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R:是否有更好的方法將grepl()應用于跨多列的多個元素的向量?

2021-10-27 14:45:10 軟體設計

我正在處理一個資料集,該資料集顯示每年存在哪些變數。我需要一個函式來指定特定年份,然后回傳所有這些年份中出現的變數。換句話說,如果指定年份“70”和“90”,我希望函式在兩年中找到所有帶有變數的行(基于變數名,而不是列名)。

這篇文章給了我將所有年份列粘貼在一起的想法,所以我只需要將 grepl() 應用于一列。正如你在下面看到的,我能找到匹配所有年份的唯一方法是運行for回圈兩次,一次是識別年份中的任何匹配,第二次是洗掉任何非匹配。有沒有更簡單的方法來做到這一點?
我對 R 比較陌生(這是我在這里的第一篇文章!)所以我很感激任何想法。

# testing data frame (actual data has many more items and years)
item <- c("ABC", "DEF", "GHI", "JKL", "MNO", "PQR", "STU")
x1970 <- c("abc70", "70def", "gh70i", "jkl70", "", "70pqr", "stu70x")
x1980 <- c("abc80", "80def", "", "", "", "80pqr", "stu80x")
x1990 <- c("abc90", "90def", "", "", "90mno90", "90pqr", "")
x2000 <- c("", "00def", "gh00i", "jkl00", "00mno00", "00pqr", "")
df <- data.frame(item, x1970, x1980, x1990, x2000)

df
  item  x1970  x1980   x1990   x2000
1  ABC  abc70  abc80   abc90        
2  DEF  70def  80def   90def   00def
3  GHI  gh70i                  gh00i
4  JKL  jkl70                  jkl00
5  MNO               90mno90 00mno00
6  PQR  70pqr  80pqr   90pqr   00pqr
7  STU stu70x stu80x 

year_filter_test <- function(data, year)
{
  # paste all year columns together in "search_columns" so I can apply grepl() to that one column
  data2 <- data %>% mutate(search_columns = paste(x1970, x1980, x1990, x2000) )
  
  # create "include" column which will be TRUE if I want to include this row
  data2$include <- rep( "", nrow(data2))
  
  # loop through each year, making include column TRUE if there's a match on ANY year
  for (i in year)
  { data2$include [ grepl(i, data2$search_columns) ] <- TRUE
  }
  
  # loop through each year again, making include column FALSE if there's NOT a match on ANY year
  # the effect of these two loops is to only include columns that match ALL years
  for (i in year)
  { data2$include [ !grepl(i, data2$search_columns) ] <- FALSE
  }
      
  selected.years <- data2 %>% filter(include==TRUE)
  return(selected.years)
}

uj5u.com熱心網友回復:

像這樣的東西?

library(dplyr)
library(tidyr)

my_function <- function(df, x){
  df %>% 
    pivot_longer(
      cols=-item
    ) %>% 
    mutate(year = parse_number(value)) %>% 
    pivot_wider(
      names_from = name
    ) %>% 
    filter(year == {{x}})
}

my_function(df, c("70", "90"))
  item   year x1970 x1980 x1990   x2000
  <chr> <dbl> <chr> <chr> <chr>   <chr>
1 ABC      70 abc70 NA    NA      NA   
2 DEF      70 70def NA    NA      NA   
3 GHI      70 gh70i NA    NA      NA   
4 MNO      90 NA    NA    90mno90 NA   
5 PQR      90 NA    NA    90pqr   NA   

uj5u.com熱心網友回復:

使用 across

library(dplyr)
library(stringr)
my_func <- function(dat, years) {
dat %>%
  filter(across(num_range('x', years), ~ str_remove_all(., "\\d ") == tolower(item)))
 
}

-測驗

> my_func(df, c('1970', "1990"))
  item x1970 x1980 x1990 x2000
1  ABC abc70 abc80 abc90      
2  DEF 70def 80def 90def 00def
3  PQR 70pqr 80pqr 90pqr 00pqr

uj5u.com熱心網友回復:

我們可以用dplyr用rowwiseif_all以及stringr::str_detect

library(dplyr)
library(stringr)

my_func<-function(df, years){
  df%>%
    rowwise()%>%
    mutate(index=if_all(num_range('x', years), ~str_detect(tolower(.x), tolower(item))))
}

my_func(df, c(1970, 1990))

