的資料生成,在 Databend 海量資料寫入推薦使用 copy into, streaming_load , clickhouse http handler 這三種方法, 其中前兩種吞吐能力最好,

驗證1  ss/sg/_b/_i_b_v2 關系

多次重復制執行:Insert into tb1 select * from tb1; 共執行 10 次,加上原來 1 次,總共會形成 11 個 snapshot:

接下來看 tb1 的 snapshot 指向:17818/17825/_ss/5a0ba62a222441d3acd2d93549e46d82_v1.json

show create table tb1;
CREATE TABLE `tb1` (
  `id` INT,
  `c1` VARCHAR
) ENGINE=FUSE SNAPSHOT_LOCATION='17818/17825/_ss/5a0ba62a222441d3acd2d93549e46d82_v1.json'

Q1:snapshot 主要用來做什么?

Databend 基于 snapshot 獲取相應版本的資料,Databend 也是基于 snapshot 實作事務的 RR 隔離級別,

例如:Select count() from tb1;相當于:select count() from tb1 at(snapshot=>'5a0ba62a222441d3acd2d93549e46d82');

這個 at 陳述句是 time travel 的一個特性,對于 time travel 可以參考:https://databend.rs/doc/reference/sql/query-syntax/dml-at#obtaining-snapshot-id-and-timestamp

Q2:snapshot 是否可以被清理?

可以的,

清理 snapshot 命令:optimize table tb1; 或是 optimize table tb1 purge;

MySQL [wubx]> optimize table tb1;
Query OK, 0 rows affected (0.013 sec)

MySQL [wubx]> select snapshot_id, snapshot_location from fuse_snapshot('wubx','tb1');
+----------------------------------+----------------------------------------------------------+
| snapshot_id                      | snapshot_location                                        |
+----------------------------------+----------------------------------------------------------+
| 5a0ba62a222441d3acd2d93549e46d82 | 17818/17825/_ss/5a0ba62a222441d3acd2d93549e46d82_v1.json |
+----------------------------------+----------------------------------------------------------+
1 row in set (0.005 sec)

但清理后,time travel 功能需要針對后面的資料才能生效,前面的 time travel 資料已經丟掉,

Q3:是否可以創建一個不帶 time travel 的表?

可以的,

Databend 支持:CREATE TRANSIENT TABLE .. 創建的表

參考:https://databend.rs/doc/reference/sql/ddl/table/ddl-create-table#create-transient-table-

該方式創建的表存在一個缺點:在高并發寫入讀取中,容易造成正在讀取的 snapshot 被回收及報錯的問題,

存盤優化Tips

Q1:大量小的 block 檔案,是不是可以進行合并?

可以合并的,

目前需要用戶進行手工觸發,

optimize table tbname compact; 

這個命令的作用:

  • 把原有的  block 塊 max_threads 進行并發合并,生成一份最佳的 Block size 檔案串列
  • 每個 thread 任務對應一個 segment 檔案,超過 1000 個 block 會生成多個 segment
  • 最終生成一個 snapshot 檔案

經過 Compact 的最佳的 Block 塊,后續在運行 compact 動作會直接跳過,

Q2: 什么時間決定需要運行 tb 的 compact?

目前 Databend 對于 Block 判定要執行 compact 的條件:

  • 單個 block 塊里行數少于 80 萬行且 block 小于 100M 會進行合并
  • 單個 block 塊超過 100 萬行,block 會被拆分,

可以用一個簡單的條件來判斷

a. Block 數量大于 max_threads* 4 倍

select count(*) from fuse_block('db','tb');

b.表里 block 資料少于 100M 且行數低于 80 萬的數量超過 100 個

select if(count(*)>100,'你需要運行compact','你的block大小非常合理') from fuse_block('db','tb') where file_size <100*1024*1024 and row_count<800000;

Q3:  當出現大量的 segment 檔案,是不是需要對 segment 檔案合并?

是的,

對于 segment 合并也可以引入一條簡單的規則

select count(*),avg(block_count),if(avg(block_count)<500,'need compact segment','segment file is ok') from fuse_segment('db','tb','snapshot_id');

如果 segment 總數超過 1000 ,而且每個 segment 平均 block 數小于 500 需要運行:

 optimize table tb compact segment; 

對于頻繁寫入的場景建議定期運行一下 compact segment ,這樣來壓縮一下 ss 及對 segemnt 檔案的大小, 方便 meta 資訊進行快取,

Q4:進行合并操作后檔案占用空間比較大,如何釋放?

Databend 是一個多版本及支持 Time travel 特性的云數倉,隨著歷史增長,會出現挺多的版本資料,對于存在的歷史版本資料可以使用

 optimize table table_name purge;

現在 purge 動作會把當前的 snapshot  之外的版本全部清理掉,造成 time travel 失效的問題,后續 purge 會支持傳入 snapshot 或是時間指定清理到什么位置,

Q5:如何進行 compact 和同時清理過舊的資料?

 optimize table table_name all;

這個命令相當于:optimize table table_name compact; optimize table table_name purge;

Q6:如何真正洗掉一張表?

Databend 中 Drop table 為了支持 undrop table 不會所表直正洗掉,如果你需要立即 Drop 一張表建議使用:

drop table table_name all;

目前需要洗掉一個 Database 也面臨這樣的問題,需要先做表的洗掉,再刪 Database ,

關于 Databend

Databend 是一款開源、彈性、低成本,基于物件存盤也可以做實時分析的新式數倉,期待您的關注,一起探索云原生數倉解決方案,打造新一代開源 Data Cloud,

  • Databend 檔案:https://databend.rs/
  • Twitter:https://twitter.com/Datafuse_Labs
  • Slack:https://datafusecloud.slack.com/
  • Wechat:Databend
  • GitHub :https://github.com/datafuselabs/databend

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