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使用回圈創建多個.sh檔案

2022-11-14 10:01:04 資料庫

我想準備幾個 .sh 檔案來運行一些模擬。

假設我要多次運行的命令是:

node_list = "Positive,Negative"

for nodes in $node_list; do
    python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation1.csv" -r "results_mutation1.csv"
done

在哪里

  • the_script 是我要運行的腳本
  • -m 是用于運行模擬的檔案
  • -r 保存結果的檔案

我有一個突變體串列,所以基本上我想創建一個回圈給我 mutant_list = [TP53, NFKB, ABL1]

for nodes in $node_list; do
    python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation_TP53.csv" -r "results_mutation_TP53.csv"
done

for nodes in $node_list; do
    python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation_NFKB.csv" -r "results_mutation_NFKB.csv"
done

for nodes in $node_list; do
    python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation_ABL1.csv" -r "results_mutation_ABL1.csv"
done

等等在一個 .sh 檔案中。

但是,由于我有 100 個突變體,我想為每 5 個突變體創建一個單獨的 .sh 檔案。

預期的輸出將是

run_sim_1.sh其中包含(為清楚起見省略for nodes in $node_list; do / done

python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation1.csv" -r "results_mutation1.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation2.csv" -r "results_mutation2.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation3.csv" -r "results_mutation3.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation4.csv" -r "results_mutation4.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation5.csv" -r "results_mutation5.csv"

run_sim_2.sh其中包含

python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation6.csv" -r "results_mutation6.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation7.csv" -r "results_mutation7.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation8.csv" -r "results_mutation8.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation9.csv" -r "results_mutation9.csv"
python3.7 path_to_script/the_script -m "file_mutation10.csv" -r "results_mutation10.csv"

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您可以使用此腳本:

#!/bin/bash

node_list=( 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 )

counter=1
shcounter=1

for node in "${node_list[@]}"
do
    echo "python3.7 path_to_script/the_script -m \"file_mutation$node.sh\" -r \"results_mutation$node.csv\"" >>run_sim_${shcounter}.sh
    if [[ $counter -ge 5 ]]
    then
        (( shcounter = shcounter   1 ))
        counter=0
    fi
    (( counter = counter   1 ))
done
  • 我將節點命名為 1,2,3,4,... 只是為了向您展示它們在每個 .sh 檔案中分為 5 個,但它們可以有任何名稱。我不認為它們遵循數字序列是理所當然的。它適用于任何東西。
  • 變數:計算回圈counter中已處理的節點數。for
  • 變數shcounter:計算已創建的 .sh 檔案的數量。
  • 每次處理一個節點時,該節點的命令都會寫入當前的 .sh 檔案(當前由 shcounter 指定)。計數器也增加。如果大于 5,則重置為 0,并且 shcounter 遞增。

運行此腳本會創建 3 個檔案。run_sim1.sh(節點 1->5)、runsim2.sh(節點 6->10)、runsim3.sh(節點 11)。我想要一些不能被 5 整除的東西來表明我的演算法可以處理它。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/shujuku/532740.html

標籤:重击Unix

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