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自訓練和半監督學習介紹

2020-09-10 03:49:18 其他

作者|Doug Steen
編譯|VK
來源|Towards Data Science

當涉及到機器學習分類任務時,用于訓練演算法的資料越多越好,在監督學習中,這些資料必須根據目標類進行標記,否則,這些演算法將無法學習獨立變數和目標變數之間的關系,但是,在構建用于分類的大型標記資料集時,會出現兩個問題:

  1. 標記資料可能很耗時,假設我們有1000000張狗影像,我們想將它們輸入到分類演算法中,目的是預測每個影像是否包含波士頓狗,如果我們想將所有這些影像用于監督分類任務,我們需要一個人查看每個影像并確定是否存在波士頓狗,
  2. 標記資料可能很昂貴,原因一:要想讓人費盡心思去搜100萬張狗狗照片,我們可能得掏錢,

那么,這些未標記的資料可以用在分類演算法中嗎?

這就是半監督學習的用武之地,在半監督方法中,我們可以在少量的標記資料上訓練分類器,然后使用該分類器對未標記的資料進行預測,

由于這些預測可能比隨機猜測更好,未標記的資料預測可以作為“偽標簽”在隨后的分類器迭代中采用,雖然半監督學習有很多種風格,但這種特殊的技術稱為自訓練,

自訓練

在概念層面上,自訓練的作業原理如下:

步驟1:將標記的資料實體拆分為訓練集和測驗集,然后,對標記的訓練資料訓練一個分類演算法,

步驟2:使用經過訓練的分類器來預測所有未標記資料實體的類標簽,在這些預測的類標簽中,正確率最高的被認為是“偽標簽”,

(第2步的幾個變化:a)所有預測的標簽可以同時作為“偽標簽”使用,而不考慮概率;或者b)“偽標簽”資料可以通過預測的置信度進行加權,)

步驟3:將“偽標記”資料與正確標記的訓練資料連接起來,在組合的“偽標記”和正確標記訓練資料上重新訓練分類器,

步驟4:使用經過訓練的分類器來預測已標記的測驗資料實體的類標簽,使用你選擇的度量來評估分類器性能,

(可以重復步驟1到4,直到步驟2中的預測類標簽不再滿足特定的概率閾值,或者直到沒有更多未標記的資料保留,)

好的,明白了嗎?很好!讓我們通過一個例子解釋,

示例:使用自訓練改進分類器

為了演示自訓練,我使用Python和surgical_deepnet 資料集,可以在Kaggle上找到:https://www.kaggle.com/omnamahshivai/surgical-dataset-binary-classification

此資料集用于二分類,包含14.6k+手術的資料,這些屬性是bmi、年齡等各種測量值,而目標變數complexing則記錄患者是否因手術而出現并發癥,顯然,能夠準確地預測患者是否會因手術而出現并發癥,這對醫療保健和保險供應商都是最有利的,

匯入庫

對于本教程,我將匯入numpy、pandas和matplotlib,我還將使用sklearn中的LogisticRegression分類器,以及用于模型評估的f1_score和plot_confusion_matrix 函式

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt

from sklearn.linear_model import LogisticRegression

from sklearn.metrics import f1_score
from sklearn.metrics import plot_confusion_matrix

加載資料

# 加載資料

df = pd.read_csv('surgical_deepnet.csv')
df.info()
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RangeIndex: 14635 entries, 0 to 14634
Data columns (total 25 columns):
bmi                    14635 non-null float64
Age                    14635 non-null float64
asa_status             14635 non-null int64
baseline_cancer        14635 non-null int64
baseline_charlson      14635 non-null int64
baseline_cvd           14635 non-null int64
baseline_dementia      14635 non-null int64
baseline_diabetes      14635 non-null int64
baseline_digestive     14635 non-null int64
baseline_osteoart      14635 non-null int64
baseline_psych         14635 non-null int64
baseline_pulmonary     14635 non-null int64
ahrq_ccs               14635 non-null int64
ccsComplicationRate    14635 non-null float64
ccsMort30Rate          14635 non-null float64
complication_rsi       14635 non-null float64
dow                    14635 non-null int64
gender                 14635 non-null int64
hour                   14635 non-null float64
month                  14635 non-null int64
moonphase              14635 non-null int64
mort30                 14635 non-null int64
mortality_rsi          14635 non-null float64
race                   14635 non-null int64
complication           14635 non-null int64
dtypes: float64(7), int64(18)
memory usage: 2.8 MB

資料集中的屬性都是數值型的,沒有缺失值,由于我這里的重點不是資料清理,所以我將繼續對資料進行劃分,

資料劃分

為了測驗自訓練的效果,我需要將資料分成三部分:訓練集、測驗集和未標記集,我將按以下比例拆分資料:

  • 1% 訓練
  • 25% 測驗
  • 74% 未標記

對于未標記集,我將簡單地放棄目標變數complexing,并假裝它從未存在過,

所以,在這個病例中,我們認為74%的手術病例沒有關于并發癥的資訊,我這樣做是為了模擬這樣一個事實:在實際的分類問題中,可用的大部分資料可能沒有類標簽,然而,如果我們有一小部分資料的類標簽(在本例中為1%),那么可以使用半監督學習技術從未標記的資料中得出結論,

