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在R中映射多個密度隨時間變化的地圖

2022-05-30 19:53:09 移動端開發

我是使用 R 映射資料的新手,我想要一些關于復雜表示的幫助。我會盡量說清楚:)

我有一個資料集,可以計算自 1950 年以來瑞典每天的觀察結果。每條線都是一個觀測值,帶有緯度、經度、儒略日、日期和年份資訊。我將瑞典分為三組緯度(1 為南,2 為中,3 為北)。我只關心緯度資訊,以便在需要時可以將每個點的經度轉換為相同的值。

我想根據這三組中的觀察密度來繪制隨時間的變化。為此,我想代表我資料集不同關鍵年份的變化:1950/1975/2000/2021,因此我需要創建多個地圖。另外,我希望每年都有一張 2 月前 15 天/3 月最后 15 天/4 月前 15 天和 5 月最后 15 天的累積觀測密度圖;這樣地圖的總數將是 4*4 = 16。理想情況下,變化將通過顏色漸變來表示(越暗,觀察越多)。但如果不合適,我不介意其他建議。

我的大資料集的隨機樣本:

> dput(df[sample(nrow(df), 50),])
structure(list(lat = c("65", "64", "65", "59", "59", "57", "57", 
"68", "67", "63", "60", "61", "65", "59", "56", "65", "59", "57", 
"55", "59", "56", "56", "59", "60", "59", "55", "59", "59", "57", 
"55", "56", "57", "65", "59", "63", "59", "56", "59", "56", "56", 
"57", "63", "58", "59", "63", "61", "55", "58", "66", "57"), 
    long = c("21", "17", "21", "14", "14", "13", "12", "18", 
    "18", "20", "16", "14", "17", "16", "12", "16", "15", "14", 
    "12", "17", "12", "16", "18", "14", "14", "14", "18", "17", 
    "12", "13", "12", "12", "21", "13", "19", "16", "12", "18", 
    "16", "12", "12", "18", "12", "17", "20", "17", "12", "13", 
    "19", "12"), date = c("2009-03-29", "2006-04-06", "2019-03-31", 
    "2006-04-04", "1975-04-13", "2014-02-05", "1996-04-02", "2021-04-08", 
    "1995-04-12", "2004-04-12", "2018-04-07", "2021-03-28", "1988-04-01", 
    "2002-03-17", "2015-03-12", "2019-04-05", "2016-03-19", "2021-04-03", 
    "2014-02-08", "2015-03-13", "2021-03-09", "2005-02-07", "2013-03-31", 
    "1989-03-23", "1989-03-27", "2015-01-21", "2011-04-04", "2018-03-26", 
    "1987-03-23", "2011-01-31", "2014-02-09", "2004-01-17", "2012-04-20", 
    "2017-03-07", "2005-04-02", "2017-01-28", "2016-03-19", "1984-03-30", 
    "2005-01-29", "2021-03-06", "2008-02-03", "2017-03-22", "2019-03-10", 
    "2010-01-17", "2009-04-10", "2016-01-23", "2019-03-01", "2006-03-04", 
    "2014-04-23", "2009-03-15"), julian_day = c("88", "96", "90", 
    "94", "103", "36", "93", "98", "102", "103", "97", "87", 
    "92", "76", "71", "95", "79", "93", "39", "72", "68", "38", 
    "90", "82", "86", "21", "94", "85", "82", "31", "40", "17", 
    "111", "66", "92", "28", "79", "90", "29", "65", "34", "81", 
    "69", "17", "100", "23", "60", "63", "113", "74"), year = c(2009L, 
    2006L, 2019L, 2006L, 1975L, 2014L, 1996L, 2021L, 1995L, 2004L, 
    2018L, 2021L, 1988L, 2002L, 2015L, 2019L, 2016L, 2021L, 2014L, 
    2015L, 2021L, 2005L, 2013L, 1989L, 1989L, 2015L, 2011L, 2018L, 
    1987L, 2011L, 2014L, 2004L, 2012L, 2017L, 2005L, 2017L, 2016L, 
    1984L, 2005L, 2021L, 2008L, 2017L, 2019L, 2010L, 2009L, 2016L, 
    2019L, 2006L, 2014L, 2009L), lat_grouped = c("3", "2", "3", 
    "1", "1", "1", "1", "3", "3", "2", "2", "2", "3", "1", "1", 
    "3", "1", "1", "1", "1", "1", "1", "1", "2", "1", "1", "1", 
    "1", "1", "1", "1", "1", "3", "1", "2", "1", "1", "1", "1", 
    "1", "1", "2", "1", "1", "2", "2", "1", "1", "3", "1")), row.names = c(22330L, 
15394L, 44863L, 15258L, 1481L, 31695L, 6399L, 52043L, 6111L, 
11508L, 42184L, 51391L, 4308L, 8764L, 34675L, 45080L, 37042L, 
51743L, 31717L, 34723L, 50514L, 11892L, 30527L, 4572L, 4608L, 
33744L, 26476L, 41366L, 4006L, 25265L, 31741L, 10122L, 29059L, 
38340L, 12787L, 37827L, 37061L, 3029L, 11762L, 50464L, 18114L, 
39026L, 43835L, 23081L, 22811L, 36179L, 43641L, 13743L, 33608L, 
21917L), class = "data.frame")

