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在同一程式中使用OpenMP和MPI

2022-04-26 10:28:10 軟體工程

我目前正在為我的并行編程課程分配作業,我需要按順序撰寫相同的程式,然后使用 OpenMP 并行化,然后使用 MPI 并行化。

對于背景關系,該作業是關于在隨機字符矩陣中搜索回文。我已經讓大部分代碼作業了,我的問題是關于如何構建、編譯和運行專案。

我可以創建三個單獨的程式并獨立運行它們,但我想將它們全部組合在同一個專案中,以便三個版本一個接一個地運行,并在同一個初始矩陣上運行。這讓我可以計時每個版本來比較它們。

我使用 CMake 作為構建工具。

我的 CMakeLists.txt :

cmake_minimum_required(VERSION 3.21)
project(<project-name> C)

set(CMAKE_C_STANDARD 23)

find_package(MPI REQUIRED)
include_directories(SYSTEM ${MPI_INCLUDE_PATH})

find_package(OpenMP REQUIRED)
set(CMAKE_C_FLAGS "${CMAKE_C_FLAGS} ${OpenMP_C_FLAGS}")
set(CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS "${CMAKE_EXE_LINKER_FLAGS} ${OpenMP_EXE_LINKER_FLAGS}")

add_executable(<project-name> <source-files>)
target_link_libraries(<project-name> ${MPI_C_LIBRARIES})

我使用以下命令構建專案

mkdir build && cd build && cmake .. && make

我的主要功能:

// All the header inclusions

int main(int argc, char **argv) {

    // Initialisation.
    srand(time(NULL));
    omp_set_num_threads(omp_get_num_procs());
    double start_time;
    ushort number_of_palindromes = 0;
    ushort palindrome_length = 5;
    ushort rows = 25000;
    ushort cols = 25000;
    char **matrix = create_matrix_of_chars(rows, cols);
    printf("Matrix of size %dx%d, searching for palindromes of size %d.\n", rows, cols, palindrome_length);

    // Run sequentially.
    printf("%-45s", "Running sequentially ... ");
    start_time = omp_get_wtime();
    number_of_palindromes = find_palindromes_sequentially(matrix, rows, cols, palindrome_length);
    printf("Found M palindromes in %7.4f seconds.\n", number_of_palindromes, omp_get_wtime() - start_time);

    // Run using OpenMP.
    printf("Running with OpenMP on %d %-20s", omp_get_num_procs(), "threads ... ");
    start_time = omp_get_wtime();
    number_of_palindromes = find_palindromes_using_openmp(matrix, rows, cols, palindrome_length);
    printf("Found M palindromes in %7.4f seconds.\n", number_of_palindromes, omp_get_wtime() - start_time);

    // Run using MPI.
    int num_procs, rank;
    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &num_procs);
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    printf("%d: hello (p=%d)\n", rank, num_procs);
    MPI_Finalize();

    // Cleanup and exit.
    free_matrix(matrix, rows);
    return 0;

}

運行./<project-name>順序和 OpenMP 版本時,一個接一個地正確運行。然而,當運行mpirun --use-hwthread-cpus ./<project-name>程式啟動整個專案的 8 個實體時(“Matrix of size ...”行被列印 8 次)。

我的理解是 MPI 區域由MPI_Init(...)and分隔,MPI_Finalize()但似乎并非如此。我將如何解決這個問題?

提前感謝您的回答。

uj5u.com熱心網友回復:

沒有“MPI 區域”這樣的東西。MPI 使用僅通過網路進行通信/同步的獨立行程。含義:整個可執行檔案在啟動時運行在盡可能多的實體中。每一個陳述句,甚至是之前MPI_Init的陳述句,都由每個實體執行。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/gongcheng/464197.html

標籤:C 制作 mpi 开放式 克利翁

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