下面,我隨機化資料,生成索引來劃分資料,然后創建測驗、訓練和未標記的劃分,然后我檢查各個集的大小,確保一切都按計劃進行,

X_train dimensions: (146, 24)
y_train dimensions: (146,)

X_test dimensions: (3659, 24)
y_test dimensions: (3659,)

X_unlabeled dimensions: (10830, 24)

類分布

多數類的樣本數((并發癥))是少數類(并發癥)的兩倍多,在這樣一個不平衡的類的情況下,我想準確度可能不是最佳的評估指標,

選擇F1分數作為分類指標來判斷分類器的有效性,F1分數對類別不平衡的影響比準確度更為穩健,當類別近似平衡時,這一點更為合適,F1得分計算如下:

其中precision是預測正例中正確預測的比例,recall是真實正例中正確預測的比例,

初始分類器(監督)

為了使半監督學習的結果更真實,我首先使用標記的訓練資料訓練一個簡單的Logistic回歸分類器,并對測驗資料集進行預測,

Train f1 Score: 0.5846153846153846
Test f1 Score: 0.5002908667830134

分類器的F1分數為0.5,混淆矩陣告訴我們,分類器可以很好地預測沒有并發癥的手術,準確率為86%,然而,分類器更難正確識別有并發癥的手術,準確率只有47%,

預測概率

對于自訓練演算法,我們需要知道Logistic回歸分類器預測的概率,幸運的是,sklearn提供了.predict_proba()方法,它允許我們查看屬于任一類的預測的概率,如下所示,在二元分類問題中,每個預測的總概率總和為1.0,

array([[0.93931367, 0.06068633],
       [0.2327203 , 0.7672797 ],
       [0.93931367, 0.06068633],
       ...,
       [0.61940353, 0.38059647],
       [0.41240068, 0.58759932],
       [0.24306008, 0.75693992]])

自訓練分類器(半監督)

既然我們知道了如何使用sklearn獲得預測概率,我們可以繼續編碼自訓練分類器,以下是簡要概述:

第1步:首先,在標記的訓練資料上訓練Logistic回歸分類器,

第2步:接下來,使用分類器預測所有未標記資料的標簽,以及這些預測的概率,在這種情況下,我只對概率大于99%的預測采用“偽標簽”,

第3步:將“偽標記”資料與標記的訓練資料連接起來,并在連接的資料上重新訓練分類器,

第4步:使用訓練好的分類器對標記的測驗資料進行預測,并對分類器進行評估,

重復步驟1到4,直到沒有更多的預測具有大于99%的概率,或者沒有未標記的資料保留,

下面的代碼使用while回圈在Python中實作這些步驟,

Iteration 0
Train f1: 0.5846153846153846
Test f1: 0.5002908667830134
Now predicting labels for unlabeled data...
42 high-probability predictions added to training data.
10788 unlabeled instances remaining.

Iteration 1
Train f1: 0.7627118644067796
Test f1: 0.5037463976945246
Now predicting labels for unlabeled data...
30 high-probability predictions added to training data.
10758 unlabeled instances remaining.

Iteration 2
Train f1: 0.8181818181818182
Test f1: 0.505431675242996
Now predicting labels for unlabeled data...
20 high-probability predictions added to training data.
10738 unlabeled instances remaining.

Iteration 3
Train f1: 0.847457627118644
Test f1: 0.5076835515082526
Now predicting labels for unlabeled data...
21 high-probability predictions added to training data.
10717 unlabeled instances remaining.

...
Iteration 44
Train f1: 0.9481216457960644
Test f1: 0.5259179265658748
Now predicting labels for unlabeled data...
0 high-probability predictions added to training data.
10079 unlabeled instances remaining.

自訓練演算法經過44次迭代,就不能以99%的概率預測更多的未標記實體了,即使一開始有10,830個未標記的實體,在自訓練之后仍然有10,079個實體未標記(并且未被分類器使用),

經過44次迭代,F1的分數從0.50提高到0.525!雖然這只是一個小的增長,但看起來自訓練已經改善了分類器在測驗資料集上的性能,上圖的頂部面板顯示,這種改進大部分發生在演算法的早期迭代中,同樣,底部面板顯示,添加到訓練資料中的大多數“偽標簽”都是在前20-30次迭代中出現的,

最后的混淆矩陣顯示有并發癥的手術分類有所改善,但沒有并發癥的手術分類略有下降,有了F1分數的提高,我認為這是一個可以接受的進步-可能更重要的是確定會導致并發癥的手術病例(真正例),并且可能值得增加假正例率來達到這個結果,

警告語

所以你可能會想:用這么多未標記的資料進行自訓練有風險嗎?答案當然是肯定的,請記住,盡管我們將“偽標記”資料與標記的訓練資料一起包含在內,但某些“偽標記”資料肯定會不正確,當足夠多的“偽標簽”不正確時,自訓練演算法會強化糟糕的分類決策,而分類器的性能實際上會變得更糟,

可以使用分類器在訓練期間沒有看到的測驗集,或者使用“偽標簽”預測的概率閾值,可以減輕這種風險,

原文鏈接:https://towardsdatascience.com/a-gentle-introduction-to-self-training-and-semi-supervised-learning-ceee73178b38

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