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高效的陣列整形和平鋪操作

2022-03-03 04:45:02 移動端開發

我想以更有效的方式進行以下一組操作:

import numpy as np
from time import time

n1  = 5
n2  = 800
n3  = 1000  

a    = np.random.rand( n1,n2,n3 )

ts = time()

a_new  = np.array( [ np.repeat( a[np.newaxis,ll,:,:], n1, axis=0  ) for ll in range(n1)] )

print(time()-ts)
ts = time()
d      = n1**2
a_new  = np.reshape( a_new, ( d, n2, n3  ) )    
a_new  = np.repeat( a_new[np.newaxis,:,:,:], n1, axis=0 )

print(time()-ts)
ts = time()
d2     = d*n1      
a_new  = np.reshape( a_new, ( d2, n2, n3 ))
a_new  = np.reshape( a_new, ( d2*n2 , n3 ) )

print(time()-ts)

當 n1,n2,n3 變得相當大時,這變得有點低效。最好的方法是什么?

uj5u.com熱心網友回復:

您的代碼,跟蹤結果的大小:

In [22]: n1 = 5
    ...: n2 = 800
    ...: n3 = 1000
    ...: 
    ...: a = np.random.rand(n1, n2, n3)
In [23]: a.shape
Out[23]: (5, 800, 1000)
In [24]: a_new = np.array([np.repeat(a[np.newaxis, ll, :, :], n1, axis=0) for ll in range(n1)])
    ...: 
In [25]: a_new.shape
Out[25]: (5, 5, 800, 1000)
In [26]: d = n1**2
    ...: a1 = np.reshape(a_new, (d, n2, n3))
    ...: a1 = np.repeat(a1[np.newaxis, :, :, :], n1, axis=0)
    ...: 
In [27]: a1.shape
Out[27]: (5, 25, 800, 1000)
In [28]: d2 = d * n1
    ...: a2 = np.reshape(a1, (d2, n2, n3))
    ...: a2 = np.reshape(a2, (d2 * n2, n3))
    ...: 
    ...: 
In [29]: a2.shape
Out[29]: (100000, 1000)

一個次要的點,但雙重reshape輸入a2不是必需的。您可以直接轉到最后一個形狀。在任何情況下,重塑都很快(除非它必須強制復制,如轉置之后)。

有時

In [34]: %timeit a_new = np.array([np.repeat(a[np.newaxis, ll, :, :], n1, axis=0) for ll in range(n1)])
263 ms ± 11.2 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

In [36]: a1  = np.reshape( a_new, ( d, n2, n3  ) )
In [37]: %timeit np.repeat( a_new[np.newaxis,:,:,:], n1, axis=0 )
912 ms ± 134 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

所以是的,重復確實需要最多的時間。但它將大型陣列的大小增加了 5 倍。 repeat相對較快 - 對于制作大型陣列的東西。

您的a_new串列理解不是必需的:

In [41]: np.repeat(a[:, None, :, :], n1, axis=1).shape
Out[41]: (5, 5, 800, 1000)
In [42]: np.allclose(np.repeat(a[:, None, :, :], n1, axis=1), a_new)
Out[42]: True
In [43]: %timeit np.repeat(a[:, None, :, :], n1, axis=1)
210 ms ± 23.1 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

節省的時間不多,因為n1回圈只有 5 倍。

請注意,以下repeat大約需要 5 倍。 a_new是 的 5 倍,是 的a25a1a

我們可以在一行中完成所有操作

In [44]: a4 = np.repeat(np.repeat(a[:,None,:,:], n1, axis=1)[None],n1, axis=0).reshape(-1,n3)
In [45]: a4.shape
Out[45]: (100000, 1000)
In [46]: np.allclose(a2, a4)
Out[46]: True

時間變化不大。有趣的是,[46] allclose 花費了最明顯的時間。

雙重復可以寫成tile

a5 = np.tile(a[None,None,:,:],(5,5,1,1)).reshape(-1,n3)

它不節省時間,因為在每個維度上重復tile使用。repeat

甚至

a6 = np.repeat(a[None,:,:], n1*n1,axis=0).reshape(-1,n3)

I'm not going to time or test this since creating several arrays of this size was pushing my memory limits.

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/yidong/436263.html

標籤:Python 麻木的 numpy-ndarray

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