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通過變數id列對齊不同的觀察值以消除NA值

2022-01-22 19:40:22 資料庫

這個問題在這里已經有了答案 填寫資訊后洗掉特定行 1個回答 4 分鐘前關閉

我有一個類似于這種格式的 R 資料框:

df<-data.frame(

Fruit=c("Apples","Apples","Apples","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Bananas","Cherries","Cherries","Cherries"),
Order=c("A","A","A","B","B","B","B","B","B","B","B","B","B","B","B"),
Producer_ID=c("V","V","V","W","W","W","X","X","X","Y","Y","Y","Z","Z","Z"),
x1=c(   0.7975,NA,NA,0.570975,NA,NA,0.43374375,NA,NA,0.610624,NA,NA,0.6975,NA,NA),
y1=c(   200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA),
x2=c(   NA,NA,0.82,NA,NA,0.51,NA,NA,0.415,NA,NA,0.542,NA,NA,0.62),
y2=c(   NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200),
x3=c(   NA,NA,0.82,NA,NA,0.505,NA,NA,0.4125,NA,NA,0.538,NA,NA,0.62),
y3=c(   NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200),
x4=c(   NA,0.82,NA,NA,NA,0.5,NA,NA,0.41,NA,NA,0.534,NA,NA,0.62),
y4=c(   NA,300,NA,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA, NA,200),
x5=c(   NA,0.82,NA,NA,NA,0.495,NA,NA,0.4075,NA,NA,0.53,NA,0.62,NA),
y5=c(   NA,300,NA,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,NA,200,NA,300,NA),
x6=c(   NA,0.82,NA,NA,0.49,NA,NA,0.405,NA,NA,0.52,NA,NA,0.62,NA),
y6=c(   NA, 300,NA,NA,300,NA,NA,300,NA,NA,300,NA,NA,300,NA)
)

輸出:

> df
      Fruit Order Producer_ID        x1  y1    x2  y2     x3  y3    x4  y4     x5  y5    x6  y6
1    Apples     A           V 0.7975000 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA
2    Apples     A           V        NA  NA    NA  NA     NA  NA 0.820 300 0.8200 300 0.820 300
3    Apples     A           V        NA  NA 0.820 200 0.8200 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA
4   Bananas     B           W 0.5709750 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA
5   Bananas     B           W        NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA 0.490 300
6   Bananas     B           W        NA  NA 0.510 200 0.5050 200 0.500 200 0.4950 200    NA  NA
7   Bananas     B           X 0.4337437 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA
8   Bananas     B           X        NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA 0.405 300
9   Bananas     B           X        NA  NA 0.415 200 0.4125 200 0.410 200 0.4075 200    NA  NA
10  Bananas     B           Y 0.6106240 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA
11  Bananas     B           Y        NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA 0.520 300
12  Bananas     B           Y        NA  NA 0.542 200 0.5380 200 0.534 200 0.5300 200    NA  NA
13 Cherries     B           Z 0.6975000 200    NA  NA     NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA
14 Cherries     B           Z        NA  NA    NA  NA     NA  NA    NA  NA 0.6200 300 0.620 300
15 Cherries     B           Z        NA  NA 0.620 200 0.6200 200 0.620 200     NA  NA    NA  NA

對于識別符號列“Fruit”、“Order”、“Producer”的每種組合,在剩余的每一列中都恰好有一個非 NA 值。我想要做的是整理我的資料框以消除 NA 值,將非 NA 值與其識別符號對齊,如下所示:

df_final<-data.frame(

Fruit=c("Apples","Bananas","Bananas","Bananas","Cherries"),
Order=c("A","B","B","B","B"),
Producer_ID=c("V","W","X","Y","Z"),
x1=c(0.7975,0.570975,0.43374375,0.610624,0.6975),
y1=c(200,200,200,200,200),
x2=c(0.82,0.51,0.415,0.542,0.62),
y2=c(200,200,200,200,200),
x3=c(0.82,0.505,0.4125,0.538,0.62),
y3=c(200,200,200,200,200),
x4=c(0.82,0.5,0.41,0.534,0.62),
y4=c(300,200,200,200,200),
x5=c(0.82,0.495,0.4075,0.53,0.62),
y5=c(300,200,200,200,300),
x6=c(0.82,0.49,0.405,0.526,0.62),
y6=c(300,300,300,300,300)
)

