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讀取、創建和運行多個檔案的3個Python技巧

2020-11-03 05:36:15 其他

作者|Khuyen Tran
編譯|VK
來源|Towards Data Science

動機

將代碼投入生產時,你很可能需要處理代碼檔案的組織,讀取、創建和運行許多資料檔案非常耗時,本文將向你展示如何自動

  • 回圈訪問目錄中的檔案

  • 如果不存在嵌套檔案,創建它們

  • 使用bash for loop運行一個具有不同輸入的檔案

這些技巧為我在資料科學專案中節省了很多時間,我希望你也會發現它們有用!

回圈訪問目錄中的檔案

如果我們要像這樣讀取和處理多個資料:

├── data
│   ├── data1.csv
│   ├── data2.csv
│   └── data3.csv
└── main.py

我們可以嘗試一次手動讀取一個檔案

import pandas as pd 

def process_data(df):
   pass

df = pd.read_csv(data1.csv)
process_data(df)

df2 = pd.read_csv(data2.csv)
process_data(df2)

df3 = pd.read_csv(data3.csv)
process_data(df3)

當我們有3個以上的資料時,這是可以的,但不是有效的,如果我們在上面的腳本中只更改了資料,為什么不使用for回圈來訪問每個資料呢?

下面的腳本允許我們遍歷指定目錄中的檔案

import os
import pandas as pd
def loop_directory(directory: str):
	'''回圈目錄中的檔案'''

	for filename in os.listdir(directory):
		if filename.endswith(".csv"):
			file_directory = os.path.join(directory, filename)
			print(file_directory)
			pd.read_csv(file_directory)
		else:
			continue
			
if __name__=='__main__':
	loop_directory('data/')
data/data3.csv
data/data2.csv
data/data1.csv

以下是對上述腳本的解釋

  • for filename in os.listdir(directory):回圈訪問特定目錄中的檔案
  • if filename.endswith(".csv"):訪問以“.csv”結尾的檔案
  • file_directory = os.path.join(directory, filename):連接父目錄('data')和目錄中的檔案,

現在我們可以訪問“data”目錄中的所有檔案!

如果不存在嵌套檔案,創建它們

有時,我們可能希望創建嵌套檔案來組織代碼或模型,這使得將來更容易找到它們,例如,我們可以使用“model 1”來指定特定的特征工程,

在使用模型1時,我們可能需要使用不同型別的機器學習模型來訓練我們的資料(“model1/XGBoost”),

在使用每個機器學習模型時,我們甚至可能希望保存模型的不同版本,因為模型使用的超引數不同,

因此,我們的模型目錄看起來像下面這樣復雜

model
├── model1
│   ├── NaiveBayes
│   └── XGBoost
│       ├── version_1
│       └── version_2
└── model2
    ├── NaiveBayes
    └── XGBoost
        ├── version_1
        └── version_2

對于我們創建的每個模型,手動創建一個嵌套檔案可能需要很多時間,有沒有辦法讓這個程序自動化?是的,os.makedirs(datapath)

def create_path_if_not_exists(datapath):
    '''如果不存在,則創建新檔案并保存資料'''

    if not os.path.exists(datapath):
        os.makedirs(datapath) 
        
if __name__=='__main__':
create_path_if_not_exists('model/model1/XGBoost/version_1')

運行上面的檔案,你應該會看到嵌套檔案'model/model2/XGBoost/version_2'自動創建!

現在你可以將模型或資料保存到新目錄中!

import joblib
import os 

def create_path_if_not_exists(datapath):
    '''如果不存在就創建'''

    if not os.path.exists(datapath):
        os.makedirs(datapath) 

if __name__=='__main__':

  # 創建目錄
  model_path = 'model/model2/XGBoost/version_2'
  create_path_if_not_exists(model_path)
  
  # 保存
  joblib.dump(model, model_path)

Bash for Loop:使用不同的引數運行一個檔案

如果我們想用不同的引數運行一個檔案呢?例如,我們可能希望使用相同的腳本來使用不同的模型來預測資料,

import joblib

# df = ...

model_path = 'model/model1/XGBoost/version_1'
model = joblib.load(model_path)
model.predict(df)

如果一個腳本需要很長時間才能運行,而我們有多個模型要運行,那么等待腳本運行完畢然后運行下一個腳本將非常耗時,有沒有一種方法可以告訴計算機用一個命令列運行1,2,3,10,然后去做其他的事情,

是的,我們可以用for bash for loop,首先,我們使用系統argv使我們能夠決議命令列引數,如果要覆寫命令列上的組態檔,也可以使用hydra等工具,

import sys
import joblib

# df = ...

model_type = sys.argv[1]
model_version = sys.argv[2]
model_path = f'''model/model1/{model_type}/version_{model_version}'''
print('Loading model from', model_path, 'for training')

model = joblib.load(model_path)
mode.predict(df)
>>> python train.py XGBoost 1
Loading model from model/model1/XGBoost/version_1 for training

太好了!我們剛剛告訴我們的腳本使用模型XGBoost,version 1來預測命令列上的資料,現在我們可以使用bash回圈遍歷模型的不同版本,

如果你可以使用Python執行for回圈,那么也可以在下面這樣的終端上執行

$ for version in 2 3 4
> do
> python train.py XGBoost $version
> done

鍵入Enter分隔行

輸出:

Loading model from model/model1/XGBoost/version_1 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_2 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_3 for training
Loading model from model/model1/XGBoost/version_4 for training

現在,你可以在使用不同模型運行腳本的同時執行其他操作!多方便啊!

結論

祝賀你!你剛剛學習了如何同時自動讀取和創建多個檔案,你還學習了如何使用不同的引數運行一個檔案,手動讀、寫和運行檔案的時間現在可以節省下來,用于更重要的任務,

如果你對文章中的某些部分感到困惑,我在這個倉庫中創建了具體的例子:https://github.com/khuyentran1401/Data-science/tree/master/python/python_tricks

原文鏈接:https://towardsdatascience.com/3-python-tricks-to-read-create-and-run-multiple-files-automatically-5221ebaad2ba

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