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繪制多列的平均值,包括標準偏差

2021-10-28 10:18:15 移動端開發

我有一個包含 8 列和幾行的資料集。這些列包含在 2 個不同條件下對不同變數(總共 6 個)的測量值,每列包含 4 個包含特定條件重復測量值的列。

使用 Searborn,我想生成一個條形圖,顯示每 4 列的平均值和標準偏差,按索引鍵(即測量變數)分組。資料幀結構如下:

np.random.seed(10)
df = pd.DataFrame({
    'S1_1':np.random.randn(6),
    'S1_2':np.random.randn(6),
    'S1_3':np.random.randn(6),
    'S1_4':np.random.randn(6),
    'S2_1':np.random.randn(6),
    'S2_2':np.random.randn(6),
    'S2_3':np.random.randn(6),
    'S2_4':np.random.randn(6),
    },index= ['var1','var2','var3','var4','var5','var6'])

我如何傳遞給我只想要 2 個小節的 seaborn,前 4 列 1 個,第二個 1 個。每個條形顯示跨 4 列的平均值(和標準偏差或其他一些分散度量)。

我正在考慮使用多索引,添加第二個列級別將列分組為 2 個條件,

df.columns = pd.MultiIndex.from_arrays([['Condition 1'] * 4   ['Condition 2'] * 4,df.columns])

但我不知道我應該傳遞給 Seaborn 什么來生成我想要的情節。

如果有人能指出我正確的方向,那將是一個很大的幫助!

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根據評論更新

  • 繪圖就是為繪圖 API 重塑資料框
# still create the groups
l = df.columns
n = 4
groups = [l[i:i n] for i in range(0, len(l), n)]
num_gps = len(groups)

# stack each group and add an id column
data_list = list()
for group in groups:
    id_ = group[0][1]
    data = df[group].copy().T
    data['id_'] = id_
    data_list.append(data)
    
df2 = pd.concat(data_list, axis=0).reset_index()
df2.rename({'index': 'sample'}, axis=1, inplace=True)

# melt df2 into a long form
dfm = df2.melt(id_vars=['sample', 'id_'])

# plot
p = sns.catplot(kind='bar', data=dfm, x='variable', y='value', hue='id_', ci='sd', aspect=3)

df2.head()

  sample    YAL001C    YAL002W   YAL004W   YAL005C   YAL007C   YAL008W    YAL011W   YAL012W    YAL013W   YAL014C id_
0   S2_1 -13.062716  -8.084685  2.360795 -0.740357  3.086768 -0.117259  -5.678183  2.527573 -17.326287 -1.319402   2
1   S2_2  -5.431474 -12.676807  0.070569 -4.214761 -4.318011 -4.489010 -10.268632  0.691448 -24.189106 -2.343884   2
2   S2_3  -9.365509 -12.281169  0.497772 -3.228236  0.212941 -2.287206 -10.250004  1.111842 -27.811564 -4.329987   2
3   S2_4  -7.582111 -15.587219 -1.286167 -4.531494 -3.090265 -4.718281  -8.933496  2.079757 -21.580854 -2.834441   2
4   S3_1 -12.618254 -20.010779 -2.530541 -3.203072 -2.436503 -2.922565 -15.972632  3.551605 -35.618485 -4.925495   3

dfm.head()

  sample id_ variable      value
0   S2_1   2  YAL001C -13.062716
1   S2_2   2  YAL001C  -5.431474
2   S2_3   2  YAL001C  -9.365509
3   S2_4   2  YAL001C  -7.582111
4   S3_1   3  YAL001C -12.618254

繪圖結果

繪制多列的平均值,包括標準偏差

kind='box'

  • 箱線圖可能更好地傳達分布
p = sns.catplot(kind='box', data=dfm, y='variable', x='value', hue='id_', height=12)

繪制多列的平均值,包括標準偏差


原答案

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