最終輸出:

> df_final
     Fruit Order Producer_ID        x1  y1    x2  y2     x3  y3    x4  y4     x5  y5    x6  y6
1   Apples     A           V 0.7975000 200 0.820 200 0.8200 200 0.820 300 0.8200 300 0.820 300
2  Bananas     B           W 0.5709750 200 0.510 200 0.5050 200 0.500 200 0.4950 200 0.490 300
3  Bananas     B           X 0.4337437 200 0.415 200 0.4125 200 0.410 200 0.4075 200 0.405 300
4  Bananas     B           Y 0.6106240 200 0.542 200 0.5380 200 0.534 200 0.5300 200 0.526 300
5 Cherries     B           Z 0.6975000 200 0.620 200 0.6200 200 0.620 200 0.6200 300 0.620 300

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Fruit由于您在一組 ( ,Order和)的每一列中只有一個值,因此Producer_ID您可以忽略sum( 或max) 每列的NA值。

在基礎 R 中aggregate-

aggregate(.~Fruit Order Producer_ID, df, sum, na.rm = TRUE, na.action = NULL)

#    Fruit Order Producer_ID        x1  y1    x2  y2     x3  y3    x4  y4     x5  y5    x6  y6
#1   Apples     A           V 0.7975000 200 0.820 200 0.8200 200 0.820 300 0.8200 300 0.820 300
#2  Bananas     B           W 0.5709750 200 0.510 200 0.5050 200 0.500 200 0.4950 200 0.490 300
#3  Bananas     B           X 0.4337437 200 0.415 200 0.4125 200 0.410 200 0.4075 200 0.405 300
#4  Bananas     B           Y 0.6106240 200 0.542 200 0.5380 200 0.534 200 0.5300 200 0.520 300
#5 Cherries     B           Z 0.6975000 200 0.620 200 0.6200 200 0.620 200 0.6200 300 0.620 300

或使用dplyr-

library(dplyr)

df %>%
  group_by(Fruit, Order ,Producer_ID) %>%
  summarise(across(x1:y6, sum, na.rm = TRUE))

uj5u.com熱心網友回復:

另一種選擇是使用tidyr重塑為長格式,擺脫 NA,最后重塑回寬格式。

注意:作為中間步驟,我使用arrange(gsub("^.*?(\\d)$", "\\1", name))重新排列資料,以便寬 df 中的列按您想要的順序排序。

library(tidyr)
library(dplyr)

df %>% 
  pivot_longer(-c(Fruit, Order, Producer_ID)) %>% 
  drop_na() %>% 
  arrange(gsub("^.*?(\\d)$", "\\1", name)) %>% 
  pivot_wider(names_from = "name", values_from = "value")
#> # A tibble: 5 × 15
#>   Fruit  Order Producer_ID    x1    y1    x2    y2    x3    y3    x4    y4    x5
#>   <chr>  <chr> <chr>       <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
#> 1 Apples A     V           0.798   200 0.82    200 0.82    200 0.82    300 0.82 
#> 2 Banan… B     W           0.571   200 0.51    200 0.505   200 0.5     200 0.495
#> 3 Banan… B     X           0.434   200 0.415   200 0.412   200 0.41    200 0.408
#> 4 Banan… B     Y           0.611   200 0.542   200 0.538   200 0.534   200 0.53 
#> 5 Cherr… B     Z           0.698   200 0.62    200 0.62    200 0.62    200 0.62 
#> # … with 3 more variables: y5 <dbl>, x6 <dbl>, y6 <dbl>

uj5u.com熱心網友回復:

與@Ronak Shah 類似sum,這是一種可選方法,sort用于在同一行中聚合所有非 NA 值(受@r2evans https://stackoverflow.com/a/70772167/7522764啟發)

df |>
    mutate(across(everything(), ~ sort(., na.last = TRUE))) |>
    na.omit()

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