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為什么在抖動點時在ggplot2中對兩組中的整數進行不同的處理?

2022-10-31 22:43:38 軟體工程

這是我的資料:

mydata <- structure(list(group = c("a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", 
"a", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", 
"b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", 
"b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", 
"b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b", "b"), 
    age = c(27, 21, 27, 21, 24, 27, 27, 30, 27, 27, 27, 27, 27, 
    21, 27, 24, 24, 27, 21, 24, 30, 30, 24, 24, 27, 18, 27, 24, 
    18, 18, 9, 12, 15, 12, 15, 12, 9, 9, 12, 15, 15, 18, 18, 
    15, 21, 21, 15, 21, 12, 21, 15, 30, 21, 18, 21, 21, 24, 21, 
    24, 24, 27, 24, 18, 27, 9, 21, 27, 21, 21, 21, 27, 24, 27, 
    24, 30, 30, 30, 27, 27, 24, 27, 27, 24, 24, 30, 27, 27, 30, 
    21, 24, 21, 27, 24, 24, 24, 24, 24, 24, 24, 21, 34, 25, 27, 
    35, 27, 28, 32, 33, 32, 9, 9, 8, 15, 29, 30, 10, 40, 31, 
    27, 40, 28, 31, 17, 19, 35, 29, 23, 15, 16, 26, 27, 25, 23, 
    24, 25, 25, 13, 36, 25, 27, 35, 35, 24, 21, 25, 10, 23, 5, 
    34, 21)), row.names = c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 9L, 
10L, 11L, 12L, 13L, 14L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L, 20L, 21L, 22L, 
23L, 24L, 25L, 26L, 27L, 28L, 29L, 30L, 31L, 32L, 33L, 34L, 35L, 
36L, 37L, 38L, 39L, 40L, 41L, 42L, 43L, 44L, 45L, 46L, 47L, 48L, 
49L, 50L, 51L, 52L, 53L, 54L, 55L, 56L, 57L, 58L, 59L, 60L, 61L, 
62L, 63L, 64L, 65L, 66L, 67L, 68L, 69L, 70L, 71L, 72L, 73L, 74L, 
75L, 76L, 77L, 78L, 79L, 80L, 81L, 82L, 83L, 84L, 85L, 86L, 87L, 
88L, 89L, 90L, 91L, 92L, 93L, 94L, 95L, 96L, 97L, 98L, 99L, 100L, 
101L, 102L, 103L, 104L, 105L, 106L, 107L, 108L, 109L, 110L, 111L, 
112L, 113L, 114L, 115L, 116L, 117L, 118L, 119L, 120L, 121L, 122L, 
123L, 124L, 125L, 126L, 127L, 128L, 129L, 130L, 132L, 133L, 134L, 
135L, 136L, 137L, 138L, 139L, 140L, 141L, 142L, 143L, 144L, 145L, 
146L, 147L, 148L, 149L, 150L, 151L), class = "data.frame")

這是我用抖動(ggplot2::geom_point)及其分布(ggdist::stat_halfeye)繪制點的代碼:

library(ggplot2)
library(ggdist)

ggplot(mydata, aes(x = group, y = age))   
    ggdist::stat_halfeye(
        adjust = .5, 
        width = .6, 
        .width = 0, 
        justification = -.3, 
        point_colour = NA)   
      geom_point(
        size = 1.3,
        alpha = .3,
        position = position_jitter(
            seed = 1, width = .1
        )
    )

下圖: 為什么在抖動點時在ggplot2中對兩組中的整數進行不同的處理?

兩組的年齡值都是整數,但是很明顯,b 組中的點抖動程度更大。同樣,b 組的分布比 a 組平滑得多。為什么會出現這種情況,我怎樣才能使組 a 的分布更平滑,就像組 b 的情況一樣?

uj5u.com熱心網友回復:

您的資料在兩組中都是整數,但根本不是均勻分布的。看這個:

mydata %>% group_by(group) %>% summarize(n_distinct(age))
# # A tibble: 2 × 2
#   group `n_distinct(age)`
#   <chr>             <int>
# 1 a                     8
# 2 b                    25

mydata %>% count(group, age)
#    group age  n
# 1      a   9  4
# 2      a  12  5
# 3      a  15  7
# 4      a  18  7
# 5      a  21 19
# 6      a  24 24
# 7      a  27 25
# 8      a  30  9
# 9      b   5  1
# 10     b   8  1
# 11     b   9  2
# 12     b  10  2
# 13     b  13  1
# 14     b  15  2
# 15     b  16  1
# 16     b  17  1
# 17     b  19  1
# 18     b  21  2
# 19     b  23  3
# 20     b  24  2
# 21     b  25  6
# 22     b  26  1
# 23     b  27  5
# 24     b  28  2
# 25     b  29  2
# 26     b  30  1
# 27     b  31  2
# 28     b  32  2
# 29     b  33  1
# 30     b  34  2
# 31     b  35  4
# 32     b  36  1
# 33     b  40  2

a 組有 8 個不同的年齡值,幾乎所有年齡都是 21 歲、24 歲和 27 歲,每個年齡都在 19 歲或以上。a 組中沒有其他 19-29 的整數。

b 組有 25 個不同的年齡組,最大數量為 6。比 a 組分布更均勻,差距也少得多。

很明顯,b組中的點抖動程度更大。

這一點我都不清楚。來自?position_jitter幫助頁面對heightwidth引數的描述:“如果省略,則默認為資料解析度的 40%:這意味著抖動值將占據 80% 的隱含 bin”我不確定這個“資料解析度”是否是按組計算的。我懷疑是這樣,我的猜測是抖動均勻地應用于兩組。(實際上,我會說很明顯,您的圖中 a 組中的高度抖動占用 bin 寬度的 80%,因此兩組中的點抖動到相同的量。)在任何一種情況下,我d 建議指定抖動的高度和寬度,并保持較小,比如說0.1或更少。

同樣,b 組的分布比 a 組平滑得多。

沒錯,b 組的資料比 a 組的分布更平滑。這是您資料的準確反映。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/gongcheng/523467.html

標籤:rggplot2ggdist

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