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使用不同格式(包括缺失的日期資訊)格式化日期列-lubridate

2022-11-08 10:54:09 資料庫

我對 R 比較陌生。我下載了一個關于臨床試驗資料的資料集,但我突然想到,相關列中日期的格式是混淆的:其中大多數都像“2012 年 9 月 1 日”,但有些缺少當天資訊(例如 2015 年 10 月)。

我想以相同的方式表達它們(例如 yyyy-mm-dd),以便與它們一起作業。一切順利,唯一缺少的問題是輸出列的名稱。在最后一個函式(date_correction)中,我計劃包含一個引數“output_col”,我可以為創建的(格式化的)列傳遞預期的名稱,但它始終只列印 output_col。

  1. 你知道,我怎么能處理這個?要將輸出列的預期名稱直接傳遞給函式?
  2. 有沒有更好的方法來解決我的問題?-> 我什至嘗試為 lubricate::parse_date_time 管理更復雜的訂單引數

parse_date_time(input_col, orders="mdy", "my")

但這沒有用。

這是代碼:

library("tidyverse")
library("lubridate")

Observation <- c(seq(1:5))
Date_original <- c("October 2014","August 2014","June 2013",
                   "June 24, 2010","January 2005")

df_dates <- data.frame(Observation, Date_original)

# looking for a comma in the cell
comma_detect <- function(a_string){
  str_detect(a_string, ",")
}

# if comma: assume "mdy", if not apply "my" -> return formatted value
date_correction_row <- function(input_col){
  if_else(comma_detect(input_col),
          parse_date_time(input_col, orders="mdy"),
          parse_date_time(input_col, orders="my"))
}

# prepare function for dataframe:
date_correction <- function(df, input_col, output_col){
  mutate(df, output_col = date_correction_row(input_col))
}

df_dates %>% date_correction(df_dates$Date_original, date_formatted) %>% view()

OUTPUT

  Observation Date_original output_col
1           1  October 2014 2014-10-01
2           2   August 2014 2014-08-01
3           3     June 2013 2013-06-01
4           4 June 24, 2010 2010-06-24
5           5  January 2005 2005-01-01

uj5u.com熱心網友回復:

在下面的代碼中,我們假設output_colequals "Date"他們都設定了列名,不給出警告并使用 Date 類。

1)嘗試每種格式并選擇不提供 NA 的格式。這僅使用基數 R。

output_col <- "Date"

within(df_dates, assign(output_col, pmin(na.rm = TRUE,
 as.Date(Date_original, "%B %d, %Y"), 
 as.Date(paste(Date_original, 1), "%B %Y %d"))))
##   Observation Date_original       Date
## 1           1  October 2014 2014-10-01
## 2           2   August 2014 2014-08-01
## 3           3     June 2013 2013-06-01
## 4           4 June 24, 2010 2010-06-24
## 5           5  January 2005 2005-01-01

2)這也可以在 lubridate 中完成。重要的是 my 是 coalesce 的第一個引數而不是第二個引數,因為它為那些與格式不匹配的值輸出 NA,而 mdy 給出了錯誤的日期,所以如果這是第一個 coalesce 將永遠不會到達 my。這種方法比 (3) 短,但您可能更喜歡穩健性 (3),因為它不依賴于不匹配日期回傳的內容。

library(dplyr)
library(lubridate)

output_col <- "Date"

df_dates %>% 
  mutate(!!output_col := coalesce(my(Date_original, quiet = TRUE), 
    mdy(Date_original)))
##   Observation Date_original       Date
## 1           1  October 2014 2014-10-01
## 2           2   August 2014 2014-08-01
## 3           3     June 2013 2013-06-01
## 4           4 June 24, 2010 2010-06-24
## 5           5  January 2005 2005-01-01

3)如果您更喜歡自己的首先檢查逗號的方法,這里是更緊湊的方法的變體。它使用myandmdy而不是parse_date_timesincemymdy給出 Date 類結果,這比 POSIXct 更合適,parse_date_time因為沒有時間。

library(dplyr)
library(lubridate)

output_col <- "Date"

df_dates %>%
  mutate(!!output_col := if_else(grepl(",", Date_original),
    mdy(Date_original), my(Date_original, quiet = TRUE)))
## 1           1  October 2014 2014-10-01
## 2           2   August 2014 2014-08-01
## 3           3     June 2013 2013-06-01
## 4           4 June 24, 2010 2010-06-24
## 5           5  January 2005 2005-01-01

uj5u.com熱心網友回復:

當日期結構已知時,我喜歡先顯式更正日期結構,然后再決議。在這里,當一天丟失時,我使用正則運算式來 sub in 1,然后我們像往常一樣決議。

library(tidyverse)
df_dates %>% 
  mutate(
    output_col = gsub("(?<!,)\\s(?=\\d{4})", " 1, ", Date_original, perl = TRUE) %>% 
    as.Date(., format = '%B %d, %Y')
  )

  Observation Date_original output_col
1           1  October 2014 2014-10-01
2           2   August 2014 2014-08-01
3           3     June 2013 2013-06-01
4           4 June 24, 2010 2010-06-24
5           5  January 2005 2005-01-01

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/shujuku/529016.html

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