我已經設法按照互聯網上的一些指導方針創建了基礎層,但我不知道如何繼續下去,而且我對所有我沒有設法使作業的不同方法感到困惑。

library(ggplot2)
library(gganimate)
library(gifski)
library(maps)
library(sf)
library(rgdal)

#map source: https://www.geoboundaries.org/data/1_3_3/zip/shapefile/

wd = "C:/Users/HP/Desktop/SWE_ADM0"
sweden <- readOGR(paste0(wd, "/SWE_ADM0.shp"), layer = "SWE_ADM0")
plot(sweden)

#To use the imported shapefile in ggmap, we need the fortify() function of the ggplot2 package.
sweden_fort <- ggplot2::fortify(sweden)

base_map <- ggplot(data = sweden_fort, mapping = aes(x=long, y=lat, group=group))  
  geom_polygon(color = "black", fill = "white")  
  coord_quickmap()  
  theme_void()

base_map

我希望有人能幫幫我,如果有什么不清楚或缺少資訊,我可以編輯我的帖子:)

非常感謝。

uj5u.com熱心網友回復:

如果我是你,我會使用sf物件,即在sweden地圖中讀取st_read()而不是readOGR()直接使用然后使用fortify(). 這將讓您使用geom_sf()而不是geom_polygon(). 此外,您應該簡化sweden您正在使用的 shapefile。你指的那個很詳細,也就是很多行。如果您嘗試在影片中使用它,渲染將花費數小時和數小時。您可以大大簡化它,而不會丟失情節的相關細節。也將其創建df為一個sf物件——一個由長/緯度點而不是線組成的物件——然后你就可以開始了。

所以,使用你的df上面和你指向的瑞典地圖,

library(tidyverse)
library(sf)
library(here)

#map source: https://www.geoboundaries.org/data/1_3_3/zip/shapefile/

## Simplify the map for quicker rendering 
sweden <- st_read(here("data", "SWE_ADM0", "SWE_ADM0.shp"), 
                  layer = "SWE_ADM0") |> 
  st_simplify(dTolerance = 1e3)
#> Reading layer `SWE_ADM0' from data source `scratch/data/SWE_ADM0/SWE_ADM0.shp' using driver `ESRI Shapefile'
#> Simple feature collection with 1 feature and 8 fields
#> Geometry type: MULTIPOLYGON
#> Dimension:     XY
#> Bounding box:  xmin: 10.98139 ymin: 55.33695 xmax: 24.16663 ymax: 69.05997
#> Geodetic CRS:  WGS 84