# A tibble: 7 × 6
# Rowwise: 
  item  x1970    x1980    x1990     x2000     index
  <chr> <chr>    <chr>    <chr>     <chr>     <lgl>
1 ABC   "abc70"  "abc80"  "abc90"   ""        TRUE 
2 DEF   "70def"  "80def"  "90def"   "00def"   TRUE 
3 GHI   "gh70i"  ""       ""        "gh00i"   FALSE
4 JKL   "jkl70"  ""       ""        "jkl00"   FALSE
5 MNO   ""       ""       "90mno90" "00mno00" FALSE
6 PQR   "70pqr"  "80pqr"  "90pqr"   "00pqr"   TRUE 
7 STU   "stu70x" "stu80x" ""        ""        FALSE

我們可以輕松地使用新的邏輯列來執行過濾操作。

如果我們想直接過濾,我們可以修改函式:

my_filter<-function(df, years){
  df%>%
    rowwise()%>%
    filter(if_all(num_range('x', years), ~str_detect(tolower(.x), tolower(item))))
}

my_filter(df=df, years=c(1970, 1990))

# A tibble: 3 × 5
# Rowwise: 
  item  x1970 x1980 x1990 x2000  
  <chr> <chr> <chr> <chr> <chr>  
1 ABC   abc70 abc80 abc90 ""     
2 DEF   70def 80def 90def "00def"
3 PQR   70pqr 80pqr 90pqr "00pqr"

uj5u.com熱心網友回復:

這有點不清楚,但聽起來您希望將 data.frame 中的值與包含年份的最后 2 位數字的函式相匹配,而不是查看也包含年份的列名。

如果這是正確的,您可以使用rowSums為給定行中的字符值找到的部分匹配項相加。如果總和與您要搜索的“年”數相同,則該行將保留在您的過濾器中。

library(tidyverse)

year_filter <- function(data, years) {
  data %>%
    filter(rowSums(
      sapply(select(., starts_with("x")),
             function(x) grepl(paste(years, collapse = "|"), x))
    ) == length(years))
}
  
year_filter(df, c("70", "90"))

輸出

  item x1970 x1980 x1990 x2000
1  ABC abc70 abc80 abc90      
2  DEF 70def 80def 90def 00def
3  PQR 70pqr 80pqr 90pqr 00pqr

編輯:鑒于每年可能有多個列,應在函式中考慮列年份。

這是一個替代方案。首先,允許函式使用完整的 4 位數年份,并創建一個變數來存盤最后 2 位數以進行搜索。

將您的資料放入長格式,并從列名中提取年份(這樣 1970.a 和 1970.b 將被視為 1970)。

然后,按 data.frame 的每一行分組,首先通過包含與年份的最后 2 位數字匹配的匹配項進行過濾,然后確保在該行中找到所有年份。最后,您將根據過濾器后剩余的資料回傳行號。

year_filter <- function(data, years) {
  last2dig_yrs <- substr(years, nchar(years) - 1, nchar(years))
  match_rows <- data %>%
    mutate(rn = row_number()) %>%
    pivot_longer(cols = -c(item, rn)) %>%
    mutate(year = parse_number(name)) %>%
    group_by(rn) %>%
    filter(grepl(paste(last2dig_yrs, collapse = "|"), value)) %>%
    filter(all(years %in% year)) %>%
    distinct(rn) %>%
    pull(rn)
  return(data[match_rows,])
}

我用 1970.a 和 1970.b 列創建了示例資料。

示例資料

df <- structure(list(item = c("ABC", "DEF", "GHI", "JKL", "MNO", "PQR", 
"STU"), x1970.a = c("abc70", "70def", "gh70i", "jkl70", "", "70pqr", 
"stu70x"), x1970.b = c("zxc70", "def", "gh70i", "70d", "70x", 
"", "stu70x"), x1980 = c("abc80", "80def", "", "", "", "80pqr", 
"stu80x"), x1990 = c("abc90", "90def", "", "", "90mno90", "90pqr", 
""), x2000 = c("", "00def", "gh00i", "jkl00", "00mno00", "00pqr", 
"")), class = "data.frame", row.names = c(NA, -7L))

year_filter(df, c("1970", "1990"))

輸出

  item x1970.a x1970.b x1980   x1990   x2000
1  ABC   abc70   zxc70 abc80   abc90        
2  DEF   70def     def 80def   90def   00def
5  MNO             70x       90mno90 00mno00
6  PQR   70pqr         80pqr   90pqr   00pqr

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