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如何將巨大的2Dnumpy陣列傳遞給c函式

2021-11-26 02:22:03 軟體工程

再會,

我是 Python 中的 C 和 ctypes 的新手。

我正在嘗試將 C 函式傳遞到 Python 代碼中。

在以下 C 函式中讀取二維陣列(形狀為 10,000 x 521 的“St”和形狀為 10,000 x 520 的“dZ”)時,我不斷收到以下錯誤:“訪問沖突讀取 0x0...”:

#include <math.h>
#include <stdio.h>

double change (double * dZ, double * St, size_t lenTaus, size_t lenSims)
{
    size_t i, j;
    double a, b;
    for (i = 0; i < lenSims; i  ) /*Iterate through simulations.*/
    {
        for (j = 0; j < (lenTaus - 1); j  ) /*Iterate through taus.*/
        {
            a = St[lenTaus * i   j];
            b = dZ[lenTaus * i   j];
        }
    }
    return 0.0;
}

變數“lenSims”和“lenTaus”分別為 10,000 和 521。

呼叫C函式的Python代碼是:

import ctypes
impor t numpy as np
cCode = ctypes.CDLL("cCode_e.so") ### Read the C code in a form of shared library.
cCode.change.argtypes = [ctypes.POINTER(ctypes.c_double), ctypes.POINTER(ctypes.c_double), ctypes.c_size_t, ctypes.c_size_t] ### Let know what kind of input we provide to the C function.
cCode.change.restype = ctypes.c_double ### Let know what kind of output we expect from the C function.
St_Python = np.zeros([10000,521])
dZ_Python = np.random.randn(10000,520)
St = St_Python.ctypes.data_as(ctypes.POINTER(ctypes.c_double)) ### Convert a numpy array into a pointer to an array of doubles.
dZ = dZ_Python.ctypes.data_as(ctypes.POINTER(ctypes.c_double)) ### Convert a numpy array into a pointer to an array of doubles.
lenTaus = St_Python.shape[1] ### Find the number of columns in the original array.
lenSims = St_Python.shape[0] ### Find the number of rows in the original array.
out = cCode.change(dZ, St, lenTaus, lenSims) ### Call the C function

如果我正確理解了問題,那么在將整個陣列作為指向 C 函式的指標傳遞時,我會錯誤地使用記憶體。但我不知道如何以正確的方式傳遞它們。

我可以請你幫忙嗎?

此致,

葉夫根尼

uj5u.com熱心網友回復:

看起來問題是由緩沖區溢位引起的。

假設陣列定義為:

St_Python = np.zeros([10000,521])
dZ_Python = np.random.randn(10000,520)

在C函式的引數lenTausLenSims52110000分別。結果,dZ訪問的最終偏移量是:

lenTaus * i   j = lenTaus * (lenSims-1)   (lenTaus - 1 - 1)
                = 521*9999   521-1-1
                = 5209998

的大小dz10000 * 520什么5200000是小于最終的偏移因而存在一個緩沖區溢位和未定義行為被呼叫。

解決方案之一是將偏移計算更改為dZ

            b = dZ[(lenTaus - 1) * i   j];

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/gongcheng/365831.html

標籤:Python 数组 C 麻木的 类型

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