df <- structure(list(lat = c("65", "64", "65", "59", "59", "57", "57", 
"68", "67", "63", "60", "61", "65", "59", "56", "65", "59", "57", 
"55", "59", "56", "56", "59", "60", "59", "55", "59", "59", "57", 
"55", "56", "57", "65", "59", "63", "59", "56", "59", "56", "56", 
"57", "63", "58", "59", "63", "61", "55", "58", "66", "57"), 
    long = c("21", "17", "21", "14", "14", "13", "12", "18", 
    "18", "20", "16", "14", "17", "16", "12", "16", "15", "14", 
    "12", "17", "12", "16", "18", "14", "14", "14", "18", "17", 
    "12", "13", "12", "12", "21", "13", "19", "16", "12", "18", 
    "16", "12", "12", "18", "12", "17", "20", "17", "12", "13", 
    "19", "12"), date = c("2009-03-29", "2006-04-06", "2019-03-31", 
    "2006-04-04", "1975-04-13", "2014-02-05", "1996-04-02", "2021-04-08", 
    "1995-04-12", "2004-04-12", "2018-04-07", "2021-03-28", "1988-04-01", 
    "2002-03-17", "2015-03-12", "2019-04-05", "2016-03-19", "2021-04-03", 
    "2014-02-08", "2015-03-13", "2021-03-09", "2005-02-07", "2013-03-31", 
    "1989-03-23", "1989-03-27", "2015-01-21", "2011-04-04", "2018-03-26", 
    "1987-03-23", "2011-01-31", "2014-02-09", "2004-01-17", "2012-04-20", 
    "2017-03-07", "2005-04-02", "2017-01-28", "2016-03-19", "1984-03-30", 
    "2005-01-29", "2021-03-06", "2008-02-03", "2017-03-22", "2019-03-10", 
    "2010-01-17", "2009-04-10", "2016-01-23", "2019-03-01", "2006-03-04", 
    "2014-04-23", "2009-03-15"), julian_day = c("88", "96", "90", 
    "94", "103", "36", "93", "98", "102", "103", "97", "87", 
    "92", "76", "71", "95", "79", "93", "39", "72", "68", "38", 
    "90", "82", "86", "21", "94", "85", "82", "31", "40", "17", 
    "111", "66", "92", "28", "79", "90", "29", "65", "34", "81", 
    "69", "17", "100", "23", "60", "63", "113", "74"), year = c(2009L, 
    2006L, 2019L, 2006L, 1975L, 2014L, 1996L, 2021L, 1995L, 2004L, 
    2018L, 2021L, 1988L, 2002L, 2015L, 2019L, 2016L, 2021L, 2014L, 
    2015L, 2021L, 2005L, 2013L, 1989L, 1989L, 2015L, 2011L, 2018L, 
    1987L, 2011L, 2014L, 2004L, 2012L, 2017L, 2005L, 2017L, 2016L, 
    1984L, 2005L, 2021L, 2008L, 2017L, 2019L, 2010L, 2009L, 2016L, 
    2019L, 2006L, 2014L, 2009L), lat_grouped = c("3", "2", "3", 
    "1", "1", "1", "1", "3", "3", "2", "2", "2", "3", "1", "1", 
    "3", "1", "1", "1", "1", "1", "1", "1", "2", "1", "1", "1", 
    "1", "1", "1", "1", "1", "3", "1", "2", "1", "1", "1", "1", 
    "1", "1", "2", "1", "1", "2", "2", "1", "1", "3", "1")), row.names = c(22330L, 
15394L, 44863L, 15258L, 1481L, 31695L, 6399L, 52043L, 6111L, 
11508L, 42184L, 51391L, 4308L, 8764L, 34675L, 45080L, 37042L, 
51743L, 31717L, 34723L, 50514L, 11892L, 30527L, 4572L, 4608L, 
33744L, 26476L, 41366L, 4006L, 25265L, 31741L, 10122L, 29059L, 
38340L, 12787L, 37827L, 37061L, 3029L, 11762L, 50464L, 18114L, 
39026L, 43835L, 23081L, 22811L, 36179L, 43641L, 13743L, 33608L, 
21917L), class = "data.frame")

## Convert the given sample data to an `sf` object of points, setting
## the coordinate system to be the same as the `sweden` map 
df <- df |> 
  mutate(id = 1:nrow(df), 
         date = lubridate::ymd(date), 
         year = factor(lubridate::year(date))) |> 
  st_as_sf(coords = c("long", "lat"), crs = 4326)

# Subset the data to the years to you want, and create the plot
df_selected <- df |> 
  filter(year %in% c(1975, 1989, 2016, 2021))

ggplot()   
  geom_sf(data = sweden)   
  geom_sf(data = df_selected, 
                mapping = aes(color = lat_grouped))   
  
  facet_grid(lat_grouped ~ year)   
  guides(color = "none")

在R中映射多個密度隨時間變化的地圖

您可以設定例如theme_void()或地圖主題以擺脫網格線等。

更新:最后一次編輯,只是關于繪制密度的問題。計算累積資料后,您可以例如使用 2D 內核密度估計覆寫您的地圖。例如,這是一個非常粗略的第一次切割,按緯度組刻面。

ggplot()   
  geom_sf(data = sweden)   
  geom_density_2d_filled(data = df, 
                  mapping = aes(x = map_dbl(geometry, ~.[1]),
                                 y = map_dbl(geometry, ~.[2])),
                  alpha = 0.4)   
  facet_wrap(~ lat_grouped)

在R中映射多個密度隨時間變化的地圖

這里的map_dbl()函式(來自purrr包)是一種進入幾何列df并首先提取x(即經度)然后提取y(即緯度)資料的方法,以便給出geom_density_2d()計算其估計所需的坐標。

轉載請註明出處,本文鏈接:https://www.uj5u.com/yidong/482737.html

標籤:r ggplot2 地图 科幻 ggmap

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    掃碼投屏,開放網路,獨占設備,不需要額外下載軟體,微信掃碼,發現設備。支持標準DLNA協議,支持倍速播放。視頻,音頻,圖片投屏。好點意思。還支持自定義基于 DLNA 擴展的操作動作。好像要收費,沒體驗。 這里簡單記錄一下集成程序。 一 跟目錄的build.gradle添加私有mevan倉庫 mave ......

    uj5u.com 2020-09-10 07:01:43 more
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  • 歡迎頁輪播影片

    如圖,引導開始,球從上落下,同時淡入文字,然后文字開始輪播,最后一頁時停止,點擊進入首頁。 在來看看效果圖。 重力球先不講,主要歡迎輪播簡單實作 首先新建一個類 TextTranslationXGuideView,用于影片展示 文本是類似的,最后會有個圖片箭頭影片,布局很簡單,就是一個 TextVi ......

    uj5u.com 2023-04-20 08:40:31 more
  • 【FAQ】關于華為推送服務因營銷訊息頻次管控導致服務通訊類訊息

    一. 問題描述 使用華為推送服務下發IM訊息時,下發訊息請求成功且code碼為80000000,但是手機總是收不到訊息; 在華為推送自助分析(Beta)平臺查看發現,訊息發送觸發了頻控。 二. 問題原因及背景 2023年1月05日起,華為推送服務對咨詢營銷類訊息做了單個設備每日推送數量上限管理,具體 ......

    uj5u.com 2023-04-20 08:40:11 more
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    uj5u.com 2023-04-20 08:39:13 more
  • iOS從UI記憶體地址到讀取成員變數(oc/swift)

    開發除錯時,我們發現bug時常首先是從UI顯示發現例外,下一步才會去定位UI相關連的資料的。XCode有給我們提供一系列debug工具,但是很多人可能還沒有形成一套穩定的除錯流程,因此本文嘗試解決這個問題,順便提出一個暴論:UI顯示例外問題只需要兩個步驟就能完成定位作業的80%: 定位例外 UI 組 ......

    uj5u.com 2023-04-19 09:16:23 more
  • FIDE重磅更新!性能飛躍!體驗有禮!

    FIDE 開發者工具重構升級啦!實作500%性能提升,誠邀體驗! 一直以來不少開發者朋友在社區反饋,在使用 FIDE 工具的程序中,時常會遇到諸如加載不及時、代碼預覽/渲染性能不如意的情況,十分影響開發體驗。 作為技術團隊,我們深知一件趁手的開發工具對開發者的重要性,因此,在2023年開年,FinC ......

    uj5u.com 2023-04-19 09:16:15 more
  • 游戲內嵌社區服務開放,助力開發者提升玩家互動與留存

    華為 HMS Core 游戲內嵌社區服務提供快速訪問華為游戲中心論壇能力,支持玩家直接在游戲內瀏覽帖子和交流互動,助力開發者擴展內容生產和觸達的場景。 一、為什么要游戲內嵌社區? 二、游戲內嵌社區的典型使用場景 1、游戲內打開論壇 您可以在游戲內繪制論壇入口,為玩家提供沉浸式發帖、瀏覽、點贊、回帖、 ......

    uj5u.com 2023-04-19 09:15:46